HEATR1

HEATR1
Ідентифікатори
Символи	HEATR1, BAP28, UTP10, HEAT repeat containing 1
Зовнішні ІД	MGI: 2442524 HomoloGene: 34562 GeneCards: HEATR1
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • snoRNA binding • RNA binding Клітинна компонента • small-subunit processome • мембрана • мітохондрія • 90S preribosome • t-UTP complex • нуклеоплазма • fibrillar center • клітинне ядро • ядерце Біологічний процес • maturation of SSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) • ribosome biogenesis • rRNA processing • positive regulation of rRNA processing • transcription, DNA-templated • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • positive regulation of transcription by RNA polymerase I Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	55127	217995
Ensembl	ENSG00000119285	ENSMUSG00000050244
UniProt	Q9H583	G3X9B1
RefSeq (мРНК)	NM_018072	NM_144835
RefSeq (білок)	NP_060542 NP_060542.4	NP_659084
Локус (UCSC)	Хр. 1: 236.55 – 236.6 Mb	Хр. 13: 12.41 – 12.46 Mb
PubMed search	[1]	[2]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

HEATR1 (англ. HEAT repeat containing 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 144 амінокислот, а молекулярна маса — 242 370^[4].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MTSLAQQLQR		LALPQSDASL		LSRDEVASLL		FDPKEAATID		RDTAFAIGCT
GLEELLGIDP		SFEQFEAPLF		SQLAKTLERS		VQTKAVNKQL		DENISLFLIH
LSPYFLLKPA		QKCLEWLIHR		FHIHLYNQDS		LIACVLPYHE		TRIFVRVIQL
LKINNSKHRW		FWLLPVKQSG		VPLAKGTLIT		HCYKDLGFMD		FICSLVTKSV
KVFAEYPGSS		AQLRVLLAFY		ASTIVSALVA		AEDVSDNIIA		KLFPYIQKGL
KSSLPDYRAA		TYMIICQISV		KVTMENTFVN		SLASQIIKTL		TKIPSLIKDG
LSCLIVLLQR		QKPESLGKKP		FPHLCNVPDL		ITILHGISET		YDVSPLLHYM
LPHLVVSIIH		HVTGEETEGM		DGQIYKRHLE		AILTKISLKN		NLDHLLASLL
FEEYISYSSQ		EEMDSNKVSL		LNEQFLPLIR		LLESKYPRTL		DVVLEEHLKE
IADLKKQELF		HQFVSLSTSG		GKYQFLADSD		TSLMLSLNHP		LAPVRILAMN
HLKKIMKTSK		EGVDESFIKE		AVLARLGDDN		IDVVLSAISA		FEIFKEHFSS
EVTISNLLNL		FQRAELSKNG		EWYEVLKIAA		DILIKEEILS		ENDQLSNQVV
VCLLPFMVIN		NDDTESAEMK		IAIYLSKSGI		CSLHPLLRGW		EEALENVIKS
TKPGKLIGVA		NQKMIELLAD		NINLGDPSSM		LKMVEDLISV		GEEESFNLKQ
KVTFHVILSV		LVSCCSSLKE		THFPFAIRVF		SLLQKKIKKL		ESVITAVEIP
SEWHIELMLD		RGIPVELWAH		YVEELNSTQR		VAVEDSVFLV		FSLKKFIYAL
KAPKSFPKGD		IWWNPEQLKE		DSRDYLHLLI		GLFEMMLNGA		DAVHFRVLMK
LFIKVHLEDV		FQLFKFCSVL		WTYGSSLSNP		LNCSVKTVLQ		TQALYVGCAM
LSSQKTQCKH		QLASISSPVV		TSLLINLGSP		VKEVRRAAIQ		CLQALSGVAS
PFYLIIDHLI		SKAEEITSDA		AYVIQDLATL		FEELQREKKL		KSHQKLSETL
KNLLSCVYSC		PSYIAKDLMK		VLQGVNGEMV		LSQLLPMAEQ		LLEKIQKEPT
AVLKDEAMVL		HLTLGKYNEF		SVSLLNEDPK		SLDIFIKAVH		TTKELYAGMP
TIQITALEKI		TKPFFAAISD		EKVQQKLLRM		LFDLLVNCKN		SHCAQTVSSV
FKGISVNAEQ		VRIELEPPDK		AKPLGTVQQK		RRQKMQQKKS		QDLESVQEVG
GSYWQRVTLI		LELLQHKKKL		RSPQILVPTL		FNLLSRCLEP		LPQEQGNMEY
TKQLILSCLL		NICQKLSPDG		GKIPKDILDE		EKFNVELIVQ		CIRLSEMPQT
HHHALLLLGT		VAGIFPDKVL		HNIMSIFTFM		GANVMRLDDT		YSFQVINKTV
KMVIPALIQS		DSGDSIEVSR		NVEEIVVKII		SVFVDALPHV		PEHRRLPILV
QLVDTLGAEK		FLWILLILLF		EQYVTKTVLA		AAYGEKDAIL		EADTEFWFSV
CCEFSVQHQI		QSLMNILQYL		LKLPEEKEET		IPKAVSFNKS		ESQEEMLQVF
NVETHTSKQL		RHFKFLSVSF		MSQLLSSNNF		LKKVVESGGP		EILKGLEERL
LETVLGYISA		VAQSMERNAD		KLTVKFWRAL		LSKAYDLLDK		VNALLPTETF
IPVIRGLVGN		PLPSVRRKAL		DLLNNKLQQN		ISWKKTIVTR		FLKLVPDLLA
IVQRKKKEGE		EEQAINRQTA		LYTLKLLCKN		FGAENPDPFV		PVLNTAVKLI
APERKEEKNV		LGSALLCIAE		VTSTLEALAI		PQLPSLMPSL		LTTMKNTSEL
VSSEVYLLSA		LAALQKVVET		LPHFISPYLE		GILSQVIHLE		KITSEMGSAS
QANIRLTSLK		KTLATTLAPR		VLLPAIKKTY		KQIEKNWKNH		MGPFMSILQE
HIGVMKKEEL		TSHQSQLTAF		FLEALDFRAQ		HSENDLEEVG		KTENCIIDCL
VAMVVKLSEV		TFRPLFFKLF		DWAKTEDAPK		DRLLTFYNLA		DCIAEKLKGL
FTLFAGHLVK		PFADTLNQVN		ISKTDEAFFD		SENDPEKCCL		LLQFILNCLY
KIFLFDTQHF		ISKERAEALM		MPLVDQLENR		LGGEEKFQER		VTKHLIPCIA
QFSVAMADDS		LWKPLNYQIL		LKTRDSSPKV		RFAALITVLA		LAEKLKENYI
VLLPESIPFL		AELMEDECEE		VEHQCQKTIQ		QLETVLGEPL		QSYF

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рибонуклеопротеїнів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, процесинг рРНК, біогенез рибосом, поліморфізм, ацетиляція. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Prieto J.L., McStay B. (2007). Recruitment of factors linking transcription and processing of pre-rRNA to NOR chromatin is UBF-dependent and occurs independent of transcription in human cells. Genes Dev. 21: 2041—2054. PMID 17699751 DOI:10.1101/gad.436707

Примітки

1. Human PubMed Reference:.
2. Mouse PubMed Reference:.
3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:25517 (англ.) . Архів оригіналу за 12 березня 2016. Процитовано 28 серпня 2017. [Архівовано 2016-03-12 у Wayback Machine.]
4. UniProt, Q9H583 (англ.) . Архів оригіналу за 6 грудня 2016. Процитовано 28 серпня 2017.

Див. також

• Хромосома 1

Портал «Біологія»   Портал «Хімія»