HECW1

HECW1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3L4H
Ідентифікатори
Символи	HECW1, NEDL1, HECT, C2 and WW domain containing E3 ubiquitin protein ligase 1
Зовнішні ІД	OMIM: 610384 MGI: 2444115 HomoloGene: 9004 GeneCards: HECW1
Пов'язані генетичні захворювання
хвороба Альцгеймера, ожиріння[1]
Онтологія гена Молекулярна функція • transferase activity • GO:0050372 ubiquitin-protein transferase activity • GO:1904264, GO:1904822, GO:0090622, GO:0090302 ubiquitin protein ligase activity Клітинна компонента • гіалоплазма • цитоплазма Біологічний процес • negative regulation of canonical Wnt signaling pathway • Убіквітин-залежний протеоліз • proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process • protein polyubiquitination • ubiquitin-dependent protein catabolic process • GO:1903364 positive regulation of protein catabolic process • regulation of dendrite morphogenesis • negative regulation of sodium ion transmembrane transporter activity Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	23072	94253
Ensembl	ENSG00000002746	ENSMUSG00000021301
UniProt	Q76N89	Q8K4P8
RefSeq (мРНК)	NM_001287059 NM_015052	NM_001081348 NM_153130 NM_178809
RefSeq (білок)	NP_001273988 NP_055867	NP_001074817
Локус (UCSC)	Хр. 7: 43.11 – 43.57 Mb	Хр. 13: 14.4 – 14.7 Mb
PubMed search	[2]	[3]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

HECW1 (англ. HECT, C2 and WW domain containing E3 ubiquitin protein ligase 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 606 амінокислот, а молекулярна маса — 179 554^[5].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MLLHLCSVKN		LYQNRFLGLA		AMASPSRNSQ		SRRRCKEPLR		YSYNPDQFHN
MDLRGGPHDG		VTIPRSTSDT		DLVTSDSRST		LMVSSSYYSI		GHSQDLVIHW
DIKEEVDAGD		WIGMYLIDEV		LSENFLDYKN		RGVNGSHRGQ		IIWKIDASSY
FVEPETKICF		KYYHGVSGAL		RATTPSVTVK		NSAAPIFKSI		GADETVQGQG
SRRLISFSLS		DFQAMGLKKG		MFFNPDPYLK		ISIQPGKHSI		FPALPHHGQE
RRSKIIGNTV		NPIWQAEQFS		FVSLPTDVLE		IEVKDKFAKS		RPIIKRFLGK
LSMPVQRLLE		RHAIGDRVVS		YTLGRRLPTD		HVSGQLQFRF		EITSSIHPDD
EEISLSTEPE		SAQIQDSPMN		NLMESGSGEP		RSEAPESSES		WKPEQLGEGS
VPDGPGNQSI		ELSRPAEEAA		VITEAGDQGM		VSVGPEGAGE		LLAQVQKDIQ
PAPSAEELAE		QLDLGEEASA		LLLEDGEAPA		STKEEPLEEE		ATTQSRAGRE
EEEKEQEEEG		DVSTLEQGEG		RLQLRASVKR		KSRPCSLPVS		ELETVIASAC
GDPETPRTHY		IRIHTLLHSM		PSAQGGSAAE		EEDGAEEEST		LKDSSEKDGL
SEVDTVAADP		SALEEDREEP		EGATPGTAHP		GHSGGHFPSL		ANGAAQDGDT
HPSTGSESDS		SPRQGGDHSC		EGCDASCCSP		SCYSSSCYST		SCYSSSCYSA
SCYSPSCYNG		NRFASHTRFS		SVDSAKISES		TVFSSQDDEE		EENSAFESVP
DSMQSPELDP		ESTNGAGPWQ		DELAAPSGHV		ERSPEGLESP		VAGPSNRREG
ECPILHNSQP		VSQLPSLRPE		HHHYPTIDEP		LPPNWEARID		SHGRVFYVDH
VNRTTTWQRP		TAAATPDGMR		RSGSIQQMEQ		LNRRYQNIQR		TIATERSEED
SGSQSCEQAP		AGGGGGGGSD		SEAESSQSSL		DLRREGSLSP		VNSQKITLLL
QSPAVKFITN		PEFFTVLHAN		YSAYRVFTSS		TCLKHMILKV		RRDARNFERY
QHNRDLVNFI		NMFADTRLEL		PRGWEIKTDQ		QGKSFFVDHN		SRATTFIDPR
IPLQNGRLPN		HLTHRQHLQR		LRSYSAGEAS		EVSRNRGASL		LARPGHSLVA
AIRSQHQHES		LPLAYNDKIV		AFLRQPNIFE		MLQERQPSLA		RNHTLREKIH
YIRTEGNHGL		EKLSCDADLV		ILLSLFEEEI		MSYVPLQAAF		HPGYSFSPRC
SPCSSPQNSP		GLQRASARAP		SPYRRDFEAK		LRNFYRKLEA		KGFGQGPGKI
KLIIRRDHLL		EGTFNQVMAY		SRKELQRNKL		YVTFVGEEGL		DYSGPSREFF
FLLSQELFNP		YYGLFEYSAN		DTYTVQISPM		SAFVENHLEW		FRFSGRILGL
ALIHQYLLDA		FFTRPFYKAL		LRLPCDLSDL		EYLDEEFHQS		LQWMKDNNIT
DILDLTFTVN		EEVFGQVTER		ELKSGGANTQ		VTEKNKKEYI		ERMVKWRVER
GVVQQTEALV		RGFYEVVDSR		LVSVFDAREL		ELVIAGTAEI		DLNDWRNNTE
YRGGYHDGHL		VIRWFWAAVE		RFNNEQRLRL		LQFVTGTSSV		PYEGFAALRG
SNGLRRFCIE		KWGKITSLPR		AHTCFNRLDL		PPYPSYSMLY		EKLLTAVEET
STFGLE

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як убіквітинування білків, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

1. Захворювання, генетично пов'язані з HECW1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
2. Human PubMed Reference:.
3. Mouse PubMed Reference:.
4. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:22195 (англ.) . Процитовано 7 вересня 2017.
5. UniProt, Q76N89 (англ.) . Архів оригіналу за 4 червня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.

Див. також

• Хромосома 7

Портал «Біологія»   Портал «Хімія»