HLA-DMA

HLA-DMA
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1HDM, 2BC4, 4FQX, 4GBX
Ідентифікатори
Символи	HLA-DMA, D6S222E, DMA, HLADM, RING6, major histocompatibility complex, class II, DM alpha
Зовнішні ІД	OMIM: 142855 MGI: 95921 HomoloGene: 4464 GeneCards: HLA-DMA
Онтологія гена Молекулярна функція • MHC class II protein complex binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • integral component of membrane • cell surface • ендосома • лізосома • екзосома • late endosome membrane • мембрана • lysosomal membrane • MHC class II protein complex • внутрішньоклітинна мембранна органела Біологічний процес • antigen processing and presentation of peptide or polysaccharide antigen via MHC class II • peptide antigen assembly with MHC class II protein complex • antigen processing and presentation • antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class II • GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь • процес імунної системи • адаптивна імунна відповідь Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	3108	14998
Ensembl	ENSG00000243215 ENSG00000243719 ENSG00000239463 ENSG00000204257 ENSG00000242361 ENSG00000241394 ENSG00000243189 ENSG00000242685	ENSMUSG00000037649
UniProt	P28067	P28078 Q31621
RefSeq (мРНК)	NM_006120	NM_010386 NM_001360530
RefSeq (білок)	н/д	NP_034516 NP_001347459
Локус (UCSC)	Хр. 6: 32.95 – 32.97 Mb	Хр. 17: 34.34 – 34.36 Mb
PubMed search	[1]	[2]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

HLA-DMA (англ. HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 261 амінокислот, а молекулярна маса — 29 194^[4].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MGHEQNQGAA		LLQMLPLLWL		LPHSWAVPEA		PTPMWPDDLQ		NHTFLHTVYC
QDGSPSVGLS		EAYDEDQLFF		FDFSQNTRVP		RLPEFADWAQ		EQGDAPAILF
DKEFCEWMIQ		QIGPKLDGKI		PVSRGFPIAE		VFTLKPLEFG		KPNTLVCFVS
NLFPPMLTVN		WHDHSVPVEG		FGPTFVSAVD		GLSFQAFSYL		NFTPEPSDIF
SCIVTHEIDR		YTAIAYWVPR		NALPSDLLEN		VLCGVAFGLG		VLGIIVGIVL
IIYFRKPCSG		D

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі, як імунітет. Локалізований у мембрані, лізосомі, ендосомах.

Література

• Kelly A.P., Monaco J.J., Cho S., Trowsdale J. (1991). A new human HLA class II-related locus, DM. Nature. 353: 571—573. PMID 1922365 DOI:10.1038/353571a0
• Sanderson F., Powis S.H., Kelly A.P., Trowsdale J. (1994). Limited polymorphism in HLA-DM does not involve the peptide binding groove. Immunogenetics. 39: 56—58. PMID 8225438 DOI:10.1007/BF00171797
• Carrington M., Harding A. (1994). Sequence analysis of two novel HLA-DMA alleles. Immunogenetics. 40: 165—165. PMID 8026867 DOI:10.1007/BF00188184
• Weber D.A., Evavold B.D., Jensen P.E. (1996). Enhanced dissociation of HLA-DR-bound peptides in the presence of HLA-DM. Science. 274: 618—620. PMID 8849454 DOI:10.1126/science.274.5287.618
• Mosyak L., Zaller D.M., Wiley D.C. (1998). The structure of HLA-DM, the peptide exchange catalyst that loads antigen onto class II MHC molecules during antigen presentation. Immunity. 9: 377—383. PMID 9768757 DOI:10.1016/S1074-7613(00)80620-2

Примітки

1. Human PubMed Reference:.
2. Mouse PubMed Reference:.
3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4934 (англ.) . Архів оригіналу за 17 жовтня 2015. Процитовано 6 вересня 2017. [Архівовано 2015-10-17 у Wayback Machine.]
4. UniProt, P28067 (англ.) . Архів оригіналу за 18 вересня 2017. Процитовано 6 вересня 2017.

Див. також

• Хромосома 6

Портал «Біологія»   Портал «Хімія»