HNRNPAB

HNRNPAB
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3S7R
Ідентифікатори
Символи	HNRNPAB, ABBP1, HNRPAB, heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A/B
Зовнішні ІД	OMIM: 602688 MGI: 1330294 HomoloGene: 74950 GeneCards: HNRNPAB
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • nucleic acid binding • sequence-specific DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • mRNA binding • RNA binding • sequence-specific double-stranded DNA binding Клітинна компонента • цитоплазма • RNA polymerase II transcription regulator complex • клітинне ядро • нуклеоплазма • Рибонуклеопротеїни Біологічний процес • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • Епітеліально-мезенхімальний перехід Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	3182	15384
Ensembl	ENSG00000197451	ENSMUSG00000020358
UniProt	Q99729	Q99020
RefSeq (мРНК)	NM_031266 NM_004499	NM_001048061 NM_010448
RefSeq (білок)	NP_004490 NP_112556	NP_001041526 NP_034578
Локус (UCSC)	Хр. 5: 178.2 – 178.21 Mb	Хр. 11: 51.49 – 51.5 Mb
PubMed search	[1]	[2]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

HNRNPAB (англ. Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A/B) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 332 амінокислот, а молекулярна маса — 36 225^[4].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSEAGEEQPM		ETTGATENGH		EAVPEASRGR		GWTGAAAGAG		GATAAPPSGN
QNGAEGDQIN		ASKNEEDAGK		MFVGGLSWDT		SKKDLKDYFT		KFGEVVDCTI
KMDPNTGRSR		GFGFILFKDA		ASVEKVLDQK		EHRLDGRVID		PKKAMAMKKD
PVKKIFVGGL		NPESPTEEKI		REYFGEFGEI		EAIELPMDPK		LNKRRGFVFI
TFKEEEPVKK		VLEKKFHTVS		GSKCEIKVAQ		PKEVYQQQQY		GSGGRGNRNR
GNRGSGGGGG		GGGQSQSWNQ		GYGNYWNQGY		GYQQGYGPGY		GGYDYSPYGY
YGYGPGYDYS		QGSTNYGKSQ		RRGGHQNNYK		PY

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• Khan F., Jaiswal A.K., Szer W. (1991). Cloning and sequence analysis of a human type A/B hnRNP protein. FEBS Lett. 290: 159—161. PMID 1717314 DOI:10.1016/0014-5793(91)81249-8
• Lau P.P., Zhu H.J., Nakamuta M., Chan L. (1997). Cloning of an Apobec-1-binding protein that also interacts with apolipoprotein B mRNA and evidence for its involvement in RNA editing. J. Biol. Chem. 272: 1452—1455. PMID 8999813 DOI:10.1074/jbc.272.3.1452
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Ong S.E., Mittler G., Mann M. (2004). Identifying and quantifying in vivo methylation sites by heavy methyl SILAC. Nat. Methods. 1: 119—126. PMID 15782174 DOI:10.1038/nmeth715
• Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240

Примітки

1. Human PubMed Reference:.
2. Mouse PubMed Reference:.
3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:5034 (англ.) . Процитовано 6 лютого 2017.
4. UniProt, Q99729 (англ.) . Архів оригіналу за 24 квітня 2017. Процитовано 6 лютого 2017.

Див. також

• Хромосома 5

Портал «Біологія»   Портал «Хімія»