HOGA1

HOGA1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3S5N, 3S5O
Ідентифікатори
Символи	HOGA1, C10orf65, DHDPS2, DHDPSL, HP3, NPL2, 4-hydroxy-2-oxoglutarate aldolase 1
Зовнішні ІД	OMIM: 613597 MGI: 1914682 HomoloGene: 12130 GeneCards: HOGA1
Онтологія гена Молекулярна функція • каталітична активність • protein homodimerization activity • lyase activity • 4-hydroxy-2-oxoglutarate aldolase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • мітохондрія • мітохондріальний матрикс Біологічний процес • обмін речовин • pyruvate biosynthetic process • 4-hydroxyproline catabolic process • glyoxylate catabolic process • oxalate metabolic process • glyoxylate metabolic process Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	112817	67432
Ensembl	ENSG00000241935	ENSMUSG00000025176
UniProt	Q86XE5	Q9DCU9
RefSeq (мРНК)	NM_138413 NM_001134670	NM_026152
RefSeq (білок)	NP_001128142 NP_612422	NP_080428
Локус (UCSC)	Хр. 10: 97.58 – 97.61 Mb	Хр. 19: 42.03 – 42.06 Mb
PubMed search	[1]	[2]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

HOGA1 (англ. 4-hydroxy-2-oxoglutarate aldolase 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 10-й хромосомі.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 327 амінокислот, а молекулярна маса — 35 249^[4].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MLGPQVWSSV		RQGLSRSLSR		NVGVWASGEG		KKVDIAGIYP		PVTTPFTATA
EVDYGKLEEN		LHKLGTFPFR		GFVVQGSNGE		FPFLTSSERL		EVVSRVRQAM
PKNRLLLAGS		GCESTQATVE		MTVSMAQVGA		DAAMVVTPCY		YRGRMSSAAL
IHHYTKVADL		SPIPVVLYSV		PANTGLDLPV		DAVVTLSQHP		NIVGMKDSGG
DVTRIGLIVH		KTRKQDFQVL		AGSAGFLMAS		YALGAVGGVC		ALANVLGAQV
CQLERLCCTG		QWEDAQKLQH		RLIEPNAAVT		RRFGIPGLKK		IMDWFGYYGG
PCRAPLQELS		PAEEEALRMD		FTSNGWL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до ліаз. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з Шиффовими основами. Локалізований у мітохондрії.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504

Примітки

1. Human PubMed Reference:.
2. Mouse PubMed Reference:.
3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:25155 (англ.) . Процитовано 19 вересня 2017.
4. UniProt, Q86XE5 (англ.) . Архів оригіналу за 5 листопада 2017. Процитовано 19 вересня 2017.

Див. також

• Хромосома 10

Портал «Біологія»   Портал «Хімія»