IKBKG

IKBKG
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2JVX, 2JVY, 3BRT, 3BRV, 3CL3, 3FX0, 4BWN, 5AAY
Ідентифікатори
Символи	IKBKG, AMCBX1, FIP-3, FIP3, Fip3p, IKK-gamma, IMD33, IP, IP1, IP2, IPD2, NEMO, ZC2HC9, IKKAP1, IKKG, inhibitor of kappa light polypeptide gene enhancer in B-cells, kinase gamma, inhibitor of nuclear factor kappa B kinase subunit gamma, EDAID1, inhibitor of nuclear factor kappa B kinase regulatory subunit gamma
Зовнішні ІД	OMIM: 300248 MGI: 1338074 HomoloGene: 2698 GeneCards: IKBKG
Пов'язані генетичні захворювання
	anhidrotic ectodermal dysplasia-immunodeficiency-osteopetrosis-lymphedema syndrome, X-linked mendelian susceptibility to mycobacterial diseases due to IKBKG deficiency, Hypohidrotic ectodermal dysplasia with immune deficiency
Онтологія гена
Молекулярна функція	• protein homodimerization activity; • protein domain specific binding; • signal transducer activity; • зв'язування з іоном металу; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • linear polyubiquitin binding; • ubiquitin protein ligase binding; • identical protein binding; • K63-linked polyubiquitin modification-dependent protein binding; • peroxisome proliferator activated receptor binding; • protein heterodimerization activity;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • spindle pole; • ubiquitin ligase complex; • внутрішньоклітинний; • IkappaB kinase complex; • mitotic spindle; • клітинне ядро; • гіалоплазма; • нуклеоплазма;
Біологічний процес	• GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • regulation of tumor necrosis factor-mediated signaling pathway; • response to virus; • stimulatory C-type lectin receptor signaling pathway; • transcription, DNA-templated; • TRIF-dependent toll-like receptor signaling pathway; • Fc-epsilon receptor signaling pathway; • JNK cascade; • positive regulation of NF-kappaB transcription factor activity; • stress-activated MAPK cascade; • GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь; • positive regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling; • вроджений імунітет; • inflammatory response; • GO:0022415 viral process; • I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling; • T cell receptor signaling pathway; • nucleotide-binding oligomerization domain containing signaling pathway; • establishment of vesicle localization; • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II; • negative regulation of neuron death; • GO:0097285 апоптоз; • antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class I, TAP-dependent; • cellular response to DNA damage stimulus; • positive regulation of macroautophagy; • protein deubiquitination; • anoikis; • MyD88-independent toll-like receptor signaling pathway; • interleukin-1-mediated signaling pathway;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	8517
	16151
	ENSG00000269335
	ENSMUSG00000004221
	Q9Y6K9
	O88522
NM_001099856; NM_001099857; NM_001145255; NM_003639; NM_001321396;
	NM_001321397; NM_001377312; NM_001377313; NM_001377314; NM_001377315
NM_001136067; NM_001161421; NM_001161422; NM_001161423; NM_001161424;
	NM_010547; NM_178590
NP_001093326; NP_001093327; NP_001138727; NP_001308325; NP_001308326;
	NP_003630; NP_001364241; NP_001364242; NP_001364243; NP_001364244
NP_001129539; NP_001154893; NP_001154894; NP_001154895; NP_001154896;
	NP_034677; NP_848705
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

IKBKG (англ. Inhibitor of nuclear factor kappa B kinase subunit gamma) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на X-хромосомі.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 419 амінокислот, а молекулярна маса — 48 198^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MNRHLWKSQL	CEMVQPSGGP	AADQDVLGEE	SPLGKPAMLH	LPSEQGAPET
LQRCLEENQE	LRDAIRQSNQ	ILRERCEELL	HFQASQREEK	EFLMCKFQEA
RKLVERLGLE	KLDLKRQKEQ	ALREVEHLKR	CQQQMAEDKA	SVKAQVTSLL
GELQESQSRL	EAATKECQAL	EGRARAASEQ	ARQLESEREA	LQQQHSVQVD
QLRMQGQSVE	AALRMERQAA	SEEKRKLAQL	QVAYHQLFQE	YDNHIKSSVV
GSERKRGMQL	EDLKQQLQQA	EEALVAKQEV	IDKLKEEAEQ	HKIVMETVPV
LKAQADIYKA	DFQAERQARE	KLAEKKELLQ	EQLEQLQREY	SKLKASCQES
ARIEDMRKRH	VEVSQAPLPP	APAYLSSPLA	LPSQRRSPPE	EPPDFCCPKC
QYQAPDMDTL	QIHVMECIE

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як взаємодія хазяїн-вірус, транскрипція, регуляція транскрипції, пошкодження ДНК, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

Jin D.-Y., Jeang K.-T. (1999). Isolation of full-length cDNA and chromosomal localization of human NF-kappaB modulator NEMO to Xq28. J. Biomed. Sci. 6: 115—120. PMID 10087442 DOI:10.1007/BF02256442
Rothwarf D.M., Zandi E., Natoli G., Karin M. (1998). IKK-gamma is an essential regulatory subunit of the IkappaB kinase complex. Nature. 395: 297—300. PMID 9751060 DOI:10.1038/26261
Ye Z., Connor J.R. (2000). cDNA cloning by amplification of circularized first strand cDNAs reveals non-IRE-regulated iron-responsive mRNAs. Biochem. Biophys. Res. Commun. 275: 223—227. PMID 10944468 DOI:10.1006/bbrc.2000.3282
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Jin D.-Y., Giordano V., Kibler K.V., Nakano H., Jeang K.-T. (1999). Role of adapter function in oncoprotein-mediated activation of NF-kappaB: human T-cell leukemia virus type I Tax interacts directly with IkappaB kinase gamma. J. Biol. Chem. 274: 17402—17405. PMID 10364167 DOI:10.1074/jbc.274.25.17402
Xiao G., Sun S.C. (2000). Activation of IKKalpha and IKKbeta through their fusion with HTLV-I tax protein. Oncogene. 19: 5198—5203. PMID 11064457 DOI:10.1038/sj.onc.1203894

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з IKBKG переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:5961 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q9Y6K9 (англ.) . Архів оригіналу за 25 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

Хромосома X

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

[1] Захворювання, генетично пов'язані з IKBKG переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:5961 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-5] UniProt, Q9Y6K9 (англ.) . Архів оригіналу за 25 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]