KATNB1

KATNB1
Ідентифікатори
Символи	KATNB1, KAT, LIS6, katanin regulatory subunit B1
Зовнішні ІД	OMIM: 602703 MGI: 1921437 HomoloGene: 4302 GeneCards: KATNB1
Пов'язані генетичні захворювання
lissencephaly 6 with microcephaly, Лісенцефалія[1]
Онтологія гена Молекулярна функція • protein heterodimerization activity • microtubule-severing ATPase activity • microtubule binding • dynein complex binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • цитоплазма • центр організації мікротрубочок • growth cone • клітинне ядро • аксон • spindle pole • мембрана • центросома • midbody • мікротрубочка • soma • microtubule cytoskeleton • клітинна мембрана • цитоскелет • katanin complex • гіалоплазма • веретено поділу Біологічний процес • positive regulation of neuron projection development • клітинний цикл • negative regulation of microtubule depolymerization • поділ клітини • сортування білків • microtubule severing • positive regulation of cell death • positive regulation of microtubule depolymerization • microtubule depolymerization • mitotic chromosome movement towards spindle pole Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	10300	74187
Ensembl	ENSG00000140854	ENSMUSG00000031787
UniProt	Q9BVA0	Q8BG40
RefSeq (мРНК)	NM_005886	NM_028805
RefSeq (білок)	NP_005877	NP_083081
Локус (UCSC)	Хр. 16: 57.74 – 57.76 Mb	Хр. 8: 95.81 – 95.83 Mb
PubMed search	[2]	[3]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

KATNB1 (англ. Katanin regulatory subunit B1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 655 амінокислот, а молекулярна маса — 72 334^[5].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MATPVVTKTA		WKLQEIVAHA		SNVSSLVLGK		ASGRLLATGG		DDCRVNLWSI
NKPNCIMSLT		GHTSPVESVR		LNTPEELIVA		GSQSGSIRVW		DLEAAKILRT
LMGHKANICS		LDFHPYGEFV		ASGSQDTNIK		LWDIRRKGCV		FRYRGHSQAV
RCLRFSPDGK		WLASAADDHT		VKLWDLTAGK		MMSEFPGHTG		PVNVVEFHPN
EYLLASGSSD		RTIRFWDLEK		FQVVSCIEGE		PGPVRSVLFN		PDGCCLYSGC
QDSLRVYGWE		PERCFDVVLV		NWGKVADLAI		CNDQLIGVAF		SQSNVSSYVV
DLTRVTRTGT		VARDPVQDHR		PLAQPLPNPS		APLRRIYERP		STTCSKPQRV
KQNSESERRS		PSSEDDRDER		ESRAEIQNAE		DYNEIFQPKN		SISRTPPRRS
EPFPAPPEDD		AATAKEAAKP		SPAMDVQFPV		PNLEVLPRPP		VVASTPAPKA
EPAIIPATRN		EPIGLKASDF		LPAVKIPQQA		ELVDEDAMSQ		IRKGHDTMCV
VLTSRHKNLD		TVRAVWTMGD		IKTSVDSAVA		INDLSVVVDL		LNIVNQKASL
WKLDLCTTVL		PQIEKLLQSK		YESYVQTGCT		SLKLILQRFL		PLITDMLAAP
PSVGVDISRE		ERLHKCRLCY		KQLKSISGLV		KSKSGLSGRH		GSTFRELHLL
MASLD

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинний цикл, поділ клітини, мітоз. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• McNally F.J., Thomas S. (1998). Katanin is responsible for the M-phase microtubule-severing activity in Xenopus eggs. Mol. Biol. Cell. 9: 1847—1861. PMID 9658175 DOI:10.1091/mbc.9.7.1847
• McNally K.P., Bazirgan O.A., McNally F.J. (2000). Two domains of p80 katanin regulate microtubule severing and spindle pole targeting by p60 katanin. J. Cell Sci. 113: 1623—1633. PMID 10751153

Примітки

1. Захворювання, генетично пов'язані з KATNB1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
2. Human PubMed Reference:.
3. Mouse PubMed Reference:.
4. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6217 (англ.) . Архів оригіналу за 29 липня 2016. Процитовано 11 вересня 2017. [Архівовано 2016-07-29 у Wayback Machine.]
5. UniProt, Q9BVA0 (англ.) . Архів оригіналу за 14 вересня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

• Хромосома 16

Портал «Біологія»   Портал «Хімія»