LRBA

LRBA
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Ідентифікатори
Символи LRBA, BGL, CDC4L, CVID8, LAB300, LBA, LPS responsive beige-like anchor protein
Зовнішні ІД OMIM: 606453 MGI: 1933162 HomoloGene: 36205 GeneCards: LRBA
Шаблон експресії


Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
NM_001199282
NM_006726
NM_001364905
NM_001367550
NM_001077687
NM_001077688
NM_030695
RefSeq (білок)
NP_001186211
NP_006717
NP_001351834
NP_001354479
NP_001071155
NP_001071156
NP_109620
Локус (UCSC) Хр. 4: 150.26 – 151.02 Mb Хр. 3: 86.13 – 86.69 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

LRBA (англ. LPS responsive beige-like anchor protein) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 863 амінокислот, а молекулярна маса — 319 108[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MASEDNRVPSPPPTGDDGGGGGREETPTEGGALSLKPGLPIRGIRMKFAV
LTGLVEVGEVSNRDIVETVFNLLVGGQFDLEMNFIIQEGESINCMVDLLE
KCDITCQAEVWSMFTAILKKSIRNLQVCTEVGLVEKVLGKIEKVDNMIAD
LLVDMLGVLASYNLTVRELKLFFSKLQGDKGRWPPHAGKLLSVLKHMPQK
YGPDAFFNFPGKSAAAIALPPIAKWPYQNGFTFHTWLRMDPVNNINVDKD
KPYLYCFRTSKGLGYSAHFVGGCLIVTSIKSKGKGFQHCVKFDFKPQKWY
MVTIVHIYNRWKNSELRCYVNGELASYGEITWFVNTSDTFDKCFLGSSET
ADANRVFCGQMTAVYLFSEALNAAQIFAIYQLGLGYKGTFKFKAESDLFL
AEHHKLLLYDGKLSSAIAFTYNPRATDAQLCLESSPKDNPSIFVHSPHAL
MLQDVKAVLTHSIQSAMHSIGGVQVLFPLFAQLDYRQYLSDEIDLTICST
LLAFIMELLKNSIAMQEQMLACKGFLVIGYSLEKSSKSHVSRAVLELCLA
FSKYLSNLQNGMPLLKQLCDHVLLNPAIWIHTPAKVQLMLYTYLSTEFIG
TVNIYNTIRRVGTVLLIMHTLKYYYWAVNPQDRSGITPKGLDGPRPNQKE
MLSLRAFLLMFIKQLVMKDSGVKEDELQAILNYLLTMHEDDNLMDVLQLL
VALMSEHPNSMIPAFDQRNGLRVIYKLLASKSEGIRVQALKAMGYFLKHL
APKRKAEVMLGHGLFSLLAERLMLQTNLITMTTYNVLFEILIEQIGTQVI
HKQHPDPDSSVKIQNPQILKVIATLLRNSPQCPESMEVRRAFLSDMIKLF
NNSRENRRSLLQCSVWQEWMLSLCYFNPKNSDEQKITEMVYAIFRILLYH
AVKYEWGGWRVWVDTLSITHSKVTFEIHKENLANIFREQQGKVDEEIGLC
SSTSVQAASGIRRDINVSVGSQQPDTKDSPVCPHFTTNGNENSSIEKTSS
LESASNIELQTTNTSYEEMKAEQENQELPDEGTLEETLTNETRNADDLEV
SSDIIEAVAISSNSFITTGKDSMTVSEVTASISSPSEEDASEMPEFLDKS
IVEEEEDDDYVELKVEGSPTEEANLPTELQDNSLSPAASEAGEKLDMFGN
DDKLIFQEGKPVTEKQTDTETQDSKDSGIQTMTASGSSAMSPETTVSQIA
VESDLGQMLEEGKKATNLTRETKLINDCHGSVSEASSEQKIAKLDVSNVA
TDTERLELKASPNVEAPQPHRHVLEISRQHEQPGQGIAPDAVNGQRRDSR
STVFRIPEFNWSQMHQRLLTDLLFSIETDIQMWRSHSTKTVMDFVNSSDN
VIFVHNTIHLISQVMDNMVMACGGILPLLSAATSATHELENIEPTQGLSI
EASVTFLQRLISLVDVLIFASSLGFTEIEAEKSMSSGGILRQCLRLVCAV
AVRNCLECQQHSQLKTRGDKALKPMHSLIPLGKSAAKSPVDIVTGGISPV
RDLDRLLQDMDINRLRAVVFRDIEDSKQAQFLALAVVYFISVLMVSKYRD
ILEPQNERHSQSCTETGSENENVSLSEITPAAFSTLTTASVEESESTSSA
RRRDSGIGEETATGLGSHVEVTPHTAPPGVSAGPDAISEVLSTLSLEVNK
SPETKNDRGNDLDTKATPSVSVSKNVNVKDILRSLVNIPADGVTVDPALL
PPACLGALGDLSVEQPVQFRSFDRSVIVAAKKSAVSPSTFNTSIPTNAVS
VVSSVDSAQASDMGGESPGSRSSNAKLPSVPTVDSVSQDPVSNMSITERL
EHALEKAAPLLREIFVDFAPFLSRTLLGSHGQELLIEGTSLVCMKSSSSV
VELVMLLCSQEWQNSIQKNAGLAFIELVNEGRLLSQTMKDHLVRVANEAE
FILSRQRAEDIHRHAEFESLCAQYSADKREDEKMCDHLIRAAKYRDHVTA
TQLIQKIINILTDKHGAWGNSAVSRPLEFWRLDYWEDDLRRRRRFVRNPL
GSTHPEATLKTAVEHVCIFKLRENSKATDEDILAKGKQSIRSQALGNQNS
ENEILLEGDDDTLSSVDEKDLENLAGPVSLSTPAQLVAPSVVVKGTLSVT
SSELYFEVDEEDPNFKKIDPKILAYTEGLHGKWLFTEIRSIFSRRYLLQN
TALEIFMANRVAVMFNFPDPATVKKVVNYLPRVGVGTSFGLPQTRRISLA
SPRQLFKASNMTQRWQHREISNFEYLMFLNTIAGRSYNDLNQYPVFPWVI
TNYESEELDLTLPTNFRDLSKPIGALNPKRAAFFAERYESWEDDQVPKFH
YGTHYSTASFVLAWLLRIEPFTTYFLNLQGGKFDHADRTFSSISRAWRNS
QRDTSDIKELIPEFYYLPEMFVNFNNYNLGVMDDGTVVSDVELPPWAKTS
EEFVHINRLALESEFVSCQLHQWIDLIFGYKQQGPEAVRALNVFYYLTYE
GAVNLNSITDPVLREAVEAQIRSFGQTPSQLLIEPHPPRGSAMQVSPLMF
TDKAQQDVIMVLKFPSNSPVTHVAANTQPGLATPAVITVTANRLFAVNKW
HNLPAHQGAVQDQPYQLPVEIDPLIASNTGMHRRQITDLLDQSIQVHSQC
FVITSDNRYILVCGFWDKSFRVYSTDTGRLIQVVFGHWDVVTCLARSESY
IGGNCYILSGSRDATLLLWYWNGKCSGIGDNPGSETAAPRAILTGHDYEV
TCAAVCAELGLVLSGSQEGPCLIHSMNGDLLRTLEGPENCLKPKLIQASR
EGHCVIFYENGLFCTFSVNGKLQATMETDDNIRAIQLSRDGQYLLTGGDR
GVVVVRQVSDLKQLFAYPGCDAGIRAMALSYDQRCIISGMASGSIVLFYN
DFNRWHHEYQTRY

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як поліморфізм, ацетиляція, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, ендоплазматичному ретикулумі, лізосомі, апараті гольджі.

Література

[ред. | ред. код]
  • Wang J.-W., Howson J., Haller E., Kerr W.G. (2001). Identification of a novel lipopolysaccharide-inducible gene with key features of both A kinase anchor proteins and chs1/beige proteins. J. Immunol. 166: 4586—4595. PMID 11254716 DOI:10.4049/jimmunol.166.7.4586
  • Feuchter A.E., Freeman J.D., Mager D.L. (1992). Strategy for detecting cellular transcripts promoted by human endogenous long terminal repeats: identification of a novel gene (CDC4L) with homology to yeast CDC4. Genomics. 13: 1237—1246. PMID 1505956 DOI:10.1016/0888-7543(92)90041-P

Примітки

[ред. | ред. код]
  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1742 (англ.) . Архів оригіналу за 10 жовтня 2017. Процитовано 30 серпня 2017. [Архівовано 2017-10-10 у Wayback Machine.]
  4. UniProt, P50851 (англ.) . Архів оригіналу за 16 березня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.

Див. також

[ред. | ред. код]