LRP4

LRP4
Ідентифікатори
Символи	LRP4, CLSS, LRP-4, LRP10, MEGF7, SOST2, CMS17, Low density lipoprotein receptor-related protein 4, LDL receptor related protein 4
Зовнішні ІД	OMIM: 604270 MGI: 2442252 HomoloGene: 17964 GeneCards: LRP4
Пов'язані генетичні захворювання
Cenani-Lenz syndactyly syndrome, sclerosteosis 2, congenital myasthenic syndrome 17[1]
Онтологія гена Молекулярна функція • calcium ion binding • apolipoprotein binding • protein homodimerization activity • scaffold protein binding • receptor tyrosine kinase binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • Wnt-protein binding • Wnt-activated receptor activity Клітинна компонента • integral component of membrane • synaptic membrane • GO:0097483, GO:0097481 постсинаптичне ущільнення • мембрана • neuromuscular junction • cell surface • soma • flotillin complex • дендрит (нейробіологія) • receptor complex • клітинна мембрана • plasma membrane raft Біологічний процес • animal organ development • hair follicle development • regulation of protein phosphorylation • GO:0034613 protein localization • proximal/distal pattern formation • диференціація клітин • protein heterotetramerization • ендоцитоз • dendrite morphogenesis • розвиток нирки • GO:1903374 anatomical structure development • synaptic assembly at neuromuscular junction • regulation of canonical Wnt signaling pathway • negative regulation of Wnt signaling pathway • synapse organization • embryonic digit morphogenesis • Wnt signaling pathway • receptor clustering • BMP signaling pathway • presynaptic membrane assembly • limb development • positive regulation of presynaptic membrane organization • negative regulation of ossification • multicellular organism development • odontogenesis of dentin-containing tooth • positive regulation of skeletal muscle acetylcholine-gated channel clustering • negative regulation of axonogenesis • postsynaptic membrane assembly • embryonic limb morphogenesis • skeletal muscle acetylcholine-gated channel clustering • positive regulation of peptidyl-tyrosine phosphorylation • dorsal/ventral pattern formation • negative regulation of canonical Wnt signaling pathway • Wnt signaling pathway involved in dorsal/ventral axis specification • amyloid-beta clearance by cellular catabolic process Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	4038	228357
Ensembl	ENSG00000134569	ENSMUSG00000027253
UniProt	O75096	Q8VI56
RefSeq (мРНК)	NM_002334	NM_001145857 NM_172668
RefSeq (білок)	NP_002325	NP_001139329 NP_766256
Локус (UCSC)	Хр. 11: 46.86 – 46.92 Mb	Хр. 2: 91.29 – 91.34 Mb
PubMed search	[2]	[3]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

LRP4 (англ. LDL receptor related protein 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 905 амінокислот, а молекулярна маса — 212 045^[5].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MRRQWGALLL		GALLCAHGLA		SSPECACGRS		HFTCAVSALG		ECTCIPAQWQ
CDGDNDCGDH		SDEDGCILPT		CSPLDFHCDN		GKCIRRSWVC		DGDNDCEDDS
DEQDCPPREC		EEDEFPCQNG		YCIRSLWHCD		GDNDCGDNSD		EQCDMRKCSD
KEFRCSDGSC		IAEHWYCDGD		TDCKDGSDEE		NCPSAVPAPP		CNLEEFQCAY
GRCILDIYHC		DGDDDCGDWS		DESDCSSHQP		CRSGEFMCDS		GLCINAGWRC
DGDADCDDQS		DERNCTTSMC		TAEQFRCHSG		RCVRLSWRCD		GEDDCADNSD
EENCENTGSP		QCALDQFLCW		NGRCIGQRKL		CNGVNDCGDN		SDESPQQNCR
PRTGEENCNV		NNGGCAQKCQ		MVRGAVQCTC		HTGYRLTEDG		HTCQDVNECA
EEGYCSQGCT		NSEGAFQCWC		ETGYELRPDR		RSCKALGPEP		VLLFANRIDI
RQVLPHRSEY		TLLLNNLENA		IALDFHHRRE		LVFWSDVTLD		RILRANLNGS
NVEEVVSTGL		ESPGGLAVDW		VHDKLYWTDS		GTSRIEVANL		DGAHRKVLLW
QNLEKPRAIA		LHPMEGTIYW		TDWGNTPRIE		ASSMDGSGRR		IIADTHLFWP
NGLTIDYAGR		RMYWVDAKHH		VIERANLDGS		HRKAVISQGL		PHPFAITVFE
DSLYWTDWHT		KSINSANKFT		GKNQEIIRNK		LHFPMDIHTL		HPQRQPAGKN
RCGDNNGGCT		HLCLPSGQNY		TCACPTGFRK		ISSHACAQSL		DKFLLFARRM
DIRRISFDTE		DLSDDVIPLA		DVRSAVALDW		DSRDDHVYWT		DVSTDTISRA
KWDGTGQEVV		VDTSLESPAG		LAIDWVTNKL		YWTDAGTDRI		EVANTDGSMR
TVLIWENLDR		PRDIVVEPMG		GYMYWTDWGA		SPKIERAGMD		ASGRQVIISS
NLTWPNGLAI		DYGSQRLYWA		DAGMKTIEFA		GLDGSKRKVL		IGSQLPHPFG
LTLYGERIYW		TDWQTKSIQS		ADRLTGLDRE		TLQENLENLM		DIHVFHRRRP
PVSTPCAMEN		GGCSHLCLRS		PNPSGFSCTC		PTGINLLSDG		KTCSPGMNSF
LIFARRIDIR		MVSLDIPYFA		DVVVPINITM		KNTIAIGVDP		QEGKVYWSDS
TLHRISRANL		DGSQHEDIIT		TGLQTTDGLA		VDAIGRKVYW		TDTGTNRIEV
GNLDGSMRKV		LVWQNLDSPR		AIVLYHEMGF		MYWTDWGENA		KLERSGMDGS
DRAVLINNNL		GWPNGLTVDK		ASSQLLWADA		HTERIEAADL		NGANRHTLVS
PVQHPYGLTL		LDSYIYWTDW		QTRSIHRADK		GTGSNVILVR		SNLPGLMDMQ
AVDRAQPLGF		NKCGSRNGGC		SHLCLPRPSG		FSCACPTGIQ		LKGDGKTCDP
SPETYLLFSS		RGSIRRISLD		TSDHTDVHVP		VPELNNVISL		DYDSVDGKVY
YTDVFLDVIR		RADLNGSNME		TVIGRGLKTT		DGLAVDWVAR		NLYWTDTGRN
TIEASRLDGS		CRKVLINNSL		DEPRAIAVFP		RKGYLFWTDW		GHIAKIERAN
LDGSERKVLI		NTDLGWPNGL		TLDYDTRRIY		WVDAHLDRIE		SADLNGKLRQ
VLVSHVSHPF		ALTQQDRWIY		WTDWQTKSIQ		RVDKYSGRNK		ETVLANVEGL
MDIIVVSPQR		QTGTNACGVN		NGGCTHLCFA		RASDFVCACP		DEPDSRPCSL
VPGLVPPAPR		ATGMSEKSPV		LPNTPPTTLY		SSTTRTRTSL		EEVEGRCSER
DARLGLCARS		NDAVPAAPGE		GLHISYAIGG		LLSILLILVV		IAALMLYRHK
KSKFTDPGMG		NLTYSNPSYR		TSTQEVKIEA		IPKPAMYNQL		CYKKEGGPDH
NYTKEKIKIV		EGICLLSGDD		AEWDDLKQLR		SSRGGLLRDH		VCMKTDTVSI
QASSGSLDDT		ETEQLLQEEQ		SECSSVHTAA		TPERRGSLPD		TGWKHERKLS
SESQV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, білків розвитку. Задіяний у таких біологічних процесах, як ендоцитоз, диференціація клітин, сигнальний шлях Wnt. Білок має сайт для зв'язування з іоном кальцію. Локалізований у мембрані.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

1. Захворювання, генетично пов'язані з LRP4 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
2. Human PubMed Reference:.
3. Mouse PubMed Reference:.
4. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6696 (англ.) . Архів оригіналу за 15 березня 2016. Процитовано 8 вересня 2017.
5. UniProt, O75096 (англ.) . Архів оригіналу за 23 лютого 2017. Процитовано 8 вересня 2017.

Див. також

• Хромосома 11

Портал «Біологія»   Портал «Хімія»