LRRC8E

LRRC8E
Ідентифікатори
Символи	LRRC8E, leucine rich repeat containing 8 family member E, leucine rich repeat containing 8 VRAC subunit E
Зовнішні ІД	OMIM: 612891 MGI: 1919517 HomoloGene: 11817 GeneCards: LRRC8E
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • volume-sensitive anion channel activity Клітинна компонента • цитоплазма • integral component of membrane • integral component of plasma membrane • мембрана • endoplasmic reticulum membrane • ендоплазматичний ретикулум • клітинна мембрана • іонні канали Біологічний процес • ion transport • GO:0072468 сигнальна трансдукція • трансмембранний транспорт • inorganic anion transport • cell volume homeostasis • anion transmembrane transport • aspartate transmembrane transport • cellular response to osmotic stress Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	80131	72267
Ensembl	ENSG00000171017	ENSMUSG00000046589
UniProt	Q6NSJ5	Q66JT1
RefSeq (мРНК)	NM_001268284 NM_001268285 NM_025061	NM_028175
RefSeq (білок)	NP_001255213 NP_001255214 NP_079337	NP_082451
Локус (UCSC)	Хр. 19: 7.89 – 7.9 Mb	Хр. 8: 4.28 – 4.29 Mb
PubMed search	[1]	[2]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

LRRC8E (англ. Leucine rich repeat containing 8 VRAC subunit E) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 796 амінокислот, а молекулярна маса — 90 247^[4].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MIPVAEFKQF		TEQQPAFKVL		KPWWDVLAEY		LTVAMLMIGV		FGCTLQVTQD
KIICLPNHEL		QENLSEAPCQ		QLLPRGIPEQ		IGALQEVKGL		KNNLDLQQYS
FINQLCYETA		LHWYAKYFPY		LVVIHTLIFM		VCTSFWFKFP		GTSSKIEHFI
SILGKCFDSP		WTTRALSEVS		GENQKGPAAT		ERAAATIVAM		AGTGPGKAGE
GEKEKVLAEP		EKVVTEPPVV		TLLDKKEGEQ		AKALFEKVKK		FRMHVEEGDI
LYTMYIRQTV		LKVCKFLAIL		VYNLVYVEKI		SFLVACRVET		SEVTGYASFC
CNHTKAHLFS		KLAFCYISFV		CIYGLTCIYT		LYWLFHRPLK		EYSFRSVREE
TGMGDIPDVK		NDFAFMLHLI		DQYDSLYSKR		FAVFLSEVSE		SRLKQLNLNH
EWTPEKLRQK		LQRNAAGRLE		LALCMLPGLP		DTVFELSEVE		SLRLEAICDI
TFPPGLSQLV		HLQELSLLHS		PARLPFSLQV		FLRDHLKVMR		VKCEELREVP
LWVFGLRGLE		ELHLEGLFPQ		ELARAATLES		LRELKQLKVL		SLRSNAGKVP
ASVTDVAGHL		QRLSLHNDGA		RLVALNSLKK		LAALRELELV		ACGLERIPHA
VFSLGALQEL		DLKDNHLRSI		EEILSFQHCR		KLVTLRLWHN		QIAYVPEHVR
KLRSLEQLYL		SYNKLETLPS		QLGLCSGLRL		LDVSHNGLHS		LPPEVGLLQN
LQHLALSYNA		LEALPEELFF		CRKLRTLLLG		DNQLSQLSPH		VGALRALSRL
ELKGNRLEAL		PEELGNCGGL		KKAGLLVEDT		LYQGLPAEVR		DKMEEE

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до іонних каналів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт іонів, транспорт. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, ендоплазматичному ретикулумі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
• Abascal F., Zardoya R. (2012). LRRC8 proteins share a common ancestor with pannexins, and may form hexameric channels involved in cell-cell communication. Bioessays. 34: 551—560. PMID 22532330 doi:10.1002/bies.201100173

Примітки

1. Human PubMed Reference:.
2. Mouse PubMed Reference:.
3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:26272 (англ.) . Архів оригіналу за 15 вересня 2015. Процитовано 12 вересня 2017. [Архівовано 2015-09-15 у Wayback Machine.]
4. UniProt, Q6NSJ5 (англ.) . Архів оригіналу за 11 жовтня 2016. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

• Хромосома 19

Портал «Біологія»   Портал «Хімія»