LTBR

LTBR
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1RF3, 4MXW
Ідентифікатори
Символи	LTBR, CD18, D12S370, LT-BETA-R, TNF-R-III, TNFCR, TNFR-RP, TNFR2-RP, TNFR3, TNFRSF3, lymphotoxin beta receptor
Зовнішні ІД	OMIM: 600979 MGI: 104875 HomoloGene: 1753 GeneCards: LTBR
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • tumor necrosis factor-activated receptor activity • identical protein binding • ubiquitin protein ligase binding Клітинна компонента • integral component of membrane • мембрана • клітинна мембрана • integral component of plasma membrane • комплекс Ґольджі Біологічний процес • myeloid dendritic cell differentiation • tumor necrosis factor-mediated signaling pathway • positive regulation of JNK cascade • multicellular organism development • cellular response to mechanical stimulus • response to lipopolysaccharide • regulation of cell population proliferation • positive regulation of extrinsic apoptotic signaling pathway • inflammatory response • GO:0022415 viral process • GO:0072468 сигнальна трансдукція • GO:0097285 апоптоз • GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь • positive regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling • hematopoietic or lymphoid organ development Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	4055	17000
Ensembl	ENSG00000111321	ENSMUSG00000030339
UniProt	P36941	P50284
RefSeq (мРНК)	NM_001270987 NM_002342	NM_010736
RefSeq (білок)	NP_001257916 NP_002333	NP_034866
Локус (UCSC)	Хр. 12: 6.38 – 6.39 Mb	Хр. 6: 125.28 – 125.29 Mb
PubMed search	[1]	[2]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

LTBR (англ. Lymphotoxin beta receptor) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 435 амінокислот, а молекулярна маса — 46 709^[4].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MLLPWATSAP		GLAWGPLVLG		LFGLLAASQP		QAVPPYASEN		QTCRDQEKEY
YEPQHRICCS		RCPPGTYVSA		KCSRIRDTVC		ATCAENSYNE		HWNYLTICQL
CRPCDPVMGL		EEIAPCTSKR		KTQCRCQPGM		FCAAWALECT		HCELLSDCPP
GTEAELKDEV		GKGNNHCVPC		KAGHFQNTSS		PSARCQPHTR		CENQGLVEAA
PGTAQSDTTC		KNPLEPLPPE		MSGTMLMLAV		LLPLAFFLLL		ATVFSCIWKS
HPSLCRKLGS		LLKRRPQGEG		PNPVAGSWEP		PKAHPYFPDL		VQPLLPISGD
VSPVSTGLPA		APVLEAGVPQ		QQSPLDLTRE		PQLEPGEQSQ		VAHGTNGIHV
TGGSMTITGN		IYIYNGPVLG		GPPGPGDLPA		TPEPPYPIPE		EGDPGPPGLS
TPHQEDGKAW		HLAETEHCGA		TPSNRGPRNQ		FITHD

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як апоптоз, взаємодія хазяїн-вірус, альтернативний сплайсинг. Локалізований у мембрані.

Література

• Baens M., Chaffanet M., Cassiman J.-J., van den Berghe H., Marynen P. (1993). Construction and evaluation of a hncDNA library of human 12p transcribed sequences derived from a somatic cell hybrid. Genomics. 16: 214—218. PMID 8486360 DOI:10.1006/geno.1993.1161
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Wu M.-Y., Wang P.-Y., Han S.-H., Hsieh S.-L. (1999). The cytoplasmic domain of the lymphotoxin-beta receptor mediates cell death in HeLa cells. J. Biol. Chem. 274: 11868—11873. PMID 10207006 DOI:10.1074/jbc.274.17.11868

Примітки

1. Human PubMed Reference:.
2. Mouse PubMed Reference:.
3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6718 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.
4. UniProt, P36941 (англ.) . Архів оригіналу за 13 жовтня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

• Хромосома 12

Портал «Біологія»   Портал «Хімія»