MAP1LC3A

MAP1LC3A
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3ECI, 3WAL, 3WAN, 4ZDV
Ідентифікатори
Символи	MAP1LC3A, ATG8E, LC3, LC3A, MAP1ALC3, MAP1BLC3, microtubule associated protein 1 light chain 3 alpha
Зовнішні ІД	OMIM: 601242 MGI: 1915661 HomoloGene: 12021 GeneCards: MAP1LC3A
Онтологія гена Молекулярна функція • phosphatidylethanolamine binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • phospholipid binding • ubiquitin protein ligase binding • microtubule binding Клітинна компонента • цитоплазма • organelle membrane • гіалоплазма • late endosome • мембрана • autophagosome • мікротрубочка • цитоскелет • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • система ендомембран • autolysosome • autophagosome membrane • синапс Біологічний процес • автофагія • autophagy of mitochondrion • autophagosome assembly • response to iron(II) ion • response to lead ion • response to nutrient levels • cellular response to amino acid starvation • response to morphine • cellular response to hydrogen peroxide • cellular response to copper ion • cellular response to nitrogen starvation • cellular response to starvation • macroautophagy • GO:0000046 autophagosome maturation Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	84557	66734
Ensembl	ENSG00000101460	ENSMUSG00000027602
UniProt	Q9H492	Q91VR7
RefSeq (мРНК)	NM_032514 NM_181509	NM_025735
RefSeq (білок)	NP_115903 NP_852610	NP_080011
Локус (UCSC)	Хр. 20: 34.55 – 34.56 Mb	Хр. 2: 155.12 – 155.12 Mb
PubMed search	[1]	[2]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

MAP1LC3A (англ. Microtubule associated protein 1 light chain 3 alpha) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 121 амінокислот, а молекулярна маса — 14 272^[4].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MPSDRPFKQR		RSFADRCKEV		QQIRDQHPSK		IPVIIERYKG		EKQLPVLDKT
KFLVPDHVNM		SELVKIIRRR		LQLNPTQAFF		LLVNQHSMVS		VSTPIADIYE
QEKDEDGFLY		MVYASQETFG		F

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як убіквітинування білків, автофагія, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, мембрані, цитоплазматичних везикулах.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Tanida I., Tanida-Miyake E., Ueno T., Kominami E. (2001). The human homolog of Saccharomyces cerevisiae Apg7p is a Protein-activating enzyme for multiple substrates including human Apg12p, GATE-16, GABARAP, and MAP-LC3. J. Biol. Chem. 276: 1701—1706. PMID 11096062 DOI:10.1074/jbc.C000752200
• Tanida I., Tanida-Miyake E., Komatsu M., Ueno T., Kominami E. (2002). Human Apg3p/Aut1p homologue is an authentic E2 enzyme for multiple substrates, GATE-16, GABARAP, and MAP-LC3, and facilitates the conjugation of hApg12p to hApg5p. J. Biol. Chem. 277: 13739—13744. PMID 11825910 DOI:10.1074/jbc.M200385200
• Lee D.Y., Arnott D., Brown E.J. (2013). Ubiquilin4 is an adaptor protein that recruits Ubiquilin1 to the autophagy machinery. EMBO Rep. 14: 373—381. PMID 23459205 DOI:10.1038/embor.2013.22

Примітки

1. Human PubMed Reference:.
2. Mouse PubMed Reference:.
3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6838 (англ.) . Архів оригіналу за 16 липня 2017. Процитовано 12 вересня 2017. [Архівовано 2017-07-16 у Wayback Machine.]
4. UniProt, Q9H492 (англ.) . Архів оригіналу за 6 серпня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

• Хромосома 20

Портал «Біологія»   Портал «Хімія»