MBD4

MBD4
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Ідентифікатори
Символи MBD4, MED1, methyl-CpG binding domain 4, DNA glycosylase
Зовнішні ІД OMIM: 603574 MGI: 1333850 HomoloGene: 2916 GeneCards: MBD4
Шаблон експресії




Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
NM_001276270
NM_001276271
NM_001276272
NM_001276273
NM_003925
NM_010774
RefSeq (білок)
NP_001263199
NP_001263200
NP_001263201
NP_001263202
NP_003916
NP_034904
Локус (UCSC) Хр. 3: 129.43 – 129.44 Mb Хр. 6: 115.82 – 115.83 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

MBD4 (англ. Methyl-CpG binding domain 4, DNA glycosylase) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 580 амінокислот, а молекулярна маса — 66 051[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MGTTGLESLSLGDRGAAPTVTSSERLVPDPPNDLRKEDVAMELERVGEDE
EQMMIKRSSECNPLLQEPIASAQFGATAGTECRKSVPCGWERVVKQRLFG
KTAGRFDVYFISPQGLKFRSKSSLANYLHKNGETSLKPEDFDFTVLSKRG
IKSRYKDCSMAALTSHLQNQSNNSNWNLRTRSKCKKDVFMPPSSSSELQE
SRGLSNFTSTHLLLKEDEGVDDVNFRKVRKPKGKVTILKGIPIKKTKKGC
RKSCSGFVQSDSKRESVCNKADAESEPVAQKSQLDRTVCISDAGACGETL
SVTSEENSLVKKKERSLSSGSNFCSEQKTSGIINKFCSAKDSEHNEKYED
TFLESEEIGTKVEVVERKEHLHTDILKRGSEMDNNCSPTRKDFTGEKIFQ
EDTIPRTQIERRKTSLYFSSKYNKEALSPPRRKAFKKWTPPRSPFNLVQE
TLFHDPWKLLIATIFLNRTSGKMAIPVLWKFLEKYPSAEVARTADWRDVS
ELLKPLGLYDLRAKTIVKFSDEYLTKQWKYPIELHGIGKYGNDSYRIFCV
NEWKQVHPEDHKLNKYHDWLWENHEKLSLS

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як пошкодження ДНК, репарація ДНК, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

[ред. | ред. код]
  • Hendrich B., Bird A. (1998). Identification and characterization of a family of mammalian methyl-CpG binding proteins. Mol. Cell. Biol. 18: 6538—6547. PMID 9774669 DOI:10.1128/MCB.18.11.6538
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Owen R.M., Baker R.D., Bader S., Dunlop M.G., Nicholl I.D. (2007). The identification of a novel alternatively spliced form of the MBD4 DNA glycosylase. Oncol. Rep. 17: 111—116. PMID 17143486

Примітки

[ред. | ред. код]
  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6919 (англ.) . Архів оригіналу за 15 червня 2017. Процитовано 30 серпня 2017. [Архівовано 2017-06-15 у Wayback Machine.]
  4. UniProt, O95243 (англ.) . Архів оригіналу за 31 липня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.

Див. також

[ред. | ред. код]