MDC1

MDC1
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2ADO, 2AZM, 2ETX, 3K05, 3UEO, 3UMZ, 3UN0, 3UNM, 3UNN, 3UOT
Ідентифікатори
Символи	MDC1, NFBD1, mediator of DNA damage checkpoint 1
Зовнішні ІД	OMIM: 607593 MGI: 3525201 HomoloGene: 67092 GeneCards: MDC1
Онтологія гена
Молекулярна функція	• FHA domain binding; • protein C-terminus binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • identical protein binding;
Клітинна компонента	• клітинне ядро; • focal adhesion; • хромосома; • нуклеоплазма; • ядерні тільця;
Біологічний процес	• cellular response to DNA damage stimulus; • mitotic intra-S DNA damage checkpoint signaling; • клітинний цикл; • double-strand break repair via nonhomologous end joining; • GO:0100026 Репарація ДНК;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	9656
	240087
ENSG00000224587; ENSG00000237095; ENSG00000137337; ENSG00000206481; ENSG00000234012;
	ENSG00000231135; ENSG00000228575; ENSG00000225589
	ENSMUSG00000061607
	Q14676
	Q5PSV9
	NM_014641
	NM_001010833
	NP_055456
NP_001010833; NP_001392450; NP_001392451; NP_001392452; NP_001392453;
	NP_001392454; NP_001392455; NP_001392456; NP_001392457; NP_001392458
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

MDC1 (англ. Mediator of DNA damage checkpoint 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 089 амінокислот, а молекулярна маса — 226 666^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MEDTQAIDWD	VEEEEETEQS	SESLRCNVEP	VGRLHIFSGA	HGPEKDFPLH
LGKNVVGRMP	DCSVALPFPS	ISKQHAEIEI	LAWDKAPILR	DCGSLNGTQI
LRPPKVLSPG	VSHRLRDQEL	ILFADLLCQY	HRLDVSLPFV	SRGPLTVEET
PRVQGETQPQ	RLLLAEDSEE	EVDFLSERRM	VKKSRTTSSS	VIVPESDEEG
HSPVLGGLGP	PFAFNLNSDT	DVEEGQQPAT	EEASSAARRG	ATVEAKQSEA
EVVTEIQLEK	DQPLVKERDN	DTKVKRGAGN	GVVPAGVILE	RSQPPGEDSD
TDVDDDSRPP	GRPAEVHLER	AQPFGFIDSD	TDAEEERIPA	TPVVIPMKKR
KIFHGVGTRG	PGAPGLAHLQ	ESQAGSDTDV	EEGKAPQAVP	LEKSQASMVI
NSDTDDEEEV	SAALTLAHLK	ESQPAIWNRD	AEEDMPQRVV	LLQRSQTTTE
RDSDTDVEEE	ELPVENREAV	LKDHTKIRAL	VRAHSEKDQP	PFGDSDDSVE
ADKSSPGIHL	ERSQASTTVD	INTQVEKEVP	PGSAIIHIKK	HQVSVEGTNQ
TDVKAVGGPA	KLLVVSLEEA	WPLHGDCETD	AEEGTSLTAS	VVADVRKSQL
PAEGDAGAEW	AAAVLKQERA	HEVGAQGGPP	VAQVEQDLPI	SRENLTDLVV
DTDTLGESTQ	PQREGAQVPT	GREREQHVGG	TKDSEDNYGD	SEDLDLQATQ
CFLENQGLEA	VQSMEDEPTQ	AFMLTPPQEL	GPSHCSFQTT	GTLDEPWEVL
ATQPFCLRES	EDSETQPFDT	HLEAYGPCLS	PPRAIPGDQH	PESPVHTEPM
GIQGRGRQTV	DKVMGIPKET	AERVGPERGP	LERETEKLLP	ERQTDVTGEE
ELTKGKQDRE	QKQLLARDTQ	RQESDKNGES	ASPERDRESL	KVEIETSEEI
QEKQVQKQTL	PSKAFEREVE	RPVANRECDP	AELEEKVPKV	ILERDTQRGE
PEGGSQDQKG	QASSPTPEPG	VGAGDLPGPT	SAPVPSGSQS	GGRGSPVSPR
RHQKGLLNCK	MPPAEKASRI	RAAEKVSRGD	QESPDACLPP	TVPEAPAPPQ
KPLNSQSQKH	LAPPPLLSPL	LPSIKPTVRK	TRQDGSQEAP	EAPLSSELEP
FHPKPKIRTR	KSSRMTPFPA	TSAAPEPHPS	TSTAQPVTPK	PTSQATRSRT
NRSSVKTPEP	VVPTAPELQP	STSTDQPVTS	EPTSQVTRGR	KSRSSVKTPE
TVVPTALELQ	PSTSTDRPVT	SEPTSQATRG	RKNRSSVKTP	EPVVPTAPEL
QPSTSTDQPV	TSEPTYQATR	GRKNRSSVKT	PEPVVPTAPE	LRPSTSTDRP
VTPKPTSRTT	RSRTNMSSVK	TPETVVPTAP	ELQISTSTDQ	PVTPKPTSRT
TRSRTNMSSV	KNPESTVPIA	PELPPSTSTE	QPVTPEPTSR	ATRGRKNRSS
GKTPETLVPT	APKLEPSTST	DQPVTPEPTS	QATRGRTNRS	SVKTPETVVP
TAPELQPSTS	TDQPVTPEPT	SQATRGRTDR	SSVKTPETVV	PTAPELQASA
STDQPVTSEP	TSRTTRGRKN	RSSVKTPETV	VPAAPELQPS	TSTDQPVTPE
PTSRATRGRT	NRSSVKTPES	IVPIAPELQP	STSRNQLVTP	EPTSRATRCR
TNRSSVKTPE	PVVPTAPEPH	PTTSTDQPVT	PKLTSRATRR	KTNRSSVKTP
KPVEPAASDL	EPFTPTDQSV	TPEAIAQGGQ	SKTLRSSTVR	AMPVPTTPEF
QSPVTTDQPI	SPEPITQPSC	IKRQRAAGNP	GSLAAPIDHK	PCSAPLEPKS
QASRNQRWGA	VRAAESLTAI	PEPASPQLLE	TPIHASQIQK	VEPAGRSRFT
PELQPKASQS	RKRSLATMDS	PPHQKQPQRG	EVSQKTVIIK	EEEEDTAEKP
GKEEDVVTPK	PGKRKRDQAE	EEPNRIPSRS	LRRTKLNQES	TAPKVLFTGV
VDARGERAVL	ALGGSLAGSA	AEASHLVTDR	IRRTVKFLCA	LGRGIPILSL
DWLHQSRKAG	FFLPPDEYVV	TDPEQEKNFG	FSLQDALSRA	RERRLLEGYE
IYVTPGVQPP	PPQMGEIISC	CGGTYLPSMP	RSYKPQRVVI	TCPQDFPHCS
IPLRVGLPLL	SPEFLLTGVL	KQEAKPEAFV	LSPLEMSST

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинний цикл, пошкодження ДНК, репарація ДНК, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі, хромосомах.

Література

Nagase T., Seki N., Ishikawa K., Tanaka A., Nomura N. (1996). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. V. The coding sequences of 40 new genes (KIAA0161-KIAA0200) deduced by analysis of cDNA clones from human cell line KG-1. DNA Res. 3: 17—24. PMID 8724849 DOI:10.1093/dnares/3.1.17
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Shang Y.L., Bodero A.J., Chen P.-L. (2003). NFBD1, a novel nuclear protein with signature motifs of FHA and BRCT, and an internal 41-amino acid repeat sequence, is an early participant in DNA damage response. J. Biol. Chem. 278: 6323—6329. PMID 12475977 DOI:10.1074/jbc.M210749200
Xu X., Stern D.F. (2003). NFBD1/KIAA0170 is a chromatin-associated protein involved in DNA damage signaling pathways. J. Biol. Chem. 278: 8795—8803. PMID 12499369 DOI:10.1074/jbc.M211392200
Peng A., Chen P.-L. (2003). NFBD1, like 53BP1, is an early and redundant transducer mediating Chk2 phosphorylation in response to DNA damage. J. Biol. Chem. 278: 8873—8876. PMID 12551934 DOI:10.1074/jbc.C300001200
Lou Z., Chini C.C.S., Minter-Dykhouse K., Chen J. (2003). Mediator of DNA damage checkpoint protein 1 regulates BRCA1 localization and phosphorylation in DNA damage checkpoint control. J. Biol. Chem. 278: 13599—13602. PMID 12611903 DOI:10.1074/jbc.C300060200

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:21163 (англ.) . Архів оригіналу за 10 вересня 2015. Процитовано 6 вересня 2017. [Архівовано 2015-09-10 у Wayback Machine.]
↑ UniProt, Q14676 (англ.) . Архів оригіналу за 21 липня 2017. Процитовано 6 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 6

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:21163 (англ.) . Архів оригіналу за 10 вересня 2015. Процитовано 6 вересня 2017. [Архівовано 2015-09-10 у Wayback Machine.]

[UniProt-4] UniProt, Q14676 (англ.) . Архів оригіналу за 21 липня 2017. Процитовано 6 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]