MMP9

MMP9
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1GKC, 1GKD, 1ITV, 1L6J, 2OVX, 2OVZ, 2OW0, 2OW1, 2OW2, 4H1Q, 4H2E, 4H3X, 4H82, 4HMA, 4JIJ, 4JQG, 4WZV, 4XCT, 5CUH, 5I12
Ідентифікатори
Символи	MMP9, CLG4B, GELB, MANDP2, MMP-9, 92 kDa type IV collagenase, 92 kDa gelatinase, gelatinase B, matrix metallopeptidase 9
Зовнішні ІД	OMIM: 120361 MGI: 97011 HomoloGene: 3659 GeneCards: MMP9
Реагує на сполуку
cts-1027[1]
Онтологія гена Молекулярна функція • collagen binding • zinc ion binding • зв'язування з іоном металу • GO:0070122 peptidase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • identical protein binding • hydrolase activity • metallopeptidase activity • endopeptidase activity • serine-type endopeptidase activity • metalloendopeptidase activity Клітинна компонента • GO:0005578 Позаклітинна матриця • екзосома • міжклітинний простір • tertiary granule lumen • ficolin-1-rich granule lumen • extracellular region • collagen-containing extracellular matrix Біологічний процес • skeletal system development • negative regulation of cation channel activity • positive regulation of protein phosphorylation • endodermal cell differentiation • negative regulation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic signaling pathway • осифікація • negative regulation of intrinsic apoptotic signaling pathway • ephrin receptor signaling pathway • extracellular matrix disassembly • negative regulation of apoptotic process • протеоліз • macrophage differentiation • positive regulation of keratinocyte migration • positive regulation of apoptotic process • collagen catabolic process • positive regulation of release of cytochrome c from mitochondria • positive regulation of receptor binding • positive regulation of DNA binding • positive regulation of epidermal growth factor receptor signaling pathway • embryo implantation • leukocyte migration • positive regulation of vascular associated smooth muscle cell proliferation • extracellular matrix organization • positive regulation of cell migration • neutrophil degranulation • GO:0072353 cellular response to reactive oxygen species • cellular response to cadmium ion • cytokine-mediated signaling pathway • regulation of neuroinflammatory response • negative regulation of epithelial cell differentiation involved in kidney development • response to amyloid-beta Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	4318	17395
Ensembl	ENSG00000100985	ENSMUSG00000017737
UniProt	P14780	P41245
RefSeq (мРНК)	NM_004994	NM_013599
RefSeq (білок)	NP_004985	NP_038627
Локус (UCSC)	Хр. 20: 46.01 – 46.02 Mb	Хр. 2: 164.78 – 164.8 Mb
PubMed search	[2]	[3]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

MMP9 (англ. Matrix metallopeptidase 9) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 707 амінокислот, а молекулярна маса — 78 458^[5].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSLWQPLVLV		LLVLGCCFAA		PRQRQSTLVL		FPGDLRTNLT		DRQLAEEYLY
RYGYTRVAEM		RGESKSLGPA		LLLLQKQLSL		PETGELDSAT		LKAMRTPRCG
VPDLGRFQTF		EGDLKWHHHN		ITYWIQNYSE		DLPRAVIDDA		FARAFALWSA
VTPLTFTRVY		SRDADIVIQF		GVAEHGDGYP		FDGKDGLLAH		AFPPGPGIQG
DAHFDDDELW		SLGKGVVVPT		RFGNADGAAC		HFPFIFEGRS		YSACTTDGRS
DGLPWCSTTA		NYDTDDRFGF		CPSERLYTQD		GNADGKPCQF		PFIFQGQSYS
ACTTDGRSDG		YRWCATTANY		DRDKLFGFCP		TRADSTVMGG		NSAGELCVFP
FTFLGKEYST		CTSEGRGDGR		LWCATTSNFD		SDKKWGFCPD		QGYSLFLVAA
HEFGHALGLD		HSSVPEALMY		PMYRFTEGPP		LHKDDVNGIR		HLYGPRPEPE
PRPPTTTTPQ		PTAPPTVCPT		GPPTVHPSER		PTAGPTGPPS		AGPTGPPTAG
PSTATTVPLS		PVDDACNVNI		FDAIAEIGNQ		LYLFKDGKYW		RFSEGRGSRP
QGPFLIADKW		PALPRKLDSV		FEERLSKKLF		FFSGRQVWVY		TGASVLGPRR
LDKLGLGADV		AQVTGALRSG		RGKMLLFSGR		RLWRFDVKAQ		MVDPRSASEV
DRMFPGVPLD		THDVFQYREK		AYFCQDRFYW		RVSSRSELNQ		VDQVGYVTYD
ILQCPED

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, металопротеаз. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, іоном кальцію. Локалізований у позаклітинному матриксі. Також секретований назовні.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Sang Q.X., Birkedal-Hansen H., Van Wart H.E. (1995). Proteolytic and non-proteolytic activation of human neutrophil progelatinase B. Biochim. Biophys. Acta. 1251: 99—108. PMID 7669817 DOI:10.1016/0167-4838(95)00086-A
• Masure S., Proost P., van Damme J., Opdenakker G. (1991). Purification and identification of 91-kDa neutrophil gelatinase. Release by the activating peptide interleukin-8. Eur. J. Biochem. 198: 391—398. PMID 1645657 DOI:10.1111/j.1432-1033.1991.tb16027.x
• Cha H., Kopetzki E., Huber R., Lanzendoerfer M., Brandstetter H. (2002). Structural basis of the adaptive molecular recognition by MMP9. J. Mol. Biol. 320: 1065—1079. PMID 12126625 DOI:10.1016/S0022-2836(02)00558-2
• Sato H., Seiki M. (1993). Regulatory mechanism of 92 kDa type IV collagenase gene expression which is associated with invasiveness of tumor cells. Oncogene. 8: 395—405. PMID 8426746
• Ogata Y., Enghild J.J., Nagase H. (1992). Matrix metalloproteinase 3 (stromelysin) activates the precursor for the human matrix metalloproteinase 9. J. Biol. Chem. 267: 3581—3584. PMID 1371271

Примітки

1. Сполуки, які фізично взаємодіють з Matrix metallopeptidase 9 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
2. Human PubMed Reference:.
3. Mouse PubMed Reference:.
4. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:7176 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
5. UniProt, P14780 (англ.) . Архів оригіналу за 25 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

• Хромосома 20

Портал «Біологія»   Портал «Хімія»