NEDD4

NEDD4
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2KPZ, 2KQ0, 2M3O, 2XBB, 2XBF, 3B7Y, 4BBN, 4BE8, 4N7F, 4N7H, 5C91, 5AHT, 5C7J
Ідентифікатори
Символи	NEDD4, NEDD4-1, RPF1, neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 4, E3 ubiquitin protein ligase, NEDD4 E3 ubiquitin protein ligase
Зовнішні ІД	OMIM: 602278 MGI: 97297 HomoloGene: 136740 GeneCards: NEDD4
Онтологія гена
Молекулярна функція	• protein domain specific binding; • GO:0050372 ubiquitin-protein transferase activity; • sodium channel inhibitor activity; • beta-2 adrenergic receptor binding; • ubiquitin binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • RNA polymerase binding; • proline-rich region binding; • phosphoserine residue binding; • phosphothreonine residue binding; • ionotropic glutamate receptor binding; • transferase activity; • GO:1904264, GO:1904822, GO:0090622, GO:0090302 ubiquitin protein ligase activity;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • гіалоплазма; • комплекс Ґольджі; • мембрана; • ubiquitin ligase complex; • клітинна мембрана; • apicolateral plasma membrane; • cell cortex; • perinuclear region of cytoplasm; • Хроматин; • екзосома; • dendritic spine; • glutamatergic synapse; • postsynaptic cytosol;
Біологічний процес	• protein targeting to lysosome; • адаптивна імунна відповідь; • GO:1903364 positive regulation of protein catabolic process; • blood vessel morphogenesis; • negative regulation of sodium ion transport; • cellular response to UV; • endocardial cushion development; • negative regulation of vascular endothelial growth factor receptor signaling pathway; • protein K63-linked ubiquitination; • regulation of membrane potential; • negative regulation of sodium ion transmembrane transporter activity; • regulation of ion transmembrane transport; • negative regulation of transcription from RNA polymerase II promoter in response to UV-induced DNA damage; • outflow tract morphogenesis; • receptor internalization; • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II; • protein monoubiquitination; • receptor catabolic process; • нейробіологія розвитку; • regulation of dendrite morphogenesis; • response to calcium ion; • positive regulation of nucleocytoplasmic transport; • neuromuscular junction development; • Убіквітин-залежний протеоліз; • regulation of potassium ion transmembrane transporter activity; • lysosomal transport; • ubiquitin-dependent protein catabolic process via the multivesicular body sorting pathway; • positive regulation of phosphatidylinositol 3-kinase signaling; • progesterone receptor signaling pathway; • GO:0022415 viral process; • neuron projection development; • GO:1904739 regulation of synapse organization; • T cell activation; • regulation of macroautophagy; • glucocorticoid receptor signaling pathway; • protein polyubiquitination; • ubiquitin-dependent protein catabolic process; • proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	4734
	17999
	ENSG00000069869
	ENSMUSG00000032216
	P46934
	P46935
NM_001284338; NM_001284339; NM_001284340; NM_006154; NM_198400;
	NM_001329212
	NM_010890
NP_001271267; NP_001271268; NP_001271269; NP_001316141; NP_006145;
	NP_940682
	NP_035020; NP_001344927
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

NEDD4 (англ. Neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 4, E3 ubiquitin protein ligase) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 15-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 319 амінокислот, а молекулярна маса — 149 114^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAQSLRLHFA	ARRSNTYPLS	ETSGDDLDSH	VHMCFKRPTR	ISTSNVVQMK
LTPRQTALAP	LIKENVQSQE	RSSVPSSENV	NKKSSCLQIS	LQPTRYSGYL
QSSNVLADSD	DASFTCILKD	GIYSSAVVDN	ELNAVNDGHL	VSSPAICSGS
LSNFSTSDNG	SYSSNGSDFG	SCASITSGGS	YTNSVISDSS	SYTFPPSDDT
FLGGNLPSDS	TSNRSVPNRN	TTPCEIFSRS	TSTDPFVQDD	LEHGLEIMKL
PVSRNTKIPL	KRYSSLVIFP	RSPSTTRPTS	PTSLCTLLSK	GSYQTSHQFI
ISPSEIAHNE	DGTSAKGFLS	TAVNGLRLSK	TICTPGEVRD	IRPLHRKGSL
QKKIVLSNNT	PRQTVCEKSS	EGYSCVSVHF	TQRKAATLDC	ETTNGDCKPE
MSEIKLNSDS	EYIKLMHRTS	ACLPSSQNVD	CQININGELE	RPHSQMNKNH
GILRRSISLG	GAYPNISCLS	SLKHNCSKGG	PSQLLIKFAS	GNEGKVDNLS
RDSNRDCTNE	LSNSCKTRDD	FLGQVDVPLY	PLPTENPRLE	RPYTFKDFVL
HPRSHKSRVK	GYLRLKMTYL	PKTSGSEDDN	AEQAEELEPG	WVVLDQPDAA
CHLQQQQEPS	PLPPGWEERQ	DILGRTYYVN	HESRRTQWKR	PTPQDNLTDA
ENGNIQLQAQ	RAFTTRRQIS	EETESVDNRE	SSENWEIIRE	DEATMYSNQA
FPSPPPSSNL	DVPTHLAEEL	NARLTIFGNS	AVSQPASSSN	HSSRRGSLQA
YTFEEQPTLP	VLLPTSSGLP	PGWEEKQDER	GRSYYVDHNS	RTTTWTKPTV
QATVETSQLT	SSQSSAGPQS	QASTSDSGQQ	VTQPSEIEQG	FLPKGWEVRH
APNGRPFFID	HNTKTTTWED	PRLKIPAHLR	GKTSLDTSND	LGPLPPGWEE
RTHTDGRIFY	INHNIKRTQW	EDPRLENVAI	TGPAVPYSRD	YKRKYEFFRR
KLKKQNDIPN	KFEMKLRRAT	VLEDSYRRIM	GVKRADFLKA	RLWIEFDGEK
GLDYGGVARE	WFFLISKEMF	NPYYGLFEYS	ATDNYTLQIN	PNSGLCNEDH
LSYFKFIGRV	AGMAVYHGKL	LDGFFIRPFY	KMMLHKPITL	HDMESVDSEY
YNSLRWILEN	DPTELDLRFI	IDEELFGQTH	QHELKNGGSE	IVVTNKNKKE
YIYLVIQWRF	VNRIQKQMAA	FKEGFFELIP	QDLIKIFDEN	ELELLMCGLG
DVDVNDWREH	TKYKNGYSAN	HQVIQWFWKA	VLMMDSEKRI	RLLQFVTGTS
RVPMNGFAEL	YGSNGPQSFT	VEQWGTPEKL	PRAHTCFNRL	DLPPYESFEE
LWDKLQMAIE	NTQGFDGVD

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як взаємодія хазяїн-вірус, убіквітинування білків, нейрогенез, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, мембрані.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Pham N., Rotin D. (2001). Nedd4 regulates ubiquitination and stability of the guanine-nucleotide exchange factor CNrasGEF. J. Biol. Chem. 276: 46995—47003. PMID 11598133 DOI:10.1074/jbc.M108373200
Okumura A., Pitha P.M., Harty R.N. (2008). ISG15 inhibits Ebola VP40 VLP budding in an L-domain-dependent manner by blocking Nedd4 ligase activity. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 105: 3974—3979. PMID 18305167 DOI:10.1073/pnas.0710629105
Nabhan J.F., Pan H., Lu Q. (2010). Arrestin domain-containing protein 3 recruits the NEDD4 E3 ligase to mediate ubiquitination of the beta2-adrenergic receptor. EMBO Rep. 11: 605—611. PMID 20559325 DOI:10.1038/embor.2010.80
Qi S., O'Hayre M., Gutkind J.S., Hurley J.H. (2014). Structural and biochemical basis for ubiquitin ligase recruitment by arrestin-related domain-containing protein-3 (ARRDC3). J. Biol. Chem. 289: 4743—4752. PMID 24379409 DOI:10.1074/jbc.M113.527473

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:7727 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, P46934 (англ.) . Архів оригіналу за 7 серпня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 15

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:7727 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-4] UniProt, P46934 (англ.) . Архів оригіналу за 7 серпня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]