NRCAM

NRCAM
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1UEN, 1UEY
Ідентифікатори
Символи	NRCAM, neuronal cell adhesion molecule
Зовнішні ІД	OMIM: 601581 MGI: 104750 HomoloGene: 21041 GeneCards: NRCAM
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein binding involved in heterotypic cell-cell adhesion • ankyrin binding Клітинна компонента • integral component of membrane • cell projection • мембрана • клітинна мембрана • синапс • integral component of plasma membrane • extracellular region • аксон • neuron projection • axon initial segment • external side of plasma membrane • glutamatergic synapse • integral component of postsynaptic membrane • integral component of postsynaptic density membrane Біологічний процес • GO:0034613 protein localization • clustering of voltage-gated sodium channels • regulation of neuron projection development • regulation of axon extension • аксоноґенеза • heterotypic cell-cell adhesion • neuron migration • central nervous system development • адгезія клітин • neuronal action potential propagation • Ангіогенез • positive regulation of neuron differentiation • synapse assembly • axonal fasciculation • retinal ganglion cell axon guidance • axon guidance • cell-cell adhesion • regulation of postsynapse organization Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	4897	319504
Ensembl	ENSG00000091129	ENSMUSG00000020598
UniProt	Q92823	Q810U4
RefSeq (мРНК)	NM_001037132 NM_001037133 NM_001193582 NM_001193583 NM_001193584 NM_005010	NM_001146031 NM_176930
RefSeq (білок)	NP_001032209 NP_001180511 NP_001180512 NP_001180513 NP_005001 NP_001358048 NP_001358051 NP_001358052 NP_001358053 NP_001358054 NP_001358055 NP_001358056 NP_001358057 NP_001358058 NP_001358059 NP_001358060 NP_001358061 NP_001358062 NP_001358063 NP_001358064 NP_001358065 NP_001358066 NP_001358067 NP_001358068 NP_001358069 NP_001358070 NP_001358071 NP_001358072 NP_001358073 NP_001358074 NP_001358075 NP_001358076 NP_001358077 NP_001358078 NP_001358079 NP_001358080 NP_001358081 NP_001358082 NP_001358083 NP_001358084 NP_001358085 NP_001358086 NP_001358087 NP_001358088 NP_001358089 NP_001358090 NP_001358091 NP_001358092 NP_001358093 NP_001358094 NP_001358095 NP_001358096 NP_001358097 NP_001358098 NP_001358099 NP_001358100 NP_001358101 NP_001358102 NP_001358103 NP_001358104 NP_001358105 NP_001358106 NP_001358107 NP_001358108 NP_001358109 NP_001358110 NP_001358111	NP_001139503 NP_795904
Локус (UCSC)	Хр. 7: 108.15 – 108.46 Mb	Хр. 12: 44.33 – 44.6 Mb
PubMed search	[1]	[2]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

NRCAM (англ. Neuronal cell adhesion molecule) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 304 амінокислот, а молекулярна маса — 143 890^[4].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MQLKIMPKKK		RLSAGRVPLI		LFLCQMISAL		EVPLDPKLLE		DLVQPPTITQ
QSPKDYIIDP		RENIVIQCEA		KGKPPPSFSW		TRNGTHFDID		KDPLVTMKPG
TGTLIINIMS		EGKAETYEGV		YQCTARNERG		AAVSNNIVVR		PSRSPLWTKE
KLEPITLQSG		QSLVLPCRPP		IGLPPPIIFW		MDNSFQRLPQ		SERVSQGLNG
DLYFSNVLPE		DTREDYICYA		RFNHTQTIQQ		KQPISVKVIS		VDELNDTIAA
NLSDTEFYGA		KSSRERPPTF		LTPEGNASNK		EELRGNVLSL		ECIAEGLPTP
IIYWAKEDGM		LPKNRTVYKN		FEKTLQIIHV		SEADSGNYQC		IAKNALGAIH
HTISVRVKAA		PYWITAPQNL		VLSPGEDGTL		ICRANGNPKP		RISWLTNGVP
IEIAPDDPSR		KIDGDTIIFS		NVQERSSAVY		QCNASNEYGY		LLANAFVNVL
AEPPRILTPA		NTLYQVIANR		PALLDCAFFG		SPLPTIEWFK		GAKGSALHED
IYVLHENGTL		EIPVAQKDST		GTYTCVARNK		LGMAKNEVHL		EIKDPTWIVK
QPEYAVVQRG		SMVSFECKVK		HDHTLSLTVL		WLKDNRELPS		DERFTVDKDH
LVVADVSDDD		SGTYTCVANT		TLDSVSASAV		LSVVAPTPTP		APVYDVPNPP
FDLELTDQLD		KSVQLSWTPG		DDNNSPITKF		IIEYEDAMHK		PGLWHHQTEV
SGTQTTAQLK		LSPYVNYSFR		VMAVNSIGKS		LPSEASEQYL		TKASEPDKNP
TAVEGLGSEP		DNLVITWKPL		NGFESNGPGL		QYKVSWRQKD		GDDEWTSVVV
ANVSKYIVSG		TPTFVPYLIK		VQALNDMGFA		PEPAVVMGHS		GEDLPMVAPG
NVRVNVVNST		LAEVHWDPVP		LKSIRGHLQG		YRIYYWKTQS		SSKRNRRHIE
KKILTFQGSK		THGMLPGLEP		FSHYTLNVRV		VNGKGEGPAS		PDRVFNTPEG
VPSAPSSLKI		VNPTLDSLTL		EWDPPSHPNG		ILTEYTLKYQ		PINSTHELGP
LVDLKIPANK		TRWTLKNLNF		STRYKFYFYA		QTSAGSGSQI		TEEAVTTVDE
AGILPPDVGA		GKVQAVNPRI		SNLTAAAAET		YANISWEYEG		PEHVNFYVEY
GVAGSKEEWR		KEIVNGSRSF		FGLKGLMPGT		AYKVRVGAVG		DSGFVSSEDV
FETGPAMASR		QVDIATQGWF		IGLMCAVALL		ILILLIVCFI		RRNKGGKYPV
KEKEDAHADP		EIQPMKEDDG		TFGEYSDAED		HKPLKKGSRT		PSDRTVKKED
SDDSLVDYGE		GVNGQFNEDG		SFIGQYSGKK		EKEPAEGNES		SEAPSPVNAM
NSFV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних відростках. Також секретований назовні.

Література

• Dry K., Kenwrick S., Rosenthal A., Platzer M. (2001). The complete sequence of the human locus for NgCAM-related cell adhesion molecule reveals a novel alternative exon in chick and man and conserved genomic organization for the L1 subfamily. Gene. 273: 115—122. PMID 11483367 DOI:10.1016/S0378-1119(01)00493-0
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

1. Human PubMed Reference:.
2. Mouse PubMed Reference:.
3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:7994 (англ.) . Процитовано 7 вересня 2017.
4. UniProt, Q92823 (англ.) . Архів оригіналу за 20 жовтня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.

Див. також

• Хромосома 7

Портал «Біологія»   Портал «Хімія»