NUDT5

NUDT5
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2DSB, 2DSC, 2DSD, 3AC9, 3ACA, 3BM4, 3L85
Ідентифікатори
Символи	NUDT5, YSA1, YSA1H, YSAH1, hYSAH1, nudix hydrolase 5, hNUDT5
Зовнішні ІД	OMIM: 609230 MGI: 1858232 HomoloGene: 5388 GeneCards: NUDT5
шифр КФ	3.6.1.58
Онтологія гена
Молекулярна функція	• m7G(5')pppN diphosphatase activity; • hydrolase activity; • magnesium ion binding; • зв'язування з іоном металу; • nucleoside-diphosphatase activity; • RNA binding; • ADP-sugar diphosphatase activity; • snoRNA binding; • 8-oxo-dGDP phosphatase activity; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • transferase activity; • ADP-ribose diphosphatase activity; • protein homodimerization activity; • nucleotidyltransferase activity;
Клітинна компонента	• гіалоплазма; • екзосома; • внутрішньоклітинний; • клітинне ядро;
Біологічний процес	• nucleobase-containing small molecule catabolic process; • ribonucleoside diphosphate catabolic process; • nucleobase-containing compound metabolic process; • nucleotide metabolic process; • D-ribose catabolic process; • ремоделювання хроматину; • ATP generation from poly-ADP-D-ribose; • nucleoside phosphate metabolic process; • ribose phosphate metabolic process;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	11164
	53893
	ENSG00000165609
	ENSMUSG00000025817
	Q9UKK9
	Q9JKX6
	NM_014142; NM_001321647; NM_001321648
	NM_016918
	NP_001308576; NP_001308577; NP_054861
	NP_058614
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

NUDT5 (англ. Nudix hydrolase 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 10-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 219 амінокислот, а молекулярна маса — 24 328^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MESQEPTESS	QNGKQYIISE	ELISEGKWVK	LEKTTYMDPT	GKTRTWESVK
RTTRKEQTAD	GVAVIPVLQR	TLHYECIVLV	KQFRPPMGGY	CIEFPAGLID
DGETPEAAAL	RELEEETGYK	GDIAECSPAV	CMDPGLSNCT	IHIVTVTING
DDAENARPKP	KPGDGEFVEV	ISLPKNDLLQ	RLDALVAEEH	LTVDARVYSY
ALALKHANAK	PFEVPFLKF

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, гідролаз, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як ацетилювання. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном магнію, РНК. Локалізований у ядрі.

Література

Gasmi L., Cartwright J.L., McLennan A.G. (1999). Cloning, expression and characterization of YSA1H, a human adenosine 5'-diphosphosugar pyrophosphatase possessing a MutT motif. Biochem. J. 344: 331—337. PMID 10567213 doi:10.1042/bj3440331
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Zha M., Zhong C., Peng Y., Hu H., Ding J. (2006). Crystal structures of human NUDT5 reveal insights into the structural basis of the substrate specificity. J. Mol. Biol. 364: 1021—1033. PMID 17052728 doi:10.1016/j.jmb.2006.09.078

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:8052 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q9UKK9 (англ.) . Архів оригіналу за 20 липня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 10

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:8052 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-4] UniProt, Q9UKK9 (англ.) . Архів оригіналу за 20 липня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]