PCBP2

PCBP2
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2AXY, 2JZX, 2P2R, 2PQU, 2PY9
Ідентифікатори
Символи	PCBP2, HNRNPE2, HNRPE2, hnRNP-E2, poly(rC) binding protein 2
Зовнішні ІД	OMIM: 601210 MGI: 108202 HomoloGene: 74536 GeneCards: PCBP2
Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding; • enzyme binding; • nucleic acid binding; • ubiquitin protein ligase binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • RNA binding; • C-rich single-stranded DNA binding;
Клітинна компонента	• екзосома; • мембрана; • focal adhesion; • нуклеоплазма; • цитоплазма; • клітинне ядро; • гіалоплазма; • GO:0097483, GO:0097481 постсинаптичне ущільнення;
Біологічний процес	• mRNA splicing, via spliceosome; • negative regulation of defense response to virus; • proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process; • defense response to virus; • mRNA metabolic process; • negative regulation of type I interferon production; • процес імунної системи; • вроджений імунітет; • viral RNA genome replication; • IRES-dependent viral translational initiation; • RNA metabolic process;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ; ; ;
	Більше даних
Ортологи
	5094
	18521
	ENSG00000197111
	ENSMUSG00000056851
	Q15366
	Q61990
NM_031989; NM_001098620; NM_001128911; NM_001128912; NM_001128913;
	NM_001128914; NM_005016
	NM_001103165; NM_001103166; NM_001174073; NM_011042
NP_001092090; NP_001122383; NP_001122384; NP_001122385; NP_001122386;
	NP_005007; NP_114366
	NP_001096635; NP_001096636; NP_001167544; NP_035172; NP_001361700
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

PCBP2 (англ. Poly(rC) binding protein 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 365 амінокислот, а молекулярна маса — 38 580^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MDTGVIEGGL	NVTLTIRLLM	HGKEVGSIIG	KKGESVKKMR	EESGARINIS
EGNCPERIIT	LAGPTNAIFK	AFAMIIDKLE	EDISSSMTNS	TAASRPPVTL
RLVVPASQCG	SLIGKGGCKI	KEIRESTGAQ	VQVAGDMLPN	STERAITIAG
IPQSIIECVK	QICVVMLETL	SQSPPKGVTI	PYRPKPSSSP	VIFAGGQDRY
STGSDSASFP	HTTPSMCLNP	DLEGPPLEAY	TIQGQYAIPQ	PDLTKLHQLA
MQQSHFPMTH	GNTGFSGIES	SSPEVKGYWG	LDASAQTTSH	ELTIPNDLIG
CIIGRQGAKI	NEIRQMSGAQ	IKIANPVEGS	TDRQVTITGS	AASISLAQYL
INVRLSSETG	GMGSS

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рибонуклеопротеїнів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як імунітет, вроджений імунітет, реплікація вірусних РНК, противірусний захист, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК, РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

Leffers H., Dejgaard K., Celis J.E. (1995). Characterisation of two major cellular poly(rC)-binding human proteins, each containing three K-homologous (KH) domains. Eur. J. Biochem. 230: 447—453. PMID 7607214 DOI:10.1111/j.1432-1033.1995.0447h.x
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Walter B.L., Parsley T.B., Ehrenfeld E., Semler B.L. (2002). Distinct poly(rC) binding protein KH domain determinants for poliovirus translation initiation and viral RNA replication. J. Virol. 76: 12008—12022. PMID 12414943 DOI:10.1128/JVI.76.23.12008-12022.2002
Chase A.J., Daijogo S., Semler B.L. (2014). Inhibition of poliovirus-induced cleavage of cellular protein PCBP2 reduces the levels of viral RNA replication. J. Virol. 88: 3192—3201. PMID 24371074 DOI:10.1128/JVI.02503-13
Du Z., Fenn S., Tjhen R., James T.L. (2008). Structure of a construct of a human poly(C)-binding protein containing the first and second KH domains reveals insights into its regulatory mechanisms. J. Biol. Chem. 283: 28757—28766. PMID 18701464 DOI:10.1074/jbc.M803046200

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:8648 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q15366 (англ.) . Архів оригіналу за 24 серпня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 12

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:8648 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-4] UniProt, Q15366 (англ.) . Архів оригіналу за 24 серпня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]