PCDHAC2

PCDHAC2
Ідентифікатори
Символи	PCDHAC2, PCDH-ALPHA-C2, protocadherin alpha subfamily C, 2
Зовнішні ІД	OMIM: 606321 MGI: 1891443 HomoloGene: 49562 GeneCards: PCDHAC2
Онтологія гена Молекулярна функція • calcium ion binding Клітинна компонента • integral component of membrane • клітинна мембрана • integral component of plasma membrane • мембрана Біологічний процес • адгезія клітин • homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules • cell-cell signaling • нейробіологія розвитку Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	56134	353237
Ensembl	ENSG00000243232	ENSMUSG00000102697
UniProt	Q9Y5I4	Q91Y09
RefSeq (мРНК)	NM_031883 NM_018899	NM_001003672
RefSeq (білок)	NP_061722 NP_114089	NP_001003672
Локус (UCSC)	Хр. 5: 140.97 – 141.01 Mb	Хр. 18: 37.28 – 37.32 Mb
PubMed search	[1]	[2]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

PCDHAC2 (англ. Protocadherin alpha subfamily C, 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 007 амінокислот, а молекулярна маса — 109 450^[4].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MEQAGTRPAA		TEHPRLRRPM		PWLLLLPLLL		LLLLLLPGPA		ASQLRYSVPE
EQAPGALVGN		VARALGLELR		RLGPGCLRIN		HLGAPSPRYL		ELDLTSGALF
VNERIDREAL		CEQRPRCLLS		LEVLAHNPVA		VSAVEVEILD		INDNSPRFPR
PNYQLQVSES		VAPGARFHIE		SAQDPDVGAN		SVQTYELSPS		EHFELDLKPL
QENSKVLELV		LRKGLDREQA		ALHHLVLTAV		DGGIPARSGT		AQISVRVLDT
NDNSPAFDQS		TYRVQLREDS		PPGTLVVKLN		ASDPDEGSNG		ELRYSLSSYT
SDRERQLFSI		DASTGEVRVI		GGLDYEEASS		YQIYVQATDR		GPVPMAGHCK
VLVDIVDVND		NAPEVVLTDL		YSPVPENATP		NTIVAVLSVN		DQDSGPNRKV
SLGLEATLPF		RLNGFGNSYT		LVVSGPLDRE		RVAVYNITVT		ATDGGIPQLT
SLRTLKVEIS		DINDNPPSFL		EDSYSIYIQE		NNLPGVLLCT		VQATDPDEKE
NAEVTYSLLE		REIQGLPVTS		YVSINSASGS		LYAVNSFDYE		KFREFFVTVE
AQDKGSPPLS		STVTANVYVV		DMNDHAPHIL		YPTSTNSSAA		FEMVPRTAPA
GYLVTKVIAM		DSDSGQNAWL		FYHLAQTSDL		DLFKVELHTG		EIRTTRKMGD
ESGSTFNLTV		VVRDNGEPSL		SASVAITVAV		VDRVSKILPD		TQRHVKSPRT
YSEITLYLII		ALSTVSFIFL		LTIIILSIIK		CYRYTAYGTA		CCGGFCGVRE
RSPAELYKQA		NNNIDARIPH		GLKVQPHFIE		VRGNGSLTKT		YCYKACLTAG
SGSDTFMFYN		TGAQTGPGPS		GAQAAVTDSR		NLTGQSGQNA		GNLIILKNEA
VSQNEPRQPN		PDWRYSASLR		AGMHSSVHLE		EAGILRAGPG		GPDQQWPTVS
SATPEPEAGE		VSPPVGAGVN		SNSWTFKYGP		GNPKQSGPGE		LPDKFIIPGS
PAIISIRQEP		TNSQIDKSDF		ITFGKKEETK		KKKKKKKGNK		TQEKKEKGNS
TTDNSDQ

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

• Wu Q., Maniatis T. (1999). A striking organization of a large family of human neural cadherin-like cell adhesion genes. Cell. 97: 779—790. PMID 10380929 DOI:10.1016/S0092-8674(00)80789-8
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

1. Human PubMed Reference:.
2. Mouse PubMed Reference:.
3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:8677 (англ.) . Процитовано 5 вересня 2017.
4. UniProt, Q9Y5I4 (англ.) . Архів оригіналу за 4 лютого 2017. Процитовано 5 вересня 2017.

Див. також

• Хромосома 5

Портал «Біологія»   Портал «Хімія»