PDCD6

PDCD6
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2ZN8, 2ZN9, 2ZND, 2ZNE, 2ZRS, 2ZRT, 3AAJ, 3AAK, 3WXA
Ідентифікатори
Символи	PDCD6, ALG-2, PEF1B, ALG2, programmed cell death 6
Зовнішні ІД	OMIM: 601057 MGI: 109283 HomoloGene: 7880 GeneCards: PDCD6
Онтологія гена
Молекулярна функція	• protein dimerization activity; • protein-membrane adaptor activity; • calcium-dependent protein binding; • зв'язування з іоном металу; • calcium-dependent cysteine-type endopeptidase activity; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • identical protein binding; • GO:0032947 molecular adaptor activity; • magnesium ion binding; • calcium ion binding; • protein homodimerization activity; • protein-macromolecule adaptor activity;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • ендосома; • endoplasmic reticulum membrane; • мембрана; • ендоплазматичний ретикулум; • екзосома; • клітинне ядро; • Golgi membrane; • COPII vesicle coat; • Cul3-RING ubiquitin ligase complex; • endoplasmic reticulum exit site; • ER to Golgi transport vesicle membrane; • GO:0016023 cytoplasmic vesicle;
Біологічний процес	• negative regulation of protein kinase B signaling; • cellular response to heat; • vascular endothelial growth factor receptor-2 signaling pathway; • positive regulation of endothelial cell proliferation; • negative regulation of vascular endothelial growth factor receptor signaling pathway; • positive regulation of angiogenesis; • positive regulation of endothelial cell migration; • response to calcium ion; • negative regulation of TOR signaling; • positive regulation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process; • Ангіогенез; • apoptotic signaling pathway; • intracellular protein transport; • activation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process; • GO:0097285 апоптоз; • протеоліз; • endoplasmic reticulum to Golgi vesicle-mediated transport; • neural crest formation; • neural crest cell development; • COPII vesicle coating; • positive regulation of protein monoubiquitination;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	10016
	18570
	ENSG00000249915
	ENSMUSG00000021576
	O75340
	P12815
	NM_001267556; NM_001267557; NM_001267558; NM_001267559; NM_013232
	NM_011051; NM_001359996
	NP_001254485; NP_001254486; NP_001254487; NP_001254488; NP_037364
	NP_035181; NP_001346925
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

PDCD6 (англ. Programmed cell death 6) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 191 амінокислот, а молекулярна маса — 21 868^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAAYSYRPGP	GAGPGPAAGA	ALPDQSFLWN	VFQRVDKDRS	GVISDTELQQ
ALSNGTWTPF	NPVTVRSIIS	MFDRENKAGV	NFSEFTGVWK	YITDWQNVFR
TYDRDNSGMI	DKNELKQALS	GFGYRLSDQF	HDILIRKFDR	QGRGQIAFDD
FIQGCIVLQR	LTDIFRRYDT	DQDGWIQVSY	EQYLSMVFSI	V

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як апоптоз, ангіогенез, ацетилювання, альтернативний сплайсинг, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію, іоном магнію. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, мембрані, ендоплазматичному ретикулумі, цитоплазматичних везикулах, ендосомах.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Kitaura Y., Matsumoto S., Satoh H., Hitomi K., Maki M. (2001). Peflin and ALG-2, members of the penta-EF-hand protein family, form a heterodimer that dissociates in a Ca2+-dependent manner. J. Biol. Chem. 276: 14053—14058. PMID 11278427 DOI:10.1074/jbc.M008649200
Kitaura Y., Satoh H., Takahashi H., Shibata H., Maki M. (2002). Both ALG-2 and peflin, penta-EF-hand (PEF) proteins, are stabilized by dimerization through their fifth EF-hand regions. Arch. Biochem. Biophys. 399: 12—18. PMID 11883899 DOI:10.1006/abbi.2001.2736
Satoh H., Shibata H., Nakano Y., Kitaura Y., Maki M. (2002). ALG-2 interacts with the amino-terminal domain of annexin XI in a Ca(2+)-dependent manner. Biochem. Biophys. Res. Commun. 291: 1166—1172. PMID 11883939 DOI:10.1006/bbrc.2002.6600
Lee J.H., Rho S.B., Chun T. (2005). Programmed cell death 6 (PDCD6) protein interacts with death-associated protein kinase 1 (DAPk1): additive effect on apoptosis via caspase-3 dependent pathway. Biotechnol. Lett. 27: 1011—1015. PMID 16132846 DOI:10.1007/s10529-005-7869-x
Yamasaki A., Tani K., Yamamoto A., Kitamura N., Komada M. (2006). The Ca2+-binding protein ALG-2 is recruited to endoplasmic reticulum exit sites by Sec31A and stabilizes the localization of Sec31A. Mol. Biol. Cell. 17: 4876—4887. PMID 16957052 DOI:10.1091/mbc.E06-05-0444

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:8765 (англ.) . Процитовано 5 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, O75340 (англ.) . Архів оригіналу за 22 липня 2017. Процитовано 5 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 5

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:8765 (англ.) . Процитовано 5 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-4] UniProt, O75340 (англ.) . Архів оригіналу за 22 липня 2017. Процитовано 5 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]