PDS5A

PDS5A
Ідентифікатори
Символи	PDS5A, SCC-112, SCC112, PIG54, PDS5 cohesin associated factor A
Зовнішні ІД	OMIM: 613200 MGI: 1918771 HomoloGene: 22877 GeneCards: PDS5A
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • гіалоплазма • Хроматин • клітинна мембрана • центромера • нуклеоплазма • хромосома • клітинне ядро Біологічний процес • поділ клітини • клітинний цикл • negative regulation of DNA replication • mitotic sister chromatid cohesion • GO:0100026 Репарація ДНК Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	23244	71521
Ensembl	ENSG00000121892	ENSMUSG00000029202
UniProt	Q29RF7	Q6A026
RefSeq (мРНК)	NM_001100399 NM_001100400 NM_015200	NM_001081321 NM_027818
RefSeq (білок)	NP_001093869 NP_001093870	н/д
Локус (UCSC)	Хр. 4: 39.82 – 39.98 Mb	Хр. 5: 65.76 – 65.86 Mb
PubMed search	[1]	[2]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

PDS5A (англ. PDS5 cohesin associated factor A) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 337 амінокислот, а молекулярна маса — 150 830^[4].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MDFTAQPKPA		TALCGVVSAD		GKIAYPPGVK		EITDKITTDE		MIKRLKMVVK
TFMDMDQDSE		DEKQQYLPLA		LHLASEFFLR		NPNKDVRLLV		ACCLADIFRI
YAPEAPYTSH		DKLKDIFLFI		TRQLKGLEDT		KSPQFNRYFY		LLENLAWVKS
YNICFELEDC		NEIFIQLFRT		LFSVINNSHN		KKVQMHMLDL		MSSIIMEGDG
VTQELLDSIL		INLIPAHKNL		NKQSFDLAKV		LLKRTVQTIE		ACIANFFNQV
LVLGRSSVSD		LSEHVFDLIQ		ELFAIDPHLL		LSVMPQLEFK		LKSNDGEERL
AVVRLLAKLF		GSKDSDLATQ		NRPLWQCFLG		RFNDIHVPVR		LESVKFASHC
LMNHPDLAKD		LTEYLKVRSH		DPEEAIRHDV		IVTIITAAKR		DLALVNDQLL
GFVRERTLDK		RWRVRKEAMM		GLAQLYKKYC		LHGEAGKEAA		EKVSWIKDKL
LHIYYQNSID		DKLLVEKIFA		QYLVPHNLET		EERMKCLYYL		YASLDPNAVK
ALNEMWKCQN		MLRSHVRELL		DLHKQPTSEA		NCSAMFGKLM		TIAKNLPDPG
KAQDFVKKFN		QVLGDDEKLR		SQLELLISPT		CSCKQADICV		REIARKLANP
KQPTNPFLEM		VKFLLERIAP		VHIDSEAISA		LVKLMNKSIE		GTADDEEEGV
SPDTAIRSGL		ELLKVLSFTH		PTSFHSAETY		ESLLQCLRME		DDKVAEAAIQ
IFRNTGHKIE		TDLPQIRSTL		IPILHQKAKR		GTPHQAKQAV		HCIHAIFTNK
EVQLAQIFEP		LSRSLNADVP		EQLITPLVSL		GHISMLAPDQ		FASPMKSVVA
NFIVKDLLMN		DRSTGEKNGK		LWSPDEEVSP		EVLAKVQAIK		LLVRWLLGMK
NNQSKSANST		LRLLSAMLVS		EGDLTEQKRI		SKSDMSRLRL		AAGSAIMKLA
QEPCYHEIIT		PEQFQLCALV		INDECYQVRQ		IFAQKLHKAL		VKLLLPLEYM
AIFALCAKDP		VKERRAHARQ		CLLKNISIRR		EYIKQNPMAT		EKLLSLLPEY
VVPYMIHLLA		HDPDFTRSQD		VDQLRDIKEC		LWFMLEVLMT		KNENNSHAFM
KKMAENIKLT		RDAQSPDESK		TNEKLYTVCD		VALCVINSKS		ALCNADSPKD
PVLPMKFFTQ		PEKDFCNDKS		YISEETRVLL		LTGKPKPAGV		LGAVNKPLSA
TGRKPYVRST		GTETGSNINV		NSELNPSTGN		RSREQSSEAA		ETGVSENEEN
PVRIISVTPV		KNIDPVKNKE		INSDQATQGN		ISSDRGKKRT		VTAAGAENIQ
QKTDEKVDES		GPPAPSKPRR		GRRPKSESQG		NATKNDDLNK		PINKGRKRAA
VGQESPGGLE		AGNAKAPKLQ		DLAKKAAPAE		RQIDLQR

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах як клітинний цикл, поділ клітини, мітоз. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Sumara I., Vorlaufer E., Gieffers C., Peters B.H., Peters J.-M. (2000). Characterization of vertebrate cohesin complexes and their regulation in prophase. J. Cell Biol. 151: 749—762. PMID 11076961 DOI:10.1083/jcb.151.4.749
• Losada A., Yokochi T., Hirano T. (2005). Functional contribution of Pds5 to cohesin-mediated cohesion in human cells and Xenopus egg extracts. J. Cell Sci. 118: 2133—2141. PMID 15855230 DOI:10.1242/jcs.02355
• Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
• Zheng M.Z., Zheng L.M., Zeng Y.X. (2008). SCC-112 gene is involved in tumor progression and promotes the cell proliferation in G2/M phase. J. Cancer Res. Clin. Oncol. 134: 453—462. PMID 17846787 DOI:10.1007/s00432-007-0306-x
• Terret M.E., Sherwood R., Rahman S., Qin J., Jallepalli P.V. (2009). Cohesin acetylation speeds the replication fork. Nature. 462: 231—234. PMID 19907496 DOI:10.1038/nature08550

Примітки

1. Human PubMed Reference:.
2. Mouse PubMed Reference:.
3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:29088 (англ.) . Процитовано 21 серпня 2017.
4. UniProt, Q29RF7 (англ.) . Архів оригіналу за 9 лютого 2017. Процитовано 21 серпня 2017.

Див. також

• Хромосома 4

Портал «Біологія»   Портал «Хімія»