PIKFYVE

PIKFYVE
Ідентифікатори
Символи	PIKFYVE, CFD, FAB1, HEL37, PIP5K, PIP5K3, ZFYVE29, phosphoinositide kinase, FYVE-type zinc finger containing
Зовнішні ІД	OMIM: 609414 MGI: 1335106 HomoloGene: 32115 GeneCards: PIKFYVE
Пов'язані генетичні захворювання
fleck corneal dystrophy[1]
Онтологія гена Молекулярна функція • transferase activity • nucleotide binding • zinc ion binding • 1-phosphatidylinositol-4-phosphate 5-kinase activity • зв'язування з іоном металу • kinase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • phosphatidylinositol phosphate kinase activity • ATP binding • phosphatidylinositol-3,5-bisphosphate 5-phosphatase activity • 1-phosphatidylinositol-3-phosphate 5-kinase activity • білки, що розгортають шаперонну активність • розгорнуте білкове зв’язування Клітинна компонента • гіалоплазма • ендосома • early endosome membrane • мембрана • late endosome membrane • cell-cell junction • vesicle membrane • Golgi membrane • perinuclear region of cytoplasm • membrane raft • endosome membrane • GO:0016023 cytoplasmic vesicle Біологічний процес • GO:0007243 intracellular signal transduction • phosphatidylinositol metabolic process • фосфорилювання • myelin assembly • рецептор-опосередкований ендоцитоз • regulation of autophagosome assembly • phosphatidylinositol phosphate biosynthetic process • retrograde transport, endosome to Golgi • phosphatidylinositol 5-phosphate metabolic process • protein localization to nucleus • phosphatidylinositol biosynthetic process • phosphatidylinositol-3-phosphate biosynthetic process • 'de novo' protein folding • chaperone-mediated protein folding • згортання білків Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	200576	18711
Ensembl	ENSG00000115020	ENSMUSG00000025949
UniProt	Q9Y2I7	Q9Z1T6
RefSeq (мРНК)	NM_001002881 NM_001178000 NM_015040 NM_152671	NM_011086 NM_001310624
RefSeq (білок)	NP_001171471 NP_055855 NP_689884	NP_001297553 NP_035216
Локус (UCSC)	Хр. 2: 208.27 – 208.36 Mb	Хр. 1: 65.23 – 65.32 Mb
PubMed search	[2]	[3]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

PIKFYVE (англ. Phosphoinositide kinase, FYVE-type zinc finger containing) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. ^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 098 амінокислот, а молекулярна маса — 237 136^[5].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MATDDKTSPT		LDSANDLPRS		PTSPSHLTHF		KPLTPDQDEP		PFKSAYSSFV
NLFRFNKERA		EGGQGEQQPL		SGSWTSPQLP		SRTQSVRSPT		PYKKQLNEEL
QRRSSALDTR		RKAEPTFGGH		DPRTAVQLRS		LSTVLKRLKE		IMEGKSQDSD
LKQYWMPDSQ		CKECYDCSEK		FTTFRRRHHC		RLCGQIFCSR		CCNQEIPGKF
MGYTGDLRAC		TYCRKIALSY		AHSTDSNSIG		EDLNALSDSA		CSVSVLDPSE
PRTPVGSRKA		SRNIFLEDDL		AWQSLIHPDS		SNTPLSTRLV		SVQEDAGKSP
ARNRSASITN		LSLDRSGSPM		VPSYETSVSP		QANRTYVRTE		TTEDERKILL
DSVQLKDLWK		KICHHSSGME		FQDHRYWLRT		HPNCIVGKEL		VNWLIRNGHI
ATRAQAIAIG		QAMVDGRWLD		CVSHHDQLFR		DEYALYRPLQ		STEFSETPSP
DSDSVNSVEG		HSEPSWFKDI		KFDDSDTEQI		AEEGDDNLAN		SASPSKRTSV
SSFQSTVDSD		SAASISLNVE		LDNVNFHIKK		PSKYPHVPPH		PADQKEYLIS
DTGGQQLSIS		DAFIKESLFN		RRVEEKSKEL		PFTPLGWHHN		NLELLREENG
EKQAMERLLS		ANHNHMMALL		QQLLHSDSLS		SSWRDIIVSL		VCQVVQTVRP
DVKNQDDDMD		IRQFVHIKKI		PGGKKFDSVV		VNGFVCTKNI		AHKKMSSCIK
NPKILLLKCS		IEYLYREETK		FTCIDPIVLQ		EREFLKNYVQ		RIVDVRPTLV
LVEKTVSRIA		QDMLLEHGIT		LVINVKSQVL		ERISRMTQGD		LVMSMDQLLT
KPHLGTCHKF		YMQIFQLPNE		QTKTLMFFEG		CPQHLGCTIK		LRGGSDYELA
RVKEILIFMI		CVAYHSQLEI		SFLMDEFAMP		PTLMQNPSFH		SLIEGRGHEG
AVQEQYGGGS		IPWDPDIPPE		SLPCDDSSLL		ELRIVFEKGE		QENKNLPQAV
ASVKHQEHST		TACPAGLPCA		FFAPVPESLL		PLPVDDQQDA		LGSEQPETLQ
QTVVLQDPKS		QIRAFRDPLQ		DDTGLYVTEE		VTSSEDKRKT		YSLAFKQELK
DVILCISPVI		TFREPFLLTE		KGMRCSTRDY		FAEQVYWSPL		LNKEFKEMEN
RRKKQLLRDL		SGLQGMNGSI		QAKSIQVLPS		HELVSTRIAE		HLGDSQSLGR
MLADYRARGG		RIQPKNSDPF		AHSKDASSTS		SGQSGSKNEG		DEERGLILSD
AVWSTKVDCL		NPINHQRLCV		LFSSSSAQSS		NAPSACVSPW		IVTMEFYGKN
DLTLGIFLER		YCFRPSYQCP		SMFCDTPMVH		HIRRFVHGQG		CVQIILKELD
SPVPGYQHTI		LTYSWCRICK		QVTPVVALSN		ESWSMSFAKY		LELRFYGHQY
TRRANAEPCG		HSIHHDYHQY		FSYNQMVASF		SYSPIRLLEV		CVPLPKIFIK
RQAPLKVSLL		QDLKDFFQKV		SQVYVAIDER		LASLKTDTFS		KTREEKMEDI
FAQKEMEEGE		FKNWIEKMQA		RLMSSSVDTP		QQLQSVFESL		IAKKQSLCEV
LQAWNNRLQD		LFQQEKGRKR		PSVPPSPGRL		RQGEESKISA		MDASPRNISP
GLQNGEKEDR		FLTTLSSQSS		TSSTHLQLPT		PPEVMSEQSV		GGPPELDTAS
SSEDVFDGHL		LGSTDSQVKE		KSTMKAIFAN		LLPGNSYNPI		PFPFDPDKHY
LMYEHERVPI		AVCEKEPSSI		IAFALSCKEY		RNALEELSKA		TQWNSAEEGL
PTNSTSDSRP		KSSSPIRLPE		MSGGQTNRTT		ETEPQPTKKA		SGMLSFFRGT
AGKSPDLSSQ		KRETLRGADS		AYYQVGQTGK		EGTENQGVEP		QDEVDGGDTQ
KKQLINPHVE		LQFSDANAKF		YCRLYYAGEF		HKMREVILDS		SEEDFIRSLS
HSSPWQARGG		KSGAAFYATE		DDRFILKQMP		RLEVQSFLDF		APHYFNYITN
AVQQKRPTAL		AKILGVYRIG		YKNSQNNTEK		KLDLLVMENL		FYGRKMAQVF
DLKGSLRNRN		VKTDTGKESC		DVVLLDENLL		KMVRDNPLYI		RSHSKAVLRT
SIHSDSHFLS		SHLIIDYSLL		VGRDDTSNEL		VVGIIDYIRT		FTWDKKLEMV
VKSTGILGGQ		GKMPTVVSPE		LYRTRFCEAM		DKYFLMVPDH		WTGLGLNC

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, кіназ, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як поліморфізм, ацетиляція, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, іонами металів, іоном цинку. Локалізований у мембрані, ендосомах.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
• Sbrissa D., Ikonomov O.C., Shisheva A. (2002). Phosphatidylinositol 3-phosphate-interacting domains in PIKfyve. Binding specificity and role in PIKfyve endomembrane localization. J. Biol. Chem. 277: 6073—6079. PMID 11706043 doi:10.1074/jbc.M110194200
• Sbrissa D., Ikonomov O.C., Fenner H., Shisheva A. (2008). ArPIKfyve homomeric and heteromeric interactions scaffold PIKfyve and Sac3 in a complex to promote PIKfyve activity and functionality. J. Mol. Biol. 384: 766—779. PMID 18950639 doi:10.1016/j.jmb.2008.10.009
• Hill E.V., Hudson C.A., Vertommen D., Rider M.H., Tavare J.M. (2010). Regulation of PIKfyve phosphorylation by insulin and osmotic stress. Biochem. Biophys. Res. Commun. 397: 650—655. PMID 20513353 doi:10.1016/j.bbrc.2010.05.134

Примітки

1. Захворювання, генетично пов'язані з PIKFYVE переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
2. Human PubMed Reference:.
3. Mouse PubMed Reference:.
4. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:23785 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.
5. UniProt, Q9Y2I7 (англ.) . Архів оригіналу за 18 липня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.

Див. також

• Хромосома 2

Портал «Біологія»   Портал «Хімія»