PLXNA4

PLXNA4
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 4E74
Ідентифікатори
Символи	PLXNA4, FAYV2820, PLEXA4, PLXNA4A, PLXNA4B, PRO34003, plexin A4
Зовнішні ІД	OMIM: 604280 MGI: 2179061 HomoloGene: 77587 GeneCards: PLXNA4
Онтологія гена Молекулярна функція • semaphorin receptor activity Клітинна компонента • integral component of membrane • мембрана • клітинна мембрана • semaphorin receptor complex • integral component of plasma membrane Біологічний процес • glossopharyngeal nerve morphogenesis • neuron projection morphogenesis • regulation of axon extension involved in axon guidance • cranial nerve morphogenesis • sympathetic nervous system development • vagus nerve morphogenesis • trigeminal nerve morphogenesis • нейробіологія розвитку • anterior commissure morphogenesis • postganglionic parasympathetic fiber development • branchiomotor neuron axon guidance • regulation of negative chemotaxis • facial nerve structural organization • motor neuron axon guidance • trigeminal nerve structural organization • semaphorin-plexin signaling pathway • chemorepulsion of branchiomotor axon • GO:0072468 сигнальна трансдукція • facial nerve morphogenesis • axon guidance • semaphorin-plexin signaling pathway involved in axon guidance • negative regulation of cell adhesion • regulation of cell shape • regulation of cell migration • GO:0043087, GO:0032313, GO:0032319, GO:0032314, GO:0043088 regulation of GTPase activity • positive regulation of axonogenesis Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	91584	243743
Ensembl	ENSG00000221866	ENSMUSG00000029765
UniProt	Q9HCM2	Q80UG2
RefSeq (мРНК)	NM_001105543 NM_020911 NM_181775 NM_001393897	NM_175750
RefSeq (білок)	NP_001099013 NP_065962 NP_861440	NP_786926
Локус (UCSC)	Хр. 7: 132.12 – 132.65 Mb	Хр. 6: 32.12 – 32.57 Mb
PubMed search	[1]	[2]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

PLXNA4 (англ. Plexin A4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 894 амінокислот, а молекулярна маса — 212 455^[4].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MKAMPWNWTC		LLSHLLMVGM		GSSTLLTRQP		APLSQKQRSF		VTFRGEPAEG
FNHLVVDERT		GHIYLGAVNR		IYKLSSDLKV		LVTHETGPDE		DNPKCYPPRI
VQTCNEPLTT		TNNVNKMLLI		DYKENRLIAC		GSLYQGICKL		LRLEDLFKLG
EPYHKKEHYL		SGVNESGSVF		GVIVSYSNLD		DKLFIATAVD		GKPEYFPTIS
SRKLTKNSEA		DGMFAYVFHD		EFVASMIKIP		SDTFTIIPDF		DIYYVYGFSS
GNFVYFLTLQ		PEMVSPPGST		TKEQVYTSKL		VRLCKEDTAF		NSYVEVPIGC
ERSGVEYRLL		QAAYLSKAGA		VLGRTLGVHP		DDDLLFTVFS		KGQKRKMKSL
DESALCIFIL		KQINDRIKER		LQSCYRGEGT		LDLAWLKVKD		IPCSSALLTI
DDNFCGLDMN		APLGVSDMVR		GIPVFTEDRD		RMTSVIAYVY		KNHSLAFVGT
KSGKLKKIRV		DGPRGNALQY		ETVQVVDPGP		VLRDMAFSKD		HEQLYIMSER
QLTRVPVESC		GQYQSCGECL		GSGDPHCGWC		VLHNTCTRKE		RCERSKEPRR
FASEMKQCVR		LTVHPNNISV		SQYNVLLVLE		TYNVPELSAG		VNCTFEDLSE
MDGLVVGNQI		QCYSPAAKEV		PRIITENGDH		HVVQLQLKSK		ETGMTFASTS
FVFYNCSVHN		SCLSCVESPY		RCHWCKYRHV		CTHDPKTCSF		QEGRVKLPED
CPQLLRVDKI		LVPVEVIKPI		TLKAKNLPQP		QSGQRGYECI		LNIQGSEQRV
PALRFNSSSV		QCQNTSYSYE		GMEINNLPVE		LTVVWNGHFN		IDNPAQNKVH
LYKCGAMRES		CGLCLKADPD		FACGWCQGPG		QCTLRQHCPA		QESQWLELSG
AKSKCTNPRI		TEIIPVTGPR		EGGTKVTIRG		ENLGLEFRDI		ASHVKVAGVE
CSPLVDGYIP		AEQIVCEMGE		AKPSQHAGFV		EICVAVCRPE		FMARSSQLYY
FMTLTLSDLK		PSRGPMSGGT		QVTITGTNLN		AGSNVVVMFG		KQPCLFHRRS
PSYIVCNTTS		SDEVLEMKVS		VQVDRAKIHQ		DLVFQYVEDP		TIVRIEPEWS
IVSGNTPIAV		WGTHLDLIQN		PQIRAKHGGK		EHINICEVLN		ATEMTCQAPA
LALGPDHQSD		LTERPEEFGF		ILDNVQSLLI		LNKTNFTYYP		NPVFEAFGPS
GILELKPGTP		IILKGKNLIP		PVAGGNVKLN		YTVLVGEKPC		TVTVSDVQLL
CESPNLIGRH		KVMARVGGME		YSPGMVYIAP		DSPLSLPAIV		SIAVAGGLLI
IFIVAVLIAY		KRKSRESDLT		LKRLQMQMDN		LESRVALECK		EAFAELQTDI
HELTSDLDGA		GIPFLDYRTY		TMRVLFPGIE		DHPVLRDLEV		PGYRQERVEK
GLKLFAQLIN		NKVFLLSFIR		TLESQRSFSM		RDRGNVASLI		MTVLQSKLEY
ATDVLKQLLA		DLIDKNLESK		NHPKLLLRRT		ESVAEKMLTN		WFTFLLYKFL
KECAGEPLFS		LFCAIKQQME		KGPIDAITGE		ARYSLSEDKL		IRQQIDYKTL
VLSCVSPDNA		NSPEVPVKIL		NCDTITQVKE		KILDAIFKNV		PCSHRPKAAD
MDLEWRQGSG		ARMILQDEDI		TTKIENDWKR		LNTLAHYQVP		DGSVVALVSK
QVTAYNAVNN		STVSRTSASK		YENMIRYTGS		PDSLRSRTPM		ITPDLESGVK
MWHLVKNHEH		GDQKEGDRGS		KMVSEIYLTR		LLATKGTLQK		FVDDLFETIF
STAHRGSALP		LAIKYMFDFL		DEQADKHGIH		DPHVRHTWKS		NCLPLRFWVN
MIKNPQFVFD		IHKNSITDAC		LSVVAQTFMD		SCSTSEHRLG		KDSPSNKLLY
AKDIPSYKNW		VERYYSDIGK		MPAISDQDMN		AYLAEQSRMH		MNEFNTMSAL
SEIFSYVGKY		SEEILGPLDH		DDQCGKQKLA		YKLEQVITLM		SLDS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до рецепторів. Задіяний у таких біологічних процесах, як ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
• Nagase T., Kikuno R., Nakayama M., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVIII. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 7: 273—281. PMID 10997877 doi:10.1093/dnares/7.4.271

Примітки

1. Human PubMed Reference:.
2. Mouse PubMed Reference:.
3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9102 (англ.) . Процитовано 7 вересня 2017.
4. UniProt, Q9HCM2 (англ.) . Архів оригіналу за 19 жовтня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.

Див. також

• Хромосома 7

Портал «Біологія»   Портал «Хімія»