PLXNB1

PLXNB1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2JPH, 2OS6, 2R2O, 2REX, 3HM6, 3OL2, 3SU8, 3SUA
Ідентифікатори
Символи	PLXNB1, PLEXIN-B1, PLXN5, SEP, plexin B1
Зовнішні ІД	OMIM: 601053 MGI: 2154238 HomoloGene: 130508 GeneCards: PLXNB1
Онтологія гена Молекулярна функція • GTPase activating protein binding • semaphorin receptor activity • semaphorin receptor binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • transmembrane signaling receptor activity • GO:0005097, GO:0005099, GO:0005100 GTPase activator activity • signaling receptor activity Клітинна компонента • integral component of membrane • мембрана • клітинна мембрана • semaphorin receptor complex • integral component of plasma membrane • extracellular region • внутрішньоклітинний Біологічний процес • ossification involved in bone maturation • negative regulation of cell adhesion • neuron projection morphogenesis • GO:0007243 intracellular signal transduction • positive regulation of axonogenesis • GO:0032320, GO:0032321, GO:0032855, GO:0043089, GO:0032854 positive regulation of GTPase activity • regulation of cell shape • axon extension • negative regulation of osteoblast proliferation • positive regulation of phosphatidylinositol 3-kinase signaling • cell migration • regulation of cytoskeleton organization • semaphorin-plexin signaling pathway • GO:0072468 сигнальна трансдукція • semaphorin-plexin signaling pathway involved in bone trabecula morphogenesis • GO:0043087, GO:0032313, GO:0032319, GO:0032314, GO:0043088 regulation of GTPase activity • G protein-coupled receptor signaling pathway • regulation of cell migration • semaphorin-plexin signaling pathway involved in axon guidance • inhibitory synapse assembly Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	5364	235611
Ensembl	ENSG00000164050	ENSMUSG00000053646
UniProt	O43157	Q8CJH3
RefSeq (мРНК)	NM_001130082 NM_002673	NM_172775
RefSeq (білок)	NP_001123554 NP_002664	NP_766363
Локус (UCSC)	Хр. 3: 48.4 – 48.43 Mb	Хр. 9: 108.92 – 108.95 Mb
PubMed search	[1]	[2]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

PLXNB1 (англ. Plexin B1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 135 амінокислот, а молекулярна маса — 232 298^[4].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MPALGPALLQ		ALWAGWVLTL		QPLPPTAFTP		NGTYLQHLAR		DPTSGTLYLG
ATNFLFQLSP		GLQLEATVST		GPVLDSRDCL		PPVMPDECPQ		AQPTNNPNQL
LLVSPGALVV		CGSVHQGVCE		QRRLGQLEQL		LLRPERPGDT		QYVAANDPAV
STVGLVAQGL		AGEPLLFVGR		GYTSRGVGGG		IPPITTRALW		PPDPQAAFSY
EETAKLAVGR		LSEYSHHFVS		AFARGASAYF		LFLRRDLQAQ		SRAFRAYVSR
VCLRDQHYYS		YVELPLACEG		GRYGLIQAAA		VATSREVAHG		EVLFAAFSSA
APPTVGRPPS		AAAGASGASA		LCAFPLDEVD		RLANRTRDAC		YTREGRAEDG
TEVAYIEYDV		NSDCAQLPVD		TLDAYPCGSD		HTPSPMASRV		PLEATPILEW
PGIQLTAVAV		TMEDGHTIAF		LGDSQGQLHR		VYLGPGSDGH		PYSTQSIQQG
SAVSRDLTFD		GTFEHLYVMT		QSTLLKVPVA		SCAQHLDCAS		CLAHRDPYCG
WCVLLGRCSR		RSECSRGQGP		EQWLWSFQPE		LGCLQVAAMS		PANISREETR
EVFLSVPDLP		PLWPGESYSC		HFGEHQSPAL		LTGSGVMCPS		PDPSEAPVLP
RGADYVSVSV		ELRFGAVVIA		KTSLSFYDCV		AVTELRPSAQ		CQACVSSRWG
CNWCVWQHLC		THKASCDAGP		MVASHQSPLV		SPDPPARGGP		SPSPPTAPKA
LATPAPDTLP		VEPGAPSTAT		ASDISPGASP		SLLSPWGPWA		GSGSISSPGS
TGSPLHEEPS		PPSPQNGPGT		AVPAPTDFRP		SATPEDLLAS		PLSPSEVAAV
PPADPGPEAL		HPTVPLDLPP		ATVPATTFPG		AMGSVKPALD		WLTREGGELP
EADEWTGGDA		PAFSTSTLLS		GDGDSAELEG		PPAPLILPSS		LDYQYDTPGL
WELEEATLGA		SSCPCVESVQ		GSTLMPVHVE		REIRLLGRNL		HLFQDGPGDN
ECVMELEGLE		VVVEARVECE		PPPDTQCHVT		CQQHQLSYEA		LQPELRVGLF
LRRAGRLRVD		SAEGLHVVLY		DCSVGHGDCS		RCQTAMPQYG		CVWCEGERPR
CVTREACGEA		EAVATQCPAP		LIHSVEPLTG		PVDGGTRVTI		RGSNLGQHVQ
DVLGMVTVAG		VPCAVDAQEY		EVSSSLVCIT		GASGEEVAGA		TAVEVPGRGR
GVSEHDFAYQ		DPKVHSIFPA		RGPRAGGTRL		TLNGSKLLTG		RLEDIRVVVG
DQPCHLLPEQ		QSEQLRCETS		PRPTPATLPV		AVWFGATERR		LQRGQFKYTL
DPNITSAGPT		KSFLSGGREI		CVRGQNLDVV		QTPRIRVTVV		SRMLQPSQGL
GRRRRVVPET		ACSLGPSCSS		QQFEEPCHVN		SSQLITCRTP		ALPGLPEDPW
VRVEFILDNL		VFDFATLNPT		PFSYEADPTL		QPLNPEDPTM		PFRHKPGSVF
SVEGENLDLA		MSKEEVVAMI		GDGPCVVKTL		TRHHLYCEPP		VEQPLPRHHA
LREAPDSLPE		FTVQMGNLRF		SLGHVQYDGE		SPGAFPVAAQ		VGLGVGTSLL
ALGVIIIVLM		YRRKSKQALR		DYKKVQIQLE		NLESSVRDRC		KKEFTDLMTE
MTDLTSDLLG		SGIPFLDYKV		YAERIFFPGH		RESPLHRDLG		VPESRRPTVE
QGLGQLSNLL		NSKLFLTKFI		HTLESQRTFS		ARDRAYVASL		LTVALHGKLE
YFTDILRTLL		SDLVAQYVAK		NPKLMLRRTE		TVVEKLLTNW		MSICLYTFVR
DSVGEPLYML		FRGIKHQVDK		GPVDSVTGKA		KYTLNDNRLL		REDVEYRPLT
LNALLAVGPG		AGEAQGVPVK		VLDCDTISQA		KEKMLDQLYK		GVPLTQRPDP
RTLDVEWRSG		VAGHLILSDE		DVTSEVQGLW		RRLNTLQHYK		VPDGATVALV
PCLTKHVLRE		NQDYVPGERT		PMLEDVDEGG		IRPWHLVKPS		DEPEPPRPRR
GSLRGGERER		AKAIPEIYLT		RLLSMKGTLQ		KFVDDLFQVI		LSTSRPVPLA
VKYFFDLLDE		QAQQHGISDQ		DTIHIWKTNS		LPLRFWINII		KNPQFVFDVQ
TSDNMDAVLL		VIAQTFMDAC		TLADHKLGRD		SPINKLLYAR		DIPRYKRMVE
RYYADIRQTV		PASDQEMNSV		LAELSWNYSG		DLGARVALHE		LYKYINKYYD
QIITALEEDG		TAQKMQLGYR		LQQIAAAVEN		KVTDL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані. Також секретований назовні.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Vikis H.G., Li W., He Z., Guan K.-L. (2000). The semaphorin receptor plexin-B1 specifically interacts with active Rac in a ligand-dependent manner. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 97: 12457—12462. PMID 11035813 DOI:10.1073/pnas.220421797
• Aurandt J., Vikis H.G., Gutkind J.S., Ahn N., Guan K.-L. (2002). The semaphorin receptor plexin-B1 signals through a direct interaction with the Rho-specific nucleotide exchange factor, LARG. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 99: 12085—12090. PMID 12196628 DOI:10.1073/pnas.142433199
• Oinuma I., Katoh H., Harada A., Negishi M. (2003). Direct interaction of Rnd1 with Plexin-B1 regulates PDZ-RhoGEF-mediated Rho activation by Plexin-B1 and induces cell contraction in COS-7 cells. J. Biol. Chem. 278: 25671—25677. PMID 12730235 DOI:10.1074/jbc.M303047200
• Swiercz J.M., Kuner R., Offermanns S. (2004). Plexin-B1/RhoGEF-mediated RhoA activation involves the receptor tyrosine kinase ErbB-2. J. Cell Biol. 165: 869—880. PMID 15210733 DOI:10.1083/jcb.200312094
• Conrotto P., Corso S., Gamberini S., Comoglio P.M., Giordano S. (2004). Interplay between scatter factor receptors and B plexins controls invasive growth. Oncogene. 23: 5131—5137. PMID 15184888 DOI:10.1038/sj.onc.1207650

Примітки

1. Human PubMed Reference:.
2. Mouse PubMed Reference:.
3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9103 (англ.) . Процитовано 30 серпня 2017.
4. UniProt, O43157 (англ.) . Архів оригіналу за 30 березня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.

Див. також

• Хромосома 3

Портал «Біологія»   Портал «Хімія»