PLXND1

PLXND1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3H6N
Ідентифікатори
Символи	PLXND1, PLEXD1, plexin D1
Зовнішні ІД	OMIM: 604282 MGI: 2154244 HomoloGene: 22866 GeneCards: PLXND1
Онтологія гена Молекулярна функція • protein domain specific binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • semaphorin receptor activity Клітинна компонента • integral component of membrane • мембрана • клітинна мембрана • lamellipodium • integral component of plasma membrane • lamellipodium membrane • cell projection • semaphorin receptor complex Біологічний процес • cardiac septum development • outflow tract morphogenesis • regulation of angiogenesis • coronary vasculature development • multicellular organism development • aorta development • Ангіогенез • dichotomous subdivision of terminal units involved in salivary gland branching • branching involved in blood vessel morphogenesis • synapse assembly • positive regulation of protein binding • endothelial cell migration • semaphorin-plexin signaling pathway • GO:0072468 сигнальна трансдукція • negative regulation of cell adhesion • regulation of cell shape • regulation of cell migration • positive regulation of axonogenesis • GO:0043087, GO:0032313, GO:0032319, GO:0032314, GO:0043088 regulation of GTPase activity • positive regulation of transcription of Notch receptor target • semaphorin-plexin signaling pathway involved in axon guidance Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	23129	67784
Ensembl	ENSG00000004399	ENSMUSG00000030123
UniProt	Q9Y4D7	Q3UH93
RefSeq (мРНК)	NM_015103	NM_026376
RefSeq (білок)	NP_055918	NP_080652
Локус (UCSC)	Хр. 3: 129.56 – 129.61 Mb	Хр. 6: 115.93 – 115.97 Mb
PubMed search	[1]	[2]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

PLXND1 (англ. Plexin D1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 925 амінокислот, а молекулярна маса — 212 007^[4].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAPRAAGGAP		LSARAAAASP		PPFQTPPRCP		VPLLLLLLLG		AARAGALEIQ
RRFPSPTPTN		NFALDGAAGT		VYLAAVNRLY		QLSGANLSLE		AEAAVGPVPD
SPLCHAPQLP		QASCEHPRRL		TDNYNKILQL		DPGQGLVVVC		GSIYQGFCQL
RRRGNISAVA		VRFPPAAPPA		EPVTVFPSML		NVAANHPNAS		TVGLVLPPAA
GAGGSRLLVG		ATYTGYGSSF		FPRNRSLEDH		RFENTPEIAI		RSLDTRGDLA
KLFTFDLNPS		DDNILKIKQG		AKEQHKLGFV		SAFLHPSDPP		PGAQSYAYLA
LNSEARAGDK		ESQARSLLAR		ICLPHGAGGD		AKKLTESYIQ		LGLQCAGGAG
RGDLYSRLVS		VFPARERLFA		VFERPQGSPA		ARAAPAALCA		FRFADVRAAI
RAARTACFVE		PAPDVVAVLD		SVVQGTGPAC		ERKLNIQLQP		EQLDCGAAHL
QHPLSILQPL		KATPVFRAPG		LTSVAVASVN		NYTAVFLGTV		NGRLLKINLN
ESMQVVSRRV		VTVAYGEPVH		HVMQFDPADS		GYLYLMTSHQ		MARVKVAACN
VHSTCGDCVG		AADAYCGWCA		LETRCTLQQD		CTNSSQQHFW		TSASEGPSRC
PAMTVLPSEI		DVRQEYPGMI		LQISGSLPSL		SGMEMACDYG		NNIRTVARVP
GPAFGHQIAY		CNLLPRDQFP		PFPPNQDHVT		VEMSVRVNGR		NIVKANFTIY
DCSRTAQVYP		HTACTSCLSA		QWPCFWCSQQ		HSCVSNQSRC		EASPNPTSPQ
DCPRTLLSPL		APVPTGGSQN		ILVPLANTAF		FQGAALECSF		GLEEIFEAVW
VNESVVRCDQ		VVLHTTRKSQ		VFPLSLQLKG		RPARFLDSPE		PMTVMVYNCA
MGSPDCSQCL		GREDLGHLCM		WSDGCRLRGP		LQPMAGTCPA		PEIHAIEPLS
GPLDGGTLLT		IRGRNLGRRL		SDVAHGVWIG		GVACEPLPDR		YTVSEEIVCV
TGPAPGPLSG		VVTVNASKEG		KSRDRFSYVL		PLVHSLEPTM		GPKAGGTRIT
IHGNDLHVGS		ELQVLVNDTD		PCTELMRTDT		SIACTMPEGA		LPAPVPVCVR
FERRGCVHGN		LTFWYMQNPV		ITAISPRRSP		VSGGRTITVA		GERFHMVQNV
SMAVHHIGRE		PTLCKVLNST		LITCPSPGAL		SNASAPVDFF		INGRAYADEV
AVAEELLDPE		EAQRGSRFRL		DYLPNPQFST		AKREKWIKHH		PGEPLTLVIH
KEQDSLGLQS		HEYRVKIGQV		SCDIQIVSDR		IIHCSVNESL		GAAVGQLPIT
IQVGNFNQTI		ATLQLGGSET		AIIVSIVICS		VLLLLSVVAL		FVFCTKSRRA
ERYWQKTLLQ		MEEMESQIRE		EIRKGFAELQ		TDMTDLTKEL		NRSQGIPFLE
YKHFVTRTFF		PKCSSLYEER		YVLPSQTLNS		QGSSQAQETH		PLLGEWKIPE
SCRPNMEEGI		SLFSSLLNNK		HFLIVFVHAL		EQQKDFAVRD		RCSLASLLTI
ALHGKLEYYT		SIMKELLVDL		IDASAAKNPK		LMLRRTESVV		EKMLTNWMSI
CMYSCLRETV		GEPFFLLLCA		IKQQINKGSI		DAITGKARYT		LSEEWLLREN
IEAKPRNLNV		SFQGCGMDSL		SVRAMDTDTL		TQVKEKILEA		FCKNVPYSQW
PRAEDVDLEW		FASSTQSYIL		RDLDDTSVVE		DGRKKLNTLA		HYKIPEGASL
AMSLIDKKDN		TLGRVKDLDT		EKYFHLVLPT		DELAEPKKSH		RQSHRKKVLP
EIYLTRLLST		KGTLQKFLDD		LFKAILSIRE		DKPPLAVKYF		FDFLEEQAEK
RGISDPDTLH		IWKTNSLPLR		FWVNILKNPQ		FVFDIDKTDH		IDACLSVIAQ
AFIDACSISD		LQLGKDSPTN		KLLYAKEIPE		YRKIVQRYYK		QIQDMTPLSE
QEMNAHLAEE		SRKYQNEFNT		NVAMAEIYKY		AKRYRPQIMA		ALEANPTARR
TQLQHKFEQV		VALMEDNIYE		CYSEA

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, білків розвитку. Задіяний у таких біологічних процесах як ангіогенез, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504

Примітки

1. Human PubMed Reference:.
2. Mouse PubMed Reference:.
3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9107 (англ.) . Архів оригіналу за 6 вересня 2017. Процитовано 30 серпня 2017. [Архівовано 2017-09-06 у Wayback Machine.]
4. UniProt, Q9Y4D7 (англ.) . Архів оригіналу за 21 лютого 2017. Процитовано 30 серпня 2017.

Див. також

• Хромосома 3

Портал «Біологія»   Портал «Хімія»