POLA1

POLA1
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1K0P, 1K18, 1N5G, 4Q5V, 4QCL, 4Y97, 5EXR, 5IUD
Ідентифікатори
Символи	POLA1, NSX, POLA, p180, Polymerase (DNA directed), alpha 1, polymerase (DNA) alpha 1, catalytic subunit, DNA polymerase alpha 1, catalytic subunit, VEODS
Зовнішні ІД	OMIM: 312040 MGI: 99660 HomoloGene: 6802 GeneCards: POLA1
Пов'язані генетичні захворювання
	X-linked intellectual disability, van Esch type
Реагує на сполуку
	Viroporin 3a, цитарабін, Флударабін, gemcitabine hydrochloride
Онтологія гена
Молекулярна функція	• transferase activity; • 4 iron, 4 sulfur cluster binding; • nucleotidyltransferase activity; • nucleoside binding; • iron-sulfur cluster binding; • chromatin binding; • зв'язування з іоном металу; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • nucleic acid binding; • protein kinase binding; • DNA-directed DNA polymerase activity; • nucleotide binding; • DNA binding; • DNA replication origin binding; • purine nucleotide binding; • protein heterodimerization activity; • single-stranded DNA binding; • pyrimidine nucleotide binding;
Клітинна компонента	• nuclear envelope; • nuclear matrix; • ядерце; • Хроматин; • нуклеоплазма; • клітинне ядро; • цитоплазма; • гіалоплазма; • alpha DNA polymerase:primase complex;
Біологічний процес	• DNA synthesis involved in DNA repair; • lagging strand elongation; • regulation of transcription involved in G1/S transition of mitotic cell cycle; • реплікація ДНК; • leading strand elongation; • проліферація; • GO:0022415 viral process; • double-strand break repair via nonhomologous end joining; • DNA strand elongation involved in DNA replication; • DNA replication, synthesis of RNA primer; • telomere maintenance via semi-conservative replication; • G1/S transition of mitotic cell cycle; • DNA replication initiation; • GO:0100026 Репарація ДНК; • nucleotide-excision repair; • DNA synthesis involved in UV-damage excision repair; • mitotic DNA replication initiation; • synthesis of RNA primer involved in mitotic DNA replication;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	5422
	18968
	ENSG00000101868
	ENSMUSG00000006678
	P09884
	P33609
	NM_016937; NM_001330360; NM_001378303
	NM_008892
	NP_001317289; NP_058633; NP_001365232
	NP_032918
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

POLA1 (англ. DNA polymerase alpha 1, catalytic subunit) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на X-хромосомі.^[5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 462 амінокислот, а молекулярна маса — 165 913^[6].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAPVHGDDSL	SDSGSFVSSR	ARREKKSKKG	RQEALERLKK	AKAGEKYKYE
VEDFTGVYEE	VDEEQYSKLV	QARQDDDWIV	DDDGIGYVED	GREIFDDDLE
DDALDADEKG	KDGKARNKDK	RNVKKLAVTK	PNNIKSMFIA	CAGKKTADKA
VDLSKDGLLG	DILQDLNTET	PQITPPPVMI	LKKKRSIGAS	PNPFSVHTAT
AVPSGKIASP	VSRKEPPLTP	VPLKRAEFAG	DDVQVESTEE	EQESGAMEFE
DGDFDEPMEV	EEVDLEPMAA	KAWDKESEPA	EEVKQEADSG	KGTVSYLGSF
LPDVSCWDID	QEGDSSFSVQ	EVQVDSSHLP	LVKGADEEQV	FHFYWLDAYE
DQYNQPGVVF	LFGKVWIESA	ETHVSCCVMV	KNIERTLYFL	PREMKIDLNT
GKETGTPISM	KDVYEEFDEK	IATKYKIMKF	KSKPVEKNYA	FEIPDVPEKS
EYLEVKYSAE	MPQLPQDLKG	ETFSHVFGTN	TSSLELFLMN	RKIKGPCWLE
VKSPQLLNQP	VSWCKVEAMA	LKPDLVNVIK	DVSPPPLVVM	AFSMKTMQNA
KNHQNEIIAM	AALVHHSFAL	DKAAPKPPFQ	SHFCVVSKPK	DCIFPYAFKE
VIEKKNVKVE	VAATERTLLG	FFLAKVHKID	PDIIVGHNIY	GFELEVLLQR
INVCKAPHWS	KIGRLKRSNM	PKLGGRSGFG	ERNATCGRMI	CDVEISAKEL
IRCKSYHLSE	LVQQILKTER	VVIPMENIQN	MYSESSQLLY	LLEHTWKDAK
FILQIMCELN	VLPLALQITN	IAGNIMSRTL	MGGRSERNEF	LLLHAFYENN
YIVPDKQIFR	KPQQKLGDED	EEIDGDTNKY	KKGRKKAAYA	GGLVLDPKVG
FYDKFILLLD	FNSLYPSIIQ	EFNICFTTVQ	RVASEAQKVT	EDGEQEQIPE
LPDPSLEMGI	LPREIRKLVE	RRKQVKQLMK	QQDLNPDLIL	QYDIRQKALK
LTANSMYGCL	GFSYSRFYAK	PLAALVTYKG	REILMHTKEM	VQKMNLEVIY
GDTDSIMINT	NSTNLEEVFK	LGNKVKSEVN	KLYKLLEIDI	DGVFKSLLLL
KKKKYAALVV	EPTSDGNYVT	KQELKGLDIV	RRDWCDLAKD	TGNFVIGQIL
SDQSRDTIVE	NIQKRLIEIG	ENVLNGSVPV	SQFEINKALT	KDPQDYPDKK
SLPHVHVALW	INSQGGRKVK	AGDTVSYVIC	QDGSNLTASQ	RAYAPEQLQK
QDNLTIDTQY	YLAQQIHPVV	ARICEPIDGI	DAVLIATWLG	LDPTQFRVHH
YHKDEENDAL	LGGPAQLTDE	EKYRDCERFK	CPCPTCGTEN	IYDNVFDGSG
TDMEPSLYRC	SNIDCKASPL	TFTVQLSNKL	IMDIRRFIKK	YYDGWLICEE
PTCRNRTRHL	PLQFSRTGPL	CPACMKATLQ	PEYSDKSLYT	QLCFYRYIFD
AECALEKLTT	DHEKDKLKKQ	FFTPKVLQDY	RKLKNTAEQF	LSRSGYSEVN
LSKLFAGCAV	KS

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як взаємодія хазяїн-вірус, реплікація ДНК, ацетилювання. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, іоном заліза, ДНК, групою 4Fe-4S, залізо-сірчаною групою. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Недостатня експресія цього гену внаслідок інтронної мутації приводить до розвитку рідкого іммунологічного синдрому Сітчастий пігментний розлад, пов'язаний з X-хромосомою, основними маніфестаціями якого є стерильне запалення, високий титр інтерферону-альфа у крові,^[7] та функціональний дефект NK-клітин.^[8]

Ряд екзонних мутацій у гені POLA1 може привести до розвитку інтелектуальної деградації та недорозвиненості.^[9]

Література

Pearson B.E., Nasheuer H.-P., Wang T.S.-F. (1991). Human DNA polymerase alpha gene: sequences controlling expression in cycling and serum-stimulated cells. Mol. Cell. Biol. 11: 2081—2095. PMID 2005899 DOI:10.1128/MCB.11.4.2081
Hsi K.-L., Copeland W.C., Wang T.S.-F. (1990). Human DNA polymerase alpha catalytic polypeptide binds ConA and RCA and contains a specific labile site in the N-terminus. Nucleic Acids Res. 18: 6231—6237. PMID 2243771 DOI:10.1093/nar/18.21.6231
Smale S.T., Tjian R. (1986). T-antigen-DNA polymerase alpha complex implicated in simian virus 40 DNA replication. Mol. Cell. Biol. 6: 4077—4087. PMID 3025630 DOI:10.1128/MCB.6.11.4077
Lee S.S., Dong Q., Wang T.S., Lehman I.R. (1995). Interaction of herpes simplex virus 1 origin-binding protein with DNA polymerase alpha. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 92: 7882—7886. PMID 7644508 DOI:10.1073/pnas.92.17.7882
Braun K.A., Lao Y., He Z., Ingles C.J., Wold M.S. (1997). Role of protein-protein interactions in the function of replication protein A (RPA): RPA modulates the activity of DNA polymerase alpha by multiple mechanisms. Biochemistry. 36: 8443—8454. PMID 9214288 DOI:10.1021/bi970473r
Dantzer F., Nasheuer H.P., Vonesch J.L., de Murcia G., Menissier-de Murcia J. (1998). Functional association of poly(ADP-ribose) polymerase with DNA polymerase alpha-primase complex: a link between DNA strand break detection and DNA replication. Nucleic Acids Res. 26: 1891—1898. PMID 9518481 DOI:10.1093/nar/26.8.1891

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з POLA1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з DNA polymerase alpha 1, catalytic subunit переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9173 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, P09884 (англ.) . Архів оригіналу за 9 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
↑ Starokadomskyy, Petro; Gemelli, Terry; Rios, Jonathan J.; Xing, Chao; Wang, Richard C.; Li, Haiying; Pokatayev, Vladislav; Dozmorov, Igor; Khan, Shaheen (2016-05). DNA polymerase-α regulates the activation of type I interferons through cytosolic RNA:DNA synthesis. Nature Immunology. Т. 17, № 5. с. 495—504. doi:10.1038/ni.3409. ISSN 1529-2916. PMC 4836962. PMID 27019227. Архів оригіналу за 26 червня 2017. Процитовано 13 квітня 2020.
↑ Starokadomskyy, Petro; Wilton, Katelynn M.; Krzewski, Konrad; Lopez, Adam; Sifuentes-Dominguez, Luis; Overlee, Brittany; Chen, Qing; Ray, Ann; Gil-Krzewska, Aleksandra. NK cell defects in X-linked pigmentary reticulate disorder. JCI Insight. Т. 4, № 21. doi:10.1172/jci.insight.125688. ISSN 2379-3708. PMC 6948767. PMID 31672938. Процитовано 13 квітня 2020.
↑ Van Esch, Hilde; Colnaghi, Rita; Freson, Kathleen; Starokadomskyy, Petro; Zankl, Andreas; Backx, Liesbeth; Abramowicz, Iga; Outwin, Emily; Rohena, Luis (05 02, 2019). Defective DNA Polymerase α-Primase Leads to X-Linked Intellectual Disability Associated with Severe Growth Retardation, Microcephaly, and Hypogonadism. American Journal of Human Genetics. Т. 104, № 5. с. 957—967. doi:10.1016/j.ajhg.2019.03.006. ISSN 1537-6605. PMC 6506757. PMID 31006512. Архів оригіналу за 8 травня 2020. Процитовано 13 квітня 2020.

Див. також

Хромосома X

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

[1] Захворювання, генетично пов'язані з POLA1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Сполуки, які фізично взаємодіють з DNA polymerase alpha 1, catalytic subunit переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[3] Human PubMed Reference:.

[4] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-5] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9173 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-6] UniProt, P09884 (англ.) . Архів оригіналу за 9 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

[7] Starokadomskyy, Petro; Gemelli, Terry; Rios, Jonathan J.; Xing, Chao; Wang, Richard C.; Li, Haiying; Pokatayev, Vladislav; Dozmorov, Igor; Khan, Shaheen (2016-05). DNA polymerase-α regulates the activation of type I interferons through cytosolic RNA:DNA synthesis. Nature Immunology. Т. 17, № 5. с. 495—504. doi:10.1038/ni.3409. ISSN 1529-2916. PMC 4836962. PMID 27019227. Архів оригіналу за 26 червня 2017. Процитовано 13 квітня 2020.

[8] Starokadomskyy, Petro; Wilton, Katelynn M.; Krzewski, Konrad; Lopez, Adam; Sifuentes-Dominguez, Luis; Overlee, Brittany; Chen, Qing; Ray, Ann; Gil-Krzewska, Aleksandra. NK cell defects in X-linked pigmentary reticulate disorder. JCI Insight. Т. 4, № 21. doi:10.1172/jci.insight.125688. ISSN 2379-3708. PMC 6948767. PMID 31672938. Процитовано 13 квітня 2020.

[9] Van Esch, Hilde; Colnaghi, Rita; Freson, Kathleen; Starokadomskyy, Petro; Zankl, Andreas; Backx, Liesbeth; Abramowicz, Iga; Outwin, Emily; Rohena, Luis (05 02, 2019). Defective DNA Polymerase α-Primase Leads to X-Linked Intellectual Disability Associated with Severe Growth Retardation, Microcephaly, and Hypogonadism. American Journal of Human Genetics. Т. 104, № 5. с. 957—967. doi:10.1016/j.ajhg.2019.03.006. ISSN 1537-6605. PMC 6506757. PMID 31006512. Архів оригіналу за 8 травня 2020. Процитовано 13 квітня 2020.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]