POLI

POLI
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1T3N, 1ZET, 2ALZ, 2DPI, 2DPJ, 2FLL, 2FLN, 2FLP, 2KHU, 2KHW, 2KTF, 2L0G, 2MBB, 3EPG, 3EPI, 3G6X, 3G6Y, 3GV5, 3GV7, 3GV8, 3H40, 3H4B, 3H4D, 3NGD, 3OSN, 3Q8P, 3Q8Q, 3Q8R, 3Q8S, 4EBC, 4EBD, 4EBE, 4EYH, 4EYI, 4FS1, 4FS2
Ідентифікатори
Символи	POLI, RAD30B, RAD3OB, polymerase (DNA) iota, DNA polymerase iota
Зовнішні ІД	OMIM: 605252 MGI: 1347081 HomoloGene: 5209 GeneCards: POLI
Онтологія гена
Молекулярна функція	• transferase activity; • damaged DNA binding; • DNA-directed DNA polymerase activity; • DNA binding; • nucleotidyltransferase activity; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • зв'язування з іоном металу;
Клітинна компонента	• внутрішньоклітинний; • нуклеоплазма; • клітинне ядро; • nuclear speck; • cytoplasmic ribonucleoprotein granule;
Біологічний процес	• реплікація ДНК; • translesion synthesis; • DNA biosynthetic process; • GO:0100026 Репарація ДНК; • error-prone translesion synthesis; • cellular response to DNA damage stimulus;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	11201
	26447
	ENSG00000101751
	ENSMUSG00000038425
	Q9UNA4
	Q6R3M4
	NM_007195
	NM_001136090; NM_001289515; NM_001289516; NM_011972
NP_009126; NP_001338539; NP_001338540; NP_001338541; NP_001338542;
	NP_001338543; NP_001338544; NP_001338545; NP_001338546; NP_001338547; NP_001338548; NP_001338549; NP_001338550; NP_001338561
NP_001129562; NP_001276444; NP_001276445; NP_036102; NP_001390096;
	NP_001390097; NP_001390098; NP_001390102; NP_001390103; NP_001390104; NP_001390106; NP_001390108; NP_001390112; NP_001390118
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

POLI (англ. DNA polymerase iota) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 18-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 740 амінокислот, а молекулярна маса — 83 006^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MEKLGVEPEE	EGGGDDDEED	AEAWAMELAD	VGAAASSQGV	HDQVLPTPNA
SSRVIVHVDL	DCFYAQVEMI	SNPELKDKPL	GVQQKYLVVT	CNYEARKLGV
KKLMNVRDAK	EKCPQLVLVN	GEDLTRYREM	SYKVTELLEE	FSPVVERLGF
DENFVDLTEM	VEKRLQQLQS	DELSAVTVSG	HVYNNQSINL	LDVLHIRLLV
GSQIAAEMRE	AMYNQLGLTG	CAGVASNKLL	AKLVSGVFKP	NQQTVLLPES
CQHLIHSLNH	IKEIPGIGYK	TAKCLEALGI	NSVRDLQTFS	PKILEKELGI
SVAQRIQKLS	FGEDNSPVIL	SGPPQSFSEE	DSFKKCSSEV	EAKNKIEELL
ASLLNRVCQD	GRKPHTVRLI	IRRYSSEKHY	GRESRQCPIP	SHVIQKLGTG
NYDVMTPMVD	ILMKLFRNMV	NVKMPFHLTL	LSVCFCNLKA	LNTAKKGLID
YYLMPSLSTT	SRSGKHSFKM	KDTHMEDFPK	DKETNRDFLP	SGRIESTRTR
ESPLDTTNFS	KEKDINEFPL	CSLPEGVDQE	VFKQLPVDIQ	EEILSGKSRE
KFQGKGSVSC	PLHASRGVLS	FFSKKQMQDI	PINPRDHLSS	SKQVSSVSPC
EPGTSGFNSS	SSSYMSSQKD	YSYYLDNRLK	DERISQGPKE	PQGFHFTNSN
PAVSAFHSFP	NLQSEQLFSR	NHTTDSHKQT	VATDSHEGLT	ENREPDSVDE
KITFPSDIDP	QVFYELPEAV	QKELLAEWKR	AGSDFHIGHK

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до трансфераз. Задіяний у таких біологічних процесах, як пошкодження ДНК, репарація ДНК, синтез ДНК, реплікація ДНК. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, ДНК, іоном магнію, Шиффовими основами. Локалізований у ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Haracska L., Prakash L., Prakash S. (2003). A mechanism for the exclusion of low-fidelity human Y-family DNA polymerases from base excision repair. Genes Dev. 17: 2777—2785. PMID 14630940 DOI:10.1101/gad.1146103
Nair D.T., Johnson R.E., Prakash S., Prakash L., Aggarwal A.K. (2004). Replication by human DNA polymerase-iota occurs by Hoogsteen base-pairing. Nature. 430: 377—380. PMID 15254543 DOI:10.1038/nature02692

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9182 (англ.) . Архів оригіналу за 23 липня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
↑ UniProt, Q9UNA4 (англ.) . Архів оригіналу за 18 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 18

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9182 (англ.) . Архів оригіналу за 23 липня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

[UniProt-4] UniProt, Q9UNA4 (англ.) . Архів оригіналу за 18 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]