POLN

POLN
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	4XVI, 4XVK, 4XVL, 4XVM
Ідентифікатори
Символи	POLN, POL4P, polymerase (DNA) nu, DNA polymerase nu
Зовнішні ІД	OMIM: 610887 HomoloGene: 129696 GeneCards: POLN
Пов'язані генетичні захворювання
	хвороба Альцгеймера
Онтологія гена
Молекулярна функція	• transferase activity; • DNA binding; • nucleotidyltransferase activity; • 5'-3' exonuclease activity; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • cyclin binding; • DNA-directed DNA polymerase activity; • nucleic acid binding;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • ядерце; • нуклеоплазма; • клітинне ядро;
Біологічний процес	• cellular response to DNA damage stimulus; • реплікація ДНК; • double-strand break repair via homologous recombination; • GO:0100026 Репарація ДНК; • DNA-dependent DNA replication; • interstrand cross-link repair; • translesion synthesis; • nucleic acid phosphodiester bond hydrolysis;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	353497
	566857
	ENSG00000130997
	ENSDARG00000103961
	Q7Z5Q5
	A5X572
	NM_181808
	NM_001100026
	NP_861524
	NP_001093496
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

POLN (англ. DNA polymerase nu) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. ^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 900 амінокислот, а молекулярна маса — 100 307^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MENYEALVGF	DLCNTPLSSV	AQKIMSAMHS	GDLVDSKTWG	KSTETMEVIN
KSSVKYSVQL	EDRKTQSPEK	KDLKSLRSQT	SRGSAKLSPQ	SFSVRLTDQL
SADQKQKSIS	SLTLSSCLIP	QYNQEASVLQ	KKGHKRKHFL	MENINNENKG
SINLKRKHIT	YNNLSEKTSK	QMALEEDTDD	AEGYLNSGNS	GALKKHFCDI
RHLDDWAKSQ	LIEMLKQAAA	LVITVMYTDG	STQLGADQTP	VSSVRGIVVL
VKRQAEGGHG	CPDAPACGPV	LEGFVSDDPC	IYIQIEHSAI	WDQEQEAHQQ
FARNVLFQTM	KCKCPVICFN	AKDFVRIVLQ	FFGNDGSWKH	VADFIGLDPR
IAAWLIDPSD	ATPSFEDLVE	KYCEKSITVK	VNSTYGNSSR	NIVNQNVREN
LKTLYRLTMD	LCSKLKDYGL	WQLFRTLELP	LIPILAVMES	HAIQVNKEEM
EKTSALLGAR	LKELEQEAHF	VAGERFLITS	NNQLREILFG	KLKLHLLSQR
NSLPRTGLQK	YPSTSEAVLN	ALRDLHPLPK	IILEYRQVHK	IKSTFVDGLL
ACMKKGSISS	TWNQTGTVTG	RLSAKHPNIQ	GISKHPIQIT	TPKNFKGKED
KILTISPRAM	FVSSKGHTFL	AADFSQIELR	ILTHLSGDPE	LLKLFQESER
DDVFSTLTSQ	WKDVPVEQVT	HADREQTKKV	VYAVVYGAGK	ERLAACLGVP
IQEAAQFLES	FLQKYKKIKD	FARAAIAQCH	QTGCVVSIMG	RRRPLPRIHA
HDQQLRAQAE	RQAVNFVVQG	SAADLCKLAM	IHVFTAVAAS	HTLTARLVAQ
IHDELLFEVE	DPQIPECAAL	VRRTMESLEQ	VQALELQLQV	PLKVSLSAGR
SWGHLVPLQE	AWGPPPGPCR	TESPSNSLAA	PGSPASTQPP	PLHFSPSFCL

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до трансфераз. Задіяний у таких біологічних процесах як пошкодження ДНК, репарація ДНК, реплікація ДНК, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

Marini F., Kim N., Schuffert A., Wood R.D. (2003). POLN, a nuclear PolA family DNA polymerase homologous to the DNA cross-link sensitivity protein Mus308. J. Biol. Chem. 278: 32014—32019. PMID 12794064 DOI:10.1074/jbc.M305646200
Takata K., Shimizu T., Iwai S., Wood R.D. (2006). Human DNA polymerase N (POLN) is a low fidelity enzyme capable of error-free bypass of 5S-thymine glycol. J. Biol. Chem. 281: 23445—23455. PMID 16787914 DOI:10.1074/jbc.M604317200
Arana M.E., Takata K., Garcia-Diaz M., Wood R.D., Kunkel T.A. (2007). A unique error signature for human DNA polymerase nu. DNA Repair. 6: 213—223. PMID 17118716 DOI:10.1016/j.dnarep.2006.09.012
Zietlow L., Smith L.A., Bessho M., Bessho T. (2009). Evidence for the involvement of human DNA polymerase N in the repair of DNA interstrand cross-links. Biochemistry. 48: 11817—11824. PMID 19908865 DOI:10.1021/bi9015346
Lee Y.S., Gao Y., Yang W. (2015). How a homolog of high-fidelity replicases conducts mutagenic DNA synthesis. Nat. Struct. Mol. Biol. 22: 298—303. PMID 25775266 DOI:10.1038/nsmb.2985

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з POLN переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:18870 (англ.) . Процитовано 30 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q7Z5Q5 (англ.) . Архів оригіналу за 7 жовтня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 4

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

[1] Захворювання, генетично пов'язані з POLN переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:18870 (англ.) . Процитовано 30 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-5] UniProt, Q7Z5Q5 (англ.) . Архів оригіналу за 7 жовтня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]