POLQ

POLQ
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Ідентифікатори
Символи POLQ, POLH, PRO0327, polymerase (DNA) theta, DNA polymerase theta, DNA polymerase θ
Зовнішні ІД OMIM: 604419 MGI: 2155399 HomoloGene: 32727 GeneCards: POLQ
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
NM_199420
NM_006596
NM_001159369
NM_029977
RefSeq (білок)
NP_955452
NP_001152841
NP_084253
Локус (UCSC) Хр. 3: 121.43 – 121.55 Mb Хр. 16: 36.83 – 36.92 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

POLQ (англ. DNA polymerase theta) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 590 амінокислот, а молекулярна маса — 289 619[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MNLLRRSGKRRRSESGSDSFSGSGGDSSASPQFLSGSVLSPPPGLGRCLK
AAAAGECKPTVPDYERDKLLLANWGLPKAVLEKYHSFGVKKMFEWQAECL
LLGQVLEGKNLVYSAPTSAGKTLVAELLILKRVLEMRKKALFILPFVSVA
KEKKYYLQSLFQEVGIKVDGYMGSTSPSRHFSSLDIAVCTIERANGLINR
LIEENKMDLLGMVVVDELHMLGDSHRGYLLELLLTKICYITRKSASCQAD
LASSLSNAVQIVGMSATLPNLELVASWLNAELYHTDFRPVPLLESVKVGN
SIYDSSMKLVREFEPMLQVKGDEDHVVSLCYETICDNHSVLLFCPSKKWC
EKLADIIAREFYNLHHQAEGLVKPSECPPVILEQKELLEVMDQLRRLPSG
LDSVLQKTVPWGVAFHHAGLTFEERDIIEGAFRQGLIRVLAATSTLSSGV
NLPARRVIIRTPIFGGRPLDILTYKQMVGRAGRKGVDTVGESILICKNSE
KSKGIALLQGSLKPVRSCLQRREGEEVTGSMIRAILEIIVGGVASTSQDM
HTYAACTFLAASMKEGKQGIQRNQESVQLGAIEACVMWLLENEFIQSTEA
SDGTEGKVYHPTHLGSATLSSSLSPADTLDIFADLQRAMKGFVLENDLHI
LYLVTPMFEDWTTIDWYRFFCLWEKLPTSMKRVAELVGVEEGFLARCVKG
KVVARTERQHRQMAIHKRFFTSLVLLDLISEVPLREINQKYGCNRGQIQS
LQQSAAVYAGMITVFSNRLGWHNMELLLSQFQKRLTFGIQRELCDLVRVS
LLNAQRARVLYASGFHTVADLARANIVEVEVILKNAVPFKSARKAVDEEE
EAVEERRNMRTIWVTGRKGLTEREAAALIVEEARMILQQDLVEMGVQWNP
CALLHSSTCSLTHSESEVKEHTFISQTKSSYKKLTSKNKSNTIFSDSYIK
HSPNIVQDLNKSREHTSSFNCNFQNGNQEHQTCSIFRARKRASLDINKEK
PGASQNEGKTSDKKVVQTFSQKTKKAPLNFNSEKMSRSFRSWKRRKHLKR
SRDSSPLKDSGACRIHLQGQTLSNPSLCEDPFTLDEKKTEFRNSGPFAKN
VSLSGKEKDNKTSFPLQIKQNCSWNITLTNDNFVEHIVTGSQSKNVTCQA
TSVVSEKGRGVAVEAEKINEVLIQNGSKNQNVYMKHHDIHPINQYLRKQS
HEQTSTITKQKNIIERQMPCEAVSSYINRDSNVTINCERIKLNTEENKPS
HFQALGDDISRTVIPSEVLPSAGAFSKSEGQHENFLNISRLQEKTGTYTT
NKTKNNHVSDLGLVLCDFEDSFYLDTQSEKIIQQMATENAKLGAKDTNLA
AGIMQKSLVQQNSMNSFQKECHIPFPAEQHPLGATKIDHLDLKTVGTMKQ
SSDSHGVDILTPESPIFHSPILLEENGLFLKKNEVSVTDSQLNSFLQGYQ
TQETVKPVILLIPQKRTPTGVEGECLPVPETSLNMSDSLLFDSFSDDYLV
KEQLPDMQMKEPLPSEVTSNHFSDSLCLQEDLIKKSNVNENQDTHQQLTC
SNDESIIFSEMDSVQMVEALDNVDIFPVQEKNHTVVSPRALELSDPVLDE
HHQGDQDGGDQDERAEKSKLTGTRQNHSFIWSGASFDLSPGLQRILDKVS
SPLENEKLKSMTINFSSLNRKNTELNEEQEVISNLETKQVQGISFSSNNE
VKSKIEMLENNANHDETSSLLPRKESNIVDDNGLIPPTPIPTSASKLTFP
GILETPVNPWKTNNVLQPGESYLFGSPSDIKNHDLSPGSRNGFKDNSPIS
DTSFSLQLSQDGLQLTPASSSSESLSIIDVASDQNLFQTFIKEWRCKKRF
SISLACEKIRSLTSSKTATIGSRFKQASSPQEIPIRDDGFPIKGCDDTLV
VGLAVCWGGRDAYYFSLQKEQKHSEISASLVPPSLDPSLTLKDRMWYLQS
CLRKESDKECSVVIYDFIQSYKILLLSCGISLEQSYEDPKVACWLLDPDS
QEPTLHSIVTSFLPHELPLLEGMETSQGIQSLGLNAGSEHSGRYRASVES
ILIFNSMNQLNSLLQKENLQDVFRKVEMPSQYCLALLELNGIGFSTAECE
SQKHIMQAKLDAIETQAYQLAGHSFSFTSSDDIAEVLFLELKLPPNREMK
NQGSKKTLGSTRRGIDNGRKLRLGRQFSTSKDVLNKLKALHPLPGLILEW
RRITNAITKVVFPLQREKCLNPFLGMERIYPVSQSHTATGRITFTEPNIQ
NVPRDFEIKMPTLVGESPPSQAVGKGLLPMGRGKYKKGFSVNPRCQAQME
ERAADRGMPFSISMRHAFVPFPGGSILAADYSQLELRILAHLSHDRRLIQ
VLNTGADVFRSIAAEWKMIEPESVGDDLRQQAKQICYGIIYGMGAKSLGE
QMGIKENDAACYIDSFKSRYTGINQFMTETVKNCKRDGFVQTILGRRRYL
PGIKDNNPYRKAHAERQAINTIVQGSAADIVKIATVNIQKQLETFHSTFK
SHGHREGMLQSDQTGLSRKRKLQGMFCPIRGGFFILQLHDELLYEVAEED
VVQVAQIVKNEMESAVKLSVKLKVKVKIGASWGELKDFDV

Кодований геном білок за функцією належить до трансфераз. Задіяний у таких біологічних процесах як пошкодження ДНК, репарація ДНК, поліморфізм, ацетиляція, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у ядрі, хромосомах.

Література

[ред. | ред. код]
  • Sharief F.S., Vojta P.J., Ropp P.A., Copeland W.C. (1999). Cloning and chromosomal mapping of the human DNA polymerase theta (POLQ), the eighth human DNA polymerase. Genomics. 59: 90—96. PMID 10395804 DOI:10.1006/geno.1999.5843
  • Seki M., Marini F., Wood R.D. (2003). POLQ (Pol theta), a DNA polymerase and DNA-dependent ATPase in human cells. Nucleic Acids Res. 31: 6117—6126. PMID 14576298 DOI:10.1093/nar/gkg814
  • Arana M.E., Seki M., Wood R.D., Rogozin I.B., Kunkel T.A. (2008). Low-fidelity DNA synthesis by human DNA polymerase theta. Nucleic Acids Res. 36: 3847—3856. PMID 18503084 DOI:10.1093/nar/gkn310
  • Hogg M., Seki M., Wood R.D., Doublie S., Wallace S.S. (2011). Lesion bypass activity of DNA polymerase theta (POLQ) is an intrinsic property of the pol domain and depends on unique sequence inserts. J. Mol. Biol. 405: 642—652. PMID 21050863 DOI:10.1016/j.jmb.2010.10.041
  • Hogg M., Sauer-Eriksson A.E., Johansson E. (2012). Promiscuous DNA synthesis by human DNA polymerase theta. Nucleic Acids Res. 40: 2611—2622. PMID 22135286 DOI:10.1093/nar/gkr1102
  • Yoon J.H., Roy Choudhury J., Park J., Prakash S., Prakash L. (2014). A role for DNA polymerase theta in promoting replication through oxidative DNA lesion, thymine glycol, in human cells. J. Biol. Chem. 289: 13177—13185. PMID 24648516 DOI:10.1074/jbc.M114.556977

Примітки

[ред. | ред. код]
  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9186 (англ.) . Архів оригіналу за 23 вересня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.
  4. UniProt, O75417 (англ.) . Архів оригіналу за 9 вересня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.

Див. також

[ред. | ред. код]