POLQ

POLQ
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 4X0P, 4X0Q, 5AGA, 5A9J, 5A9F
Ідентифікатори
Символи	POLQ, POLH, PRO0327, polymerase (DNA) theta, DNA polymerase theta, DNA polymerase θ
Зовнішні ІД	OMIM: 604419 MGI: 2155399 HomoloGene: 32727 GeneCards: POLQ
Онтологія гена Молекулярна функція • transferase activity • nucleotide binding • DNA binding • nucleotidyltransferase activity • GO:0043142 single-stranded DNA helicase activity • 5'-deoxyribose-5-phosphate lyase activity • chromatin binding • damaged DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • nucleic acid binding • DNA-directed DNA polymerase activity • ATP binding • 5'-3' exonuclease activity • identical protein binding Клітинна компонента • нуклеоплазма • хромосома • клітинне ядро • цитоплазма Біологічний процес • somatic hypermutation of immunoglobulin genes • negative regulation of double-strand break repair via homologous recombination • double-strand break repair via alternative nonhomologous end joining • cellular response to DNA damage stimulus • реплікація ДНК • double-strand break repair via homologous recombination • protein homooligomerization • GO:0100026 Репарація ДНК • base-excision repair • DNA biosynthetic process • double-strand break repair • DNA-dependent DNA replication • nucleic acid phosphodiester bond hydrolysis Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	10721	77782
Ensembl	ENSG00000051341	ENSMUSG00000034206
UniProt	O75417	Q8CGS6
RefSeq (мРНК)	NM_199420 NM_006596	NM_001159369 NM_029977
RefSeq (білок)	NP_955452	NP_001152841 NP_084253
Локус (UCSC)	Хр. 3: 121.43 – 121.55 Mb	Хр. 16: 36.83 – 36.92 Mb
PubMed search	[1]	[2]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

POLQ (англ. DNA polymerase theta) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 590 амінокислот, а молекулярна маса — 289 619^[4].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MNLLRRSGKR		RRSESGSDSF		SGSGGDSSAS		PQFLSGSVLS		PPPGLGRCLK
AAAAGECKPT		VPDYERDKLL		LANWGLPKAV		LEKYHSFGVK		KMFEWQAECL
LLGQVLEGKN		LVYSAPTSAG		KTLVAELLIL		KRVLEMRKKA		LFILPFVSVA
KEKKYYLQSL		FQEVGIKVDG		YMGSTSPSRH		FSSLDIAVCT		IERANGLINR
LIEENKMDLL		GMVVVDELHM		LGDSHRGYLL		ELLLTKICYI		TRKSASCQAD
LASSLSNAVQ		IVGMSATLPN		LELVASWLNA		ELYHTDFRPV		PLLESVKVGN
SIYDSSMKLV		REFEPMLQVK		GDEDHVVSLC		YETICDNHSV		LLFCPSKKWC
EKLADIIARE		FYNLHHQAEG		LVKPSECPPV		ILEQKELLEV		MDQLRRLPSG
LDSVLQKTVP		WGVAFHHAGL		TFEERDIIEG		AFRQGLIRVL		AATSTLSSGV
NLPARRVIIR		TPIFGGRPLD		ILTYKQMVGR		AGRKGVDTVG		ESILICKNSE
KSKGIALLQG		SLKPVRSCLQ		RREGEEVTGS		MIRAILEIIV		GGVASTSQDM
HTYAACTFLA		ASMKEGKQGI		QRNQESVQLG		AIEACVMWLL		ENEFIQSTEA
SDGTEGKVYH		PTHLGSATLS		SSLSPADTLD		IFADLQRAMK		GFVLENDLHI
LYLVTPMFED		WTTIDWYRFF		CLWEKLPTSM		KRVAELVGVE		EGFLARCVKG
KVVARTERQH		RQMAIHKRFF		TSLVLLDLIS		EVPLREINQK		YGCNRGQIQS
LQQSAAVYAG		MITVFSNRLG		WHNMELLLSQ		FQKRLTFGIQ		RELCDLVRVS
LLNAQRARVL		YASGFHTVAD		LARANIVEVE		VILKNAVPFK		SARKAVDEEE
EAVEERRNMR		TIWVTGRKGL		TEREAAALIV		EEARMILQQD		LVEMGVQWNP
CALLHSSTCS		LTHSESEVKE		HTFISQTKSS		YKKLTSKNKS		NTIFSDSYIK
HSPNIVQDLN		KSREHTSSFN		CNFQNGNQEH		QTCSIFRARK		RASLDINKEK
PGASQNEGKT		SDKKVVQTFS		QKTKKAPLNF		NSEKMSRSFR		SWKRRKHLKR
SRDSSPLKDS		GACRIHLQGQ		TLSNPSLCED		PFTLDEKKTE		FRNSGPFAKN
VSLSGKEKDN		KTSFPLQIKQ		NCSWNITLTN		DNFVEHIVTG		SQSKNVTCQA
TSVVSEKGRG		VAVEAEKINE		VLIQNGSKNQ		NVYMKHHDIH		PINQYLRKQS
HEQTSTITKQ		KNIIERQMPC		EAVSSYINRD		SNVTINCERI		KLNTEENKPS
HFQALGDDIS		RTVIPSEVLP		SAGAFSKSEG		QHENFLNISR		LQEKTGTYTT
NKTKNNHVSD		LGLVLCDFED		SFYLDTQSEK		IIQQMATENA		KLGAKDTNLA
AGIMQKSLVQ		QNSMNSFQKE		CHIPFPAEQH		PLGATKIDHL		DLKTVGTMKQ
SSDSHGVDIL		TPESPIFHSP		ILLEENGLFL		KKNEVSVTDS		QLNSFLQGYQ
TQETVKPVIL		LIPQKRTPTG		VEGECLPVPE		TSLNMSDSLL		FDSFSDDYLV
KEQLPDMQMK		EPLPSEVTSN		HFSDSLCLQE		DLIKKSNVNE		NQDTHQQLTC
SNDESIIFSE		MDSVQMVEAL		DNVDIFPVQE		KNHTVVSPRA		LELSDPVLDE
HHQGDQDGGD		QDERAEKSKL		TGTRQNHSFI		WSGASFDLSP		GLQRILDKVS
SPLENEKLKS		MTINFSSLNR		KNTELNEEQE		VISNLETKQV		QGISFSSNNE
VKSKIEMLEN		NANHDETSSL		LPRKESNIVD		DNGLIPPTPI		PTSASKLTFP
GILETPVNPW		KTNNVLQPGE		SYLFGSPSDI		KNHDLSPGSR		NGFKDNSPIS
DTSFSLQLSQ		DGLQLTPASS		SSESLSIIDV		ASDQNLFQTF		IKEWRCKKRF
SISLACEKIR		SLTSSKTATI		GSRFKQASSP		QEIPIRDDGF		PIKGCDDTLV
VGLAVCWGGR		DAYYFSLQKE		QKHSEISASL		VPPSLDPSLT		LKDRMWYLQS
CLRKESDKEC		SVVIYDFIQS		YKILLLSCGI		SLEQSYEDPK		VACWLLDPDS
QEPTLHSIVT		SFLPHELPLL		EGMETSQGIQ		SLGLNAGSEH		SGRYRASVES
ILIFNSMNQL		NSLLQKENLQ		DVFRKVEMPS		QYCLALLELN		GIGFSTAECE
SQKHIMQAKL		DAIETQAYQL		AGHSFSFTSS		DDIAEVLFLE		LKLPPNREMK
NQGSKKTLGS		TRRGIDNGRK		LRLGRQFSTS		KDVLNKLKAL		HPLPGLILEW
RRITNAITKV		VFPLQREKCL		NPFLGMERIY		PVSQSHTATG		RITFTEPNIQ
NVPRDFEIKM		PTLVGESPPS		QAVGKGLLPM		GRGKYKKGFS		VNPRCQAQME
ERAADRGMPF		SISMRHAFVP		FPGGSILAAD		YSQLELRILA		HLSHDRRLIQ
VLNTGADVFR		SIAAEWKMIE		PESVGDDLRQ		QAKQICYGII		YGMGAKSLGE
QMGIKENDAA		CYIDSFKSRY		TGINQFMTET		VKNCKRDGFV		QTILGRRRYL
PGIKDNNPYR		KAHAERQAIN		TIVQGSAADI		VKIATVNIQK		QLETFHSTFK
SHGHREGMLQ		SDQTGLSRKR		KLQGMFCPIR		GGFFILQLHD		ELLYEVAEED
VVQVAQIVKN		EMESAVKLSV		KLKVKVKIGA		SWGELKDFDV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до трансфераз. Задіяний у таких біологічних процесах як пошкодження ДНК, репарація ДНК, поліморфізм, ацетиляція, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у ядрі, хромосомах.

Література

• Sharief F.S., Vojta P.J., Ropp P.A., Copeland W.C. (1999). Cloning and chromosomal mapping of the human DNA polymerase theta (POLQ), the eighth human DNA polymerase. Genomics. 59: 90—96. PMID 10395804 DOI:10.1006/geno.1999.5843
• Seki M., Marini F., Wood R.D. (2003). POLQ (Pol theta), a DNA polymerase and DNA-dependent ATPase in human cells. Nucleic Acids Res. 31: 6117—6126. PMID 14576298 DOI:10.1093/nar/gkg814
• Arana M.E., Seki M., Wood R.D., Rogozin I.B., Kunkel T.A. (2008). Low-fidelity DNA synthesis by human DNA polymerase theta. Nucleic Acids Res. 36: 3847—3856. PMID 18503084 DOI:10.1093/nar/gkn310
• Hogg M., Seki M., Wood R.D., Doublie S., Wallace S.S. (2011). Lesion bypass activity of DNA polymerase theta (POLQ) is an intrinsic property of the pol domain and depends on unique sequence inserts. J. Mol. Biol. 405: 642—652. PMID 21050863 DOI:10.1016/j.jmb.2010.10.041
• Hogg M., Sauer-Eriksson A.E., Johansson E. (2012). Promiscuous DNA synthesis by human DNA polymerase theta. Nucleic Acids Res. 40: 2611—2622. PMID 22135286 DOI:10.1093/nar/gkr1102
• Yoon J.H., Roy Choudhury J., Park J., Prakash S., Prakash L. (2014). A role for DNA polymerase theta in promoting replication through oxidative DNA lesion, thymine glycol, in human cells. J. Biol. Chem. 289: 13177—13185. PMID 24648516 DOI:10.1074/jbc.M114.556977

Примітки

1. Human PubMed Reference:.
2. Mouse PubMed Reference:.
3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9186 (англ.) . Архів оригіналу за 23 вересня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.
4. UniProt, O75417 (англ.) . Архів оригіналу за 9 вересня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.

Див. також

• Хромосома 3

Портал «Біологія»   Портал «Хімія»