PPARGC1B

PPARGC1B
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	3SP6
Ідентифікатори
Символи	PPARGC1B, ERRL1, PERC, PGC-1(beta), PGC1B, PPARG coactivator 1 beta
Зовнішні ІД	OMIM: 608886 MGI: 2444934 HomoloGene: 15776 GeneCards: PPARGC1B
Пов'язані генетичні захворювання
	ожиріння
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001104 transcription coregulator activity; • AF-2 domain binding; • nuclear receptor coactivator activity; • RNA binding; • nucleic acid binding; • transcription factor binding; • estrogen receptor binding;
Клітинна компонента	• mediator complex; • мітохондрія; • клітинне ядро; • нуклеоплазма;
Біологічний процес	• mitochondrial transcription; • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • осифікація; • actin filament organization; • positive regulation of osteoclast differentiation; • positive regulation of DNA-binding transcription factor activity; • response to glucocorticoid; • bone trabecula formation; • positive regulation of bone resorption; • transcription, DNA-templated; • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated; • GO:0072353 cellular response to reactive oxygen species; • positive regulation of alkaline phosphatase activity; • response to cAMP; • positive regulation of phosphorylation; • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated; • intracellular estrogen receptor signaling pathway; • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II; • positive regulation of cold-induced thermogenesis; • regulation of nucleic acid-templated transcription;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	133522
	170826
	ENSG00000155846
	ENSMUSG00000033871
	Q86YN6
	Q8VHJ7
	NM_001172698; NM_001172699; NM_133263
	NM_133249; NM_001364996
	NP_001166169; NP_001166170; NP_573570
	NP_573512; NP_001351925
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

PPARGC1B (англ. PPARG coactivator 1 beta) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 023 амінокислот, а молекулярна маса — 113 222^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAGNDCGALL	DEELSSFFLN	YLADTQGGGS	GEEQLYADFP	ELDLSQLDAS
DFDSATCFGE	LQWCPENSET	EPNQYSPDDS	ELFQIDSENE	ALLAELTKTL
DDIPEDDVGL	AAFPALDGGD	ALSCTSASPA	PSSAPPSPAP	EKPSAPAPEV
DELSLLQKLL	LATSYPTSSS	DTQKEGTAWR	QAGLRSKSQR	PCVKADSTQD
KKAPMMQSQS	RSCTELHKHL	TSAQCCLQDR	GLQPPCLQSP	RLPAKEDKEP
GEDCPSPQPA	PASPRDSLAL	GRADPGAPVS	QEDMQAMVQL	IRYMHTYCLP
QRKLPPQTPE	PLPKACSNPS	QQVRSRPWSR	HHSKASWAEF	SILRELLAQD
VLCDVSKPYR	LATPVYASLT	PRSRPRPPKD	SQASPGRPSS	VEEVRIAASP
KSTGPRPSLR	PLRLEVKREV	RRPARLQQQE	EEDEEEEEEE	EEEEKEEEEE
WGRKRPGRGL	PWTKLGRKLE	SSVCPVRRSR	RLNPELGPWL	TFADEPLVPS
EPQGALPSLC	LAPKAYDVER	ELGSPTDEDS	GQDQQLLRGP	QIPALESPCE
SGCGDMDEDP	SCPQLPPRDS	PRCLMLALSQ	SDPTFGKKSF	EQTLTVELCG
TAGLTPPTTP	PYKPTEEDPF	KPDIKHSLGK	EIALSLPSPE	GLSLKATPGA
AHKLPKKHPE	RSELLSHLRH	ATAQPASQAG	QKRPFSCSFG	DHDYCQVLRP
EGVLQRKVLR	SWEPSGVHLE	DWPQQGAPWA	EAQAPGREED	RSCDAGAPPK
DSTLLRDHEI	RASLTKHFGL	LETALEEEDL	ASCKSPEYDT	VFEDSSSSSG
ESSFLPEEEE	EEGEEEEEDD	EEEDSGVSPT	CSDHCPYQSP	PSKANRQLCS
RSRSSSGSSP	CHSWSPATRR	NFRCESRGPC	SDRTPSIRHA	RKRREKAIGE
GRVVYIQNLS	SDMSSRELKR	RFEVFGEIEE	CEVLTRNRRG	EKYGFITYRC
SEHAALSLTK	GAALRKRNEP	SFQLSYGGLR	HFCWPRYTDY	DSNSEEALPA
SGKSKYEAMD	FDSLLKEAQQ	SLH

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у ядрі.

Література

Kressler D., Schreiber S.N., Knutti D., Kralli A. (2002). The PGC-1-related protein PERC is a selective coactivator of estrogen receptor alpha. J. Biol. Chem. 277: 13918—13925. PMID 11854298 DOI:10.1074/jbc.M201134200
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Cho Y., Hazen B.C., Russell A.P., Kralli A. (2013). Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1 (PGC-1)- and estrogen-related receptor (ERR)-induced regulator in muscle 1 (Perm1) is a tissue-specific regulator of oxidative capacity in skeletal muscle cells. J. Biol. Chem. 288: 25207—25218. PMID 23836911 DOI:10.1074/jbc.M113.489674

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з PPARGC1B переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:30022 (англ.) . Процитовано 5 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q86YN6 (англ.) . Архів оригіналу за 7 серпня 2017. Процитовано 5 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 5

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

[1] Захворювання, генетично пов'язані з PPARGC1B переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:30022 (англ.) . Процитовано 5 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-5] UniProt, Q86YN6 (англ.) . Архів оригіналу за 7 серпня 2017. Процитовано 5 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]