PPBP

PPBP
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1TVX, 1F9P, 1NAP
Ідентифікатори
Символи	PPBP, B-TG1, Beta-TG, CTAP-III, CTAP3, CTAPIII, CXCL7, LA-PF4, LDGF, MDGF, NAP-2, PBP, SCYB7, TC1, TC2, TGB, TGB1, THBGB, THBGB1, pro-platelet basic protein
Зовнішні ІД	OMIM: 121010 MGI: 1888712 HomoloGene: 136759 GeneCards: PPBP
Онтологія гена
Молекулярна функція	• growth factor activity; • cytokine activity; • glucose transmembrane transporter activity; • CXCR chemokine receptor binding; • chemokine activity; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding;
Клітинна компонента	• platelet alpha granule lumen; • extracellular region; • міжклітинний простір; • tertiary granule lumen; • platelet alpha granule;
Біологічний процес	• response to lipopolysaccharide; • regulation of cell population proliferation; • хемотаксис; • positive regulation of cell division; • platelet degranulation; • defense response to bacterium; • inflammatory response; • GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь; • chemokine-mediated signaling pathway; • defense response; • positive regulation of neutrophil chemotaxis; • antimicrobial humoral immune response mediated by antimicrobial peptide; • regulation of signaling receptor activity; • neutrophil degranulation; • cell chemotaxis; • G protein-coupled receptor signaling pathway; • glucose transmembrane transport; • neutrophil chemotaxis; • leukocyte chemotaxis; • cellular response to lipopolysaccharide;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	5473
	57349
	ENSG00000163736
	ENSMUSG00000029372
	P02775
	Q9EQI5
	NM_002704
	NM_023785
	NP_002695
	NP_076274
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

PPBP (англ. Pro-platelet basic protein) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 128 амінокислот, а молекулярна маса — 13 894^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSLRLDTTPS	CNSARPLHAL	QVLLLLSLLL	TALASSTKGQ	TKRNLAKGKE
ESLDSDLYAE	LRCMCIKTTS	GIHPKNIQSL	EVIGKGTHCN	QVEVIATLKD
GRKICLDPDA	PRIKKIVQKK	LAGDESAD

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до цитокінів, факторів росту, антибіотиків, антимікробних білків, мітогенів. Задіяний у такому біологічному процесі як хемотаксис. Секретований назовні.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Zhang Z., Henzel W.J. (2004). Signal peptide prediction based on analysis of experimentally verified cleavage sites. Protein Sci. 13: 2819—2824. PMID 15340161 DOI:10.1110/ps.04682504
Castor C.W., Miller J.W., Walz D.A. (1983). Structural and biological characteristics of connective tissue activating peptide (CTAP-III), a major human platelet-derived growth factor. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 80: 765—769. PMID 6572368 DOI:10.1073/pnas.80.3.765
Begg G.S., Pepper D.S., Chesterman C.N., Morgan F.J. (1978). Complete covalent structure of human beta-thromboglobulin. Biochemistry. 17: 1739—1744. PMID 77677 DOI:10.1021/bi00602a024
Walz A., Baggiolini M. (1989). A novel cleavage product of beta-thromboglobulin formed in cultures of stimulated mononuclear cells activates human neutrophils. Biochem. Biophys. Res. Commun. 159: 969—975. PMID 2522778 DOI:10.1016/0006-291X(89)92203-1
Walz A., Baggiolini M. (1990). Generation of the neutrophil-activating peptide NAP-2 from platelet basic protein or connective tissue-activating peptide III through monocyte proteases. J. Exp. Med. 171: 449—454. PMID 2406364 DOI:10.1084/jem.171.2.449

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9240 (англ.) . Процитовано 6 лютого 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, P02775 (англ.) . Архів оригіналу за 2 березня 2017. Процитовано 6 лютого 2017.

Див. також

Хромосома 4

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9240 (англ.) . Процитовано 6 лютого 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-4] UniProt, P02775 (англ.) . Архів оригіналу за 2 березня 2017. Процитовано 6 лютого 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]