PPIF

PPIF
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2BIT, 2BIU, 2Z6W, 3QYU, 3R49, 3R4G, 3R54, 3R56, 3R57, 3R59, 3RCF, 3RCG, 3RCI, 3RCK, 3RCL, 3RD9, 3RDA, 3RDB, 3RDC, 4J58, 4J59, 4J5A, 4J5B, 4J5C, 4J5D, 4J5E, 4O8H, 4O8I, 4XNC, 4ZSC, 4ZSD, 5A0E, 5CCS, 5CCN, 5CCQ, 5CBT, 5CCR
Ідентифікатори
Символи	PPIF, CYP3, CyP-M, Cyp-D, CypD, peptidylprolyl isomerase F
Зовнішні ІД	OMIM: 604486 MGI: 2145814 HomoloGene: 38696 GeneCards: PPIF
Онтологія гена Молекулярна функція • пептидний зв'язок • isomerase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • peptidyl-prolyl cis-trans isomerase activity • cyclosporin A binding • розгорнуте білкове зв’язування Клітинна компонента • mitochondrial proton-transporting ATP synthase complex • мембрана • мітохондріальна внутрішня мембрана • мітохондрія • мітохондріальний матрикс • mitochondrial permeability transition pore complex Біологічний процес • regulation of apoptotic process • cellular response to calcium ion • GO:0010703, GO:0010702 запрограмована клітинна смерть • negative regulation of intrinsic apoptotic signaling pathway • negative regulation of ATP-dependent activity • negative regulation of release of cytochrome c from mitochondria • negative regulation of apoptotic process • GO:0001306 response to oxidative stress • regulation of necrotic cell death • regulation of mitochondrial membrane permeability involved in programmed necrotic cell death • response to ischemia • згортання білків • cellular response to arsenic-containing substance • negative regulation of oxidative phosphorylation uncoupler activity • regulation of proton-transporting ATPase activity, rotational mechanism • positive regulation of release of cytochrome c from mitochondria • GO:0060554, GO:0060555 Некроптоз • negative regulation of oxidative phosphorylation • cellular response to hydrogen peroxide • GO:0097285 апоптоз • apoptotic mitochondrial changes • regulation of mitochondrial membrane permeability • mitochondrial outer membrane permeabilization involved in programmed cell death • protein peptidyl-prolyl isomerization • protein refolding Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	10105	105675
Ensembl	ENSG00000108179	ENSMUSG00000021868
UniProt	P30405	Q99KR7
RefSeq (мРНК)	NM_005729	NM_134084
RefSeq (білок)	NP_005720	NP_598845
Локус (UCSC)	Хр. 10: 79.35 – 79.36 Mb	Хр. 14: 25.69 – 25.7 Mb
PubMed search	[1]	[2]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

PPIF (англ. Peptidylprolyl isomerase F) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 10-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 207 амінокислот, а молекулярна маса — 22 040^[4].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MLALRCGSRW		LGLLSVPRSV		PLRLPAARAC		SKGSGDPSSS		SSSGNPLVYL
DVDANGKPLG		RVVLELKADV		VPKTAENFRA		LCTGEKGFGY		KGSTFHRVIP
SFMCQAGDFT		NHNGTGGKSI		YGSRFPDENF		TLKHVGPGVL		SMANAGPNTN
GSQFFICTIK		TDWLDGKHVV		FGHVKEGMDV		VKKIESFGSK		SGRTSKKIVI
TDCGQLS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до ізомераз, ротамаз. Задіяний у таких біологічних процесах, як апоптоз, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у мітохондрії.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
• Johnson N., Khan A., Virji S., Ward J.M., Crompton M. (1999). Import and processing of heart mitochondrial cyclophilin D. Eur. J. Biochem. 263: 353—359. PMID 10406942 doi:10.1046/j.1432-1327.1999.00490.x
• McGee A.M., Baines C.P. (2011). Complement 1q-binding protein inhibits the mitochondrial permeability transition pore and protects against oxidative stress-induced death. Biochem. J. 433: 119—125. PMID 20950273 doi:10.1042/BJ20101431
• Chaudhuri D., Artiga D.J., Abiria S.A., Clapham D.E. (2016). Mitochondrial calcium uniporter regulator 1 (MCUR1) regulates the calcium threshold for the mitochondrial permeability transition. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 113: E1872—E1880. PMID 26976564 doi:10.1073/pnas.1602264113

Примітки

1. Human PubMed Reference:.
2. Mouse PubMed Reference:.
3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9259 (англ.) . Архів оригіналу за 19 вересня 2015. Процитовано 8 вересня 2017. [Архівовано 2015-09-19 у Wayback Machine.]
4. UniProt, P30405 (англ.) . Архів оригіналу за 14 липня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.

Див. також

• Хромосома 10

Портал «Біологія»   Портал «Хімія»