PPM1B

PPM1B
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2P8E
Ідентифікатори
Символи	PPM1B, PP2C-beta, PP2C-beta-X, PP2CB, PP2CBETA, PPC2BETAX, protein phosphatase, Mg2+/Mn2+ dependent 1B
Зовнішні ІД	OMIM: 603770 MGI: 101841 HomoloGene: 2027 GeneCards: PPM1B
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • magnesium ion binding; • manganese ion binding; • protein serine/threonine phosphatase activity; • phosphoprotein phosphatase activity; • каталітична активність; • cation binding; • hydrolase activity; • зв'язування з іоном металу;
Клітинна компонента	• мембрана; • цитоплазма; • ядерце; • гіалоплазма; • клітинне ядро;
Біологічний процес	• GO:0016576 protein dephosphorylation; • negative regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling; • negative regulation of defense response to virus; • N-terminal protein myristoylation; • peptidyl-threonine dephosphorylation; • negative regulation of interferon-beta production; • negative regulation of NIK/NF-kappaB signaling;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	5495
	19043
	ENSG00000138032
	ENSMUSG00000061130
	O75688
	P36993
	NM_001033556; NM_001033557; NM_002706; NM_177968; NM_177969
	NM_001159496; NM_001159497; NM_001159498; NM_011151
	NP_001028729; NP_002697; NP_808907; NP_808908
	NP_001152968; NP_001152969; NP_001152970; NP_035281
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

PPM1B (англ. Protein phosphatase, Mg2+/Mn2+ dependent 1B) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 479 амінокислот, а молекулярна маса — 52 643^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MGAFLDKPKT	EKHNAHGAGN	GLRYGLSSMQ	GWRVEMEDAH	TAVVGIPHGL
EDWSFFAVYD	GHAGSRVANY	CSTHLLEHIT	TNEDFRAAGK	SGSALELSVE
NVKNGIRTGF	LKIDEYMRNF	SDLRNGMDRS	GSTAVGVMIS	PKHIYFINCG
DSRAVLYRNG	QVCFSTQDHK	PCNPREKERI	QNAGGSVMIQ	RVNGSLAVSR
ALGDYDYKCV	DGKGPTEQLV	SPEPEVYEIL	RAEEDEFIIL	ACDGIWDVMS
NEELCEYVKS	RLEVSDDLEN	VCNWVVDTCL	HKGSRDNMSI	VLVCFSNAPK
VSDEAVKKDS	ELDKHLESRV	EEIMEKSGEE	GMPDLAHVMR	ILSAENIPNL
PPGGGLAGKR	NVIEAVYSRL	NPHRESDGAS	DEAEESGSQG	KLVEALRQMR
INHRGNYRQL	LEEMLTSYRL	AKVEGEESPA	EPAATATSSN	SDAGNPVTMQ
ESHTESESGL	AELDSSNEDA	GTKMSGEKI

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеїн-фосфатаз, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном магнію, іоном марганцю. Локалізований у цитоплазмі, мембрані.

Література

Marely A.E., Kline A., Crabtree G., Sullivan J.E., Beri R.K. (1998). The cloning expression and tissue distribution of human PP2Cbeta. FEBS Lett. 431: 121—124. PMID 9684878 DOI:10.1016/S0014-5793(98)00708-X
Cheng A., Kaldis P., Solomon M.J. (2000). Dephosphorylation of human cyclin-dependent kinases by protein phosphatase type 2Calpha and beta2 isoforms. J. Biol. Chem. 275: 34744—34749. PMID 10934208 DOI:10.1074/jbc.M006210200
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Takeuchi T., Kobayashi T., Tamura S., Yokosawa H. (2006). Negative regulation of protein phosphatase 2Cbeta by ISG15 conjugation. FEBS Lett. 580: 4521—4526. PMID 16872604 DOI:10.1016/j.febslet.2006.07.032
Kaur R., Yuan X., Lu M.L., Balk S.P. (2008). Increased PAK6 expression in prostate cancer and identification of PAK6 associated proteins. Prostate. 68: 1510—1516. PMID 18642328 DOI:10.1002/pros.20787
Bruce D.L., Macartney T., Yong W., Shou W., Sapkota G.P. (2012). Protein phosphatase 5 modulates SMAD3 function in the transforming growth factor-beta pathway. Cell. Signal. 24: 1999—2006. PMID 22781750 DOI:10.1016/j.cellsig.2012.07.003

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9276 (англ.) . Архів оригіналу за 29 жовтня 2016. Процитовано 28 серпня 2017.
↑ UniProt, O75688 (англ.) . Архів оригіналу за 24 серпня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 2

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9276 (англ.) . Архів оригіналу за 29 жовтня 2016. Процитовано 28 серпня 2017.

[UniProt-4] UniProt, O75688 (англ.) . Архів оригіналу за 24 серпня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]