PPP1R8

PPP1R8
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	3V4Y
Ідентифікатори
Символи	PPP1R8, ARD-1, ARD1, NIPP-1, NIPP1, PRO2047, protein phosphatase 1 regulatory subunit 8
Зовнішні ІД	OMIM: 602636 MGI: 2140494 HomoloGene: 8555 GeneCards: PPP1R8
Онтологія гена
Молекулярна функція	• protein serine/threonine phosphatase inhibitor activity; • DNA binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • RNA binding; • protein phosphatase inhibitor activity; • nuclease activity; • endonuclease activity; • ribonuclease E activity; • hydrolase activity; • mRNA binding; • protein phosphatase regulator activity;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • nuclear speck; • нуклеоплазма; • spliceosomal complex; • клітинне ядро;
Біологічний процес	• GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • nucleic acid phosphodiester bond hydrolysis; • mRNA processing; • Деградація РНК; • transcription, DNA-templated; • Сплайсинг РНК; • проліферація; • RNA phosphodiester bond hydrolysis; • negative regulation of protein dephosphorylation; • negative regulation of phosphoprotein phosphatase activity; • regulation of phosphoprotein phosphatase activity; • production of miRNAs involved in gene silencing by miRNA;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	5511
	100336
	ENSG00000117751
	ENSMUSG00000028882
	Q12972
	Q8R3G1
	NM_138558; NM_002713; NM_014110
	NM_001290725; NM_146154; NM_001355198; NM_001355199
	NP_002704; NP_054829; NP_612568
	NP_001277654; NP_666266; NP_001342127; NP_001342128
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

PPP1R8 (англ. Protein phosphatase 1 regulatory subunit 8) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 351 амінокислот, а молекулярна маса — 38 479^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAAAANSGSS	LPLFDCPTWA	GKPPPGLHLD	VVKGDKLIEK	LIIDEKKYYL
FGRNPDLCDF	TIDHQSCSRV	HAALVYHKHL	KRVFLIDLNS	THGTFLGHIR
LEPHKPQQIP	IDSTVSFGAS	TRAYTLREKP	QTLPSAVKGD	EKMGGEDDEL
KGLLGLPEEE	TELDNLTEFN	TAHNKRISTL	TIEEGNLDIQ	RPKRKRKNSR
VTFSEDDEII	NPEDVDPSVG	RFRNMVQTAV	VPVKKKRVEG	PGSLGLEESG
SRRMQNFAFS	GGLYGGLPPT	HSEAGSQPHG	IHGTALIGGL	PMPYPNLAPD
VDLTPVVPSA	VNMNPAPNPA	VYNPEAVNEP	KKKKYAKEAW	PGKKPTPSLL
I

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, гідролаз, нуклеаз, ендонуклеаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як процесінг мРНК, сплайсінг мРНК, транскрипція, регуляція транскрипції. Білок має сайт для зв'язування з ДНК, іоном магнію, РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

Wang M., Cohen S.N. (1994). ard-1: a human gene that reverses the effects of temperature-sensitive and deletion mutations in the Escherichia coli rne gene and encodes an activity producing RNase E-like cleavages. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 91: 10591—10595. PMID 7524097 DOI:10.1073/pnas.91.22.10591
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Claverie-Martin F., Wang M., Cohen S.N. (1997). ARD-1 cDNA from human cells encodes a site-specific single-strand endoribonuclease that functionally resembles Escherichia coli RNase E. J. Biol. Chem. 272: 13823—13828. PMID 9153239 DOI:10.1074/jbc.272.21.13823
Beullens M., Bollen M. (2002). The protein phosphatase-1 regulator NIPP1 is also a splicing factor involved in a late step of spliceosome assembly. J. Biol. Chem. 277: 19855—19860. PMID 11909864 DOI:10.1074/jbc.M200847200
Boudrez A., Beullens M., Waelkens E., Stalmans W., Bollen M. (2002). Phosphorylation-dependent interaction between the splicing factors SAP155 and NIPP1. J. Biol. Chem. 277: 31834—31841. PMID 12105215 DOI:10.1074/jbc.M204427200
Lee J.H., You J., Dobrota E., Skalnik D.G. (2010). Identification and characterization of a novel human PP1 phosphatase complex. J. Biol. Chem. 285: 24466—24476. PMID 20516061 DOI:10.1074/jbc.M110.109801

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9296 (англ.) . Процитовано 25 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q12972 (англ.) . Архів оригіналу за 16 вересня 2016. Процитовано 25 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 1

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9296 (англ.) . Процитовано 25 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-4] UniProt, Q12972 (англ.) . Архів оригіналу за 16 вересня 2016. Процитовано 25 серпня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]