PRKD3

PRKD3
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2D9Z
Ідентифікатори
Символи	PRKD3, EPK2, PKC-NU, PKD3, PRKCN, nPKC-NU, protein kinase D3
Зовнішні ІД	OMIM: 607077 MGI: 1922542 HomoloGene: 2055 GeneCards: PRKD3
Реагує на сполуку
	sotrastaurin, gsk-690693
Онтологія гена
Молекулярна функція	• transferase activity; • nucleotide binding; • protein kinase activity; • protein kinase C activity; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • ATP binding; • зв'язування з іоном металу; • kinase activity; • protein serine/threonine kinase activity;
Клітинна компонента	• мембрана; • нуклеоплазма; • гіалоплазма; • цитоплазма;
Біологічний процес	• protein phosphorylation; • protein kinase C-activating G protein-coupled receptor signaling pathway; • GO:0007243 intracellular signal transduction; • фосфорилювання; • sphingolipid biosynthetic process; • protein kinase D signaling;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	23683
	75292
	ENSG00000115825
	ENSMUSG00000024070
	O94806
	Q8K1Y2
	NM_005813
	NM_001171004; NM_001171005; NM_029239
	NP_005804
	NP_001164475; NP_001164476; NP_083515
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

PRKD3 (англ. Protein kinase D3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 890 амінокислот, а молекулярна маса — 100 471^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSANNSPPSA	QKSVLPTAIP	AVLPAASPCS	SPKTGLSARL	SNGSFSAPSL
TNSRGSVHTV	SFLLQIGLTR	ESVTIEAQEL	SLSAVKDLVC	SIVYQKFPEC
GFFGMYDKIL	LFRHDMNSEN	ILQLITSADE	IHEGDLVEVV	LSALATVEDF
QIRPHTLYVH	SYKAPTFCDY	CGEMLWGLVR	QGLKCEGCGL	NYHKRCAFKI
PNNCSGVRKR	RLSNVSLPGP	GLSVPRPLQP	EYVALPSEES	HVHQEPSKRI
PSWSGRPIWM	EKMVMCRVKV	PHTFAVHSYT	RPTICQYCKR	LLKGLFRQGM
QCKDCKFNCH	KRCASKVPRD	CLGEVTFNGE	PSSLGTDTDI	PMDIDNNDIN
SDSSRGLDDT	EEPSPPEDKM	FFLDPSDLDV	ERDEEAVKTI	SPSTSNNIPL
MRVVQSIKHT	KRKSSTMVKE	GWMVHYTSRD	NLRKRHYWRL	DSKCLTLFQN
ESGSKYYKEI	PLSEILRISS	PRDFTNISQG	SNPHCFEIIT	DTMVYFVGEN
NGDSSHNPVL	AATGVGLDVA	QSWEKAIRQA	LMPVTPQASV	CTSPGQGKDH
KDLSTSISVS	NCQIQENVDI	STVYQIFADE	VLGSGQFGIV	YGGKHRKTGR
DVAIKVIDKM	RFPTKQESQL	RNEVAILQNL	HHPGIVNLEC	MFETPERVFV
VMEKLHGDML	EMILSSEKSR	LPERITKFMV	TQILVALRNL	HFKNIVHCDL
KPENVLLASA	EPFPQVKLCD	FGFARIIGEK	SFRRSVVGTP	AYLAPEVLRS
KGYNRSLDMW	SVGVIIYVSL	SGTFPFNEDE	DINDQIQNAA	FMYPPNPWRE
ISGEAIDLIN	NLLQVKMRKR	YSVDKSLSHP	WLQDYQTWLD	LREFETRIGE
RYITHESDDA	RWEIHAYTHN	LVYPKHFIMA	PNPDDMEEDP

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, кіназ, серин/треонінових протеїнкіназ, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, іонами металів, іоном цинку, іоном магнію. Локалізований у цитоплазмі, мембрані.

Література

Hayashi A., Seki N., Hattori A., Kozuma S., Saito T. (1999). PKCnu, a new member of the protein kinase C family, composes a fourth subfamily with PKCmu. Biochim. Biophys. Acta. 1450: 99—106. PMID 10231560 doi:10.1016/S0167-4889(99)00040-3
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 doi:10.1038/nbt1240
Chen J., Deng F., Li J., Wang Q.J. (2008). Selective binding of phorbol esters and diacylglycerol by individual C1 domains of the PKD family. Biochem. J. 411: 333—342. PMID 18076381 doi:10.1042/BJ20071334