PRMT5

PRMT5
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	4GQB, 4X60, 4X61, 4X63, 5EML, 5FA5, 5EMJ, 5EMK, 5EMM, 5C9Z
Ідентифікатори
Символи	PRMT5, HRMT1L5, IBP72, JBP1, SKB1, SKB1Hs, Protein arginine methyltransferase 5, HSL7
Зовнішні ІД	OMIM: 604045 MGI: 1351645 HomoloGene: 4454 GeneCards: PRMT5
шифр КФ	2.1.1.321
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0102674, GO:0102675 methyltransferase activity; • transferase activity; • histone methyltransferase activity (H4-R3 specific); • GO:0001106 transcription corepressor activity; • methyl-CpG binding; • core promoter sequence-specific DNA binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • protein heterodimerization activity; • ribonucleoprotein complex binding; • histone-arginine N-methyltransferase activity; • protein-arginine N-methyltransferase activity; • protein-arginine omega-N symmetric methyltransferase activity; • identical protein binding; • GO:0032403 protein-containing complex binding; • E-box binding;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • гіалоплазма; • комплекс Ґольджі; • нуклеоплазма; • methylosome; • клітинне ядро; • histone methyltransferase complex; • GO:0009327 protein-containing complex;
Біологічний процес	• regulation of mitotic nuclear division; • positive regulation of oligodendrocyte differentiation; • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • histone H4-R3 methylation; • ритмічний процес; • DNA-templated transcription, termination; • negative regulation of cell differentiation; • peptidyl-arginine N-methylation; • endothelial cell activation; • circadian regulation of gene expression; • transcription, DNA-templated; • spliceosomal snRNP assembly; • liver regeneration; • Метилювання; • peptidyl-arginine methylation; • regulation of ERK1 and ERK2 cascade; • regulation of DNA methylation; • проліферація; • Golgi ribbon formation; • Метилювання білків; • negative regulation of nucleic acid-templated transcription; • positive regulation of adenylate cyclase-inhibiting dopamine receptor signaling pathway; • regulation of signal transduction by p53 class mediator; • peptidyl-arginine methylation, to symmetrical-dimethyl arginine; • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization; • histone arginine methylation;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	10419
	27374
	ENSG00000100462
	ENSMUSG00000023110
	O14744
	Q8CIG8
NM_001039619; NM_001282953; NM_001282954; NM_001282955; NM_001282956;
	NM_006109
	NM_013768; NM_001313906; NM_001313907
NP_001034708; NP_001269882; NP_001269883; NP_001269884; NP_001269885;
	NP_006100
	NP_001300835; NP_001300836; NP_038796
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

PRMT5 (англ. Protein arginine methyltransferase 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 14-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 637 амінокислот, а молекулярна маса — 72 684^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAAMAVGGAG	GSRVSSGRDL	NCVPEIADTL	GAVAKQGFDF	LCMPVFHPRF
KREFIQEPAK	NRPGPQTRSD	LLLSGRDWNT	LIVGKLSPWI	RPDSKVEKIR
RNSEAAMLQE	LNFGAYLGLP	AFLLPLNQED	NTNLARVLTN	HIHTGHHSSM
FWMRVPLVAP	EDLRDDIIEN	APTTHTEEYS	GEEKTWMWWH	NFRTLCDYSK
RIAVALEIGA	DLPSNHVIDR	WLGEPIKAAI	LPTSIFLTNK	KGFPVLSKMH
QRLIFRLLKL	EVQFIITGTN	HHSEKEFCSY	LQYLEYLSQN	RPPPNAYELF
AKGYEDYLQS	PLQPLMDNLE	SQTYEVFEKD	PIKYSQYQQA	IYKCLLDRVP
EEEKDTNVQV	LMVLGAGRGP	LVNASLRAAK	QADRRIKLYA	VEKNPNAVVT
LENWQFEEWG	SQVTVVSSDM	REWVAPEKAD	IIVSELLGSF	ADNELSPECL
DGAQHFLKDD	GVSIPGEYTS	FLAPISSSKL	YNEVRACREK	DRDPEAQFEM
PYVVRLHNFH	QLSAPQPCFT	FSHPNRDPMI	DNNRYCTLEF	PVEVNTVLHG
FAGYFETVLY	QDITLSIRPE	THSPGMFSWF	PILFPIKQPI	TVREGQTICV
RFWRCSNSKK	VWYEWAVTAP	VCSAIHNPTG	RSYTIGL

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, репресорів, регуляторів хроматину, метилтрансфераз. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, біологічні ритми. Білок має сайт для зв'язування з s-аденозил-l-метіоніном. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, апараті гольджі.

Література

Krapivinsky G., Pu W., Wickman K., Krapivinsky L., Clapham D.E. (1998). pICln binds to a mammalian homolog of a yeast protein involved in regulation of cell morphology. J. Biol. Chem. 273: 10811—10814. PMID 9556550 DOI:10.1074/jbc.273.18.10811
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Meister G., Fischer U. (2002). Assisted RNP assembly: SMN and PRMT5 complexes cooperate in the formation of spliceosomal UsnRNPs. EMBO J. 21: 5853—5863. PMID 12411503 DOI:10.1093/emboj/cdf585
Jiang W., Roemer M.E., Newsham I.F. (2005). The tumor suppressor DAL-1/4.1B modulates protein arginine N-methyltransferase 5 activity in a substrate-specific manner. Biochem. Biophys. Res. Commun. 329: 522—530. PMID 15737618 DOI:10.1016/j.bbrc.2005.01.153
Schwaerzler A., Kreienkamp H.-J., Richter D. (2000). Interaction of the somatostatin receptor subtype 1 with the human homolog of the Shk1 kinase-binding protein from yeast. J. Biol. Chem. 275: 9557—9562. PMID 10734105 DOI:10.1074/jbc.275.13.9557
Pal S., Vishwanath S.N., Erdjument-Bromage H., Tempst P., Sif S. (2004). Human SWI/SNF-associated PRMT5 methylates histone H3 arginine 8 and negatively regulates expression of ST7 and NM23 tumor suppressor genes. Mol. Cell. Biol. 24: 9630—9645. PMID 15485929 DOI:10.1128/MCB.24.21.9630-9645.2004

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10894 (англ.) . Процитовано 21 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, O14744 (англ.) . Архів оригіналу за 14 липня 2017. Процитовано 21 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 14

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10894 (англ.) . Процитовано 21 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-4] UniProt, O14744 (англ.) . Архів оригіналу за 14 липня 2017. Процитовано 21 серпня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]