PRMT6

PRMT6
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	4HC4, 4QPP, 4QQK, 4Y2H, 4Y30, 5EGS, 5E8R, 5HZM
Ідентифікатори
Символи	PRMT6, HRMT1L6, protein arginine methyltransferase 6
Зовнішні ІД	OMIM: 608274 MGI: 2139971 HomoloGene: 10024 GeneCards: PRMT6
шифр КФ	2.1.1.321
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0102674, GO:0102675 methyltransferase activity; • transferase activity; • histone methyltransferase activity; • GO:0016275 protein-arginine omega-N monomethyltransferase activity; • histone methyltransferase activity (H4-R3 specific); • GO:0031493 histone binding; • protein-arginine omega-N asymmetric methyltransferase activity; • chromatin binding; • histone methyltransferase activity (H2A-R3 specific); • histone methyltransferase activity (H3-R2 specific); • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • protein-arginine N-methyltransferase activity; • histone-arginine N-methyltransferase activity;
Клітинна компонента	• нуклеоплазма; • клітинне ядро; • ядерце; • гіалоплазма;
Біологічний процес	• GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II; • transcription, DNA-templated; • cellular response to DNA damage stimulus; • клітинне старіння; • Метилювання; • peptidyl-arginine methylation, to asymmetrical-dimethyl arginine; • histone methylation; • GO:0022415 viral process; • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated; • GO:0100026 Репарація ДНК; • base-excision repair; • Метилювання білків; • histone H4-R3 methylation; • regulation of megakaryocyte differentiation; • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization; • histone H3-R2 methylation; • peptidyl-arginine N-methylation; • negative regulation of histone H3-K4 methylation; • regulation of signal transduction by p53 class mediator; • histone arginine methylation;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	55170
	99890
	ENSG00000198890
	ENSMUSG00000049300
	Q96LA8
	Q6NZB1
	NM_018137
	NM_178891
	NP_060607
	NP_849222
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

PRMT6 (англ. Protein arginine methyltransferase 6) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 375 амінокислот, а молекулярна маса — 41 938^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSQPKKRKLE	SGGGGEGGEG	TEEEDGAERE	AALERPRRTK	RERDQLYYEC
YSDVSVHEEM	IADRVRTDAY	RLGILRNWAA	LRGKTVLDVG	AGTGILSIFC
AQAGARRVYA	VEASAIWQQA	REVVRFNGLE	DRVHVLPGPV	ETVELPEQVD
AIVSEWMGYG	LLHESMLSSV	LHARTKWLKE	GGLLLPASAE	LFIAPISDQM
LEWRLGFWSQ	VKQHYGVDMS	CLEGFATRCL	MGHSEIVVQG	LSGEDVLARP
QRFAQLELSR	AGLEQELEAG	VGGRFRCSCY	GSAPMHGFAI	WFQVTFPGGE
SEKPLVLSTS	PFHPATHWKQ	ALLYLNEPVQ	VEQDTDVSGE	ITLLPSRDNP
RRLRVLLRYK	VGDQEEKTKD	FAMED

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, репресорів, регуляторів хроматину, метилтрансфераз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як взаємодія хазяїн-вірус, транскрипція, регуляція транскрипції, пошкодження ДНК, репарація ДНК, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з s-аденозил-l-метіоніном. Локалізований у ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Miranda T.B., Webb K.J., Edberg D.D., Reeves R., Clarke S. (2005). Protein arginine methyltransferase 6 specifically methylates the nonhistone chromatin protein HMGA1a. Biochem. Biophys. Res. Commun. 336: 831—835. PMID 16157300 doi:10.1016/j.bbrc.2005.08.179
Herrmann F., Lee J., Bedford M.T., Fackelmayer F.O. (2005). Dynamics of human protein arginine methyltransferase 1(PRMT1) in vivo. J. Biol. Chem. 280: 38005—38010. PMID 16159886 doi:10.1074/jbc.M502458200
Invernizzi C.F., Xie B., Richard S., Wainberg M.A. (2006). PRMT6 diminishes HIV-1 Rev binding to and export of viral RNA. Retrovirology. 3: 93—93. PMID 17176473 doi:10.1186/1742-4690-3-93
Xie B., Invernizzi C.F., Richard S., Wainberg M.A. (2007). Arginine methylation of the human immunodeficiency virus type 1 Tat protein by PRMT6 negatively affects Tat Interactions with both cyclin T1 and the Tat transactivation region. J. Virol. 81: 4226—4234. PMID 17267505 doi:10.1128/JVI.01888-06
Lakowski T.M., Frankel A. (2008). A kinetic study of human protein arginine N-methyltransferase 6 reveals a distributive mechanism. J. Biol. Chem. 283: 10015—10025. PMID 18263580 doi:10.1074/jbc.M710176200

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:18241 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q96LA8 (англ.) . Архів оригіналу за 30 січня 2018. Процитовано 28 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 1

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:18241 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-4] UniProt, Q96LA8 (англ.) . Архів оригіналу за 30 січня 2018. Процитовано 28 серпня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]