PROX1

PROX1
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2LMD
Ідентифікатори
Символи	PROX1, prospero homeobox 1
Зовнішні ІД	OMIM: 601546 MGI: 97772 HomoloGene: 2069 GeneCards: PROX1
Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding; • sequence-specific DNA binding; • GO:0001106 transcription corepressor activity; • DNA binding domain binding; • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity; • LBD domain binding; • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific; • core promoter sequence-specific DNA binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • nuclear receptor binding; • transcription factor activity, RNA polymerase II distal enhancer sequence-specific binding; • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific; • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • клітинне ядро;
Біологічний процес	• dorsal spinal cord development; • olfactory placode formation; • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • positive regulation of endothelial cell proliferation; • venous blood vessel morphogenesis; • розвиток нирки; • lymphangiogenesis; • lung development; • dentate gyrus development; • ритмічний процес; • ventricular septum morphogenesis; • cardiac muscle cell differentiation; • lymphatic endothelial cell differentiation; • positive regulation of sarcomere organization; • positive regulation of forebrain neuron differentiation; • endocardium formation; • hepatocyte differentiation; • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II; • negative regulation of DNA-binding transcription factor activity; • lymph vessel development; • hepatocyte cell migration; • transcription, DNA-templated; • lens placode formation involved in camera-type eye formation; • skeletal muscle thin filament assembly; • neuronal stem cell population maintenance; • positive regulation of endothelial cell migration; • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated; • positive regulation of heart growth; • ventricular cardiac muscle tissue morphogenesis; • positive regulation of neural precursor cell proliferation; • retina morphogenesis in camera-type eye; • multicellular organism development; • negative regulation of viral genome replication; • brain development; • branching involved in pancreas morphogenesis; • positive regulation of cell cycle; • lens development in camera-type eye; • response to nutrient levels; • hepatocyte proliferation; • positive regulation of cell cycle checkpoint; • regulation of circadian rhythm; • циркадний ритм; • acinar cell differentiation; • neural tube development; • neuron differentiation; • positive regulation of cell population proliferation; • lens morphogenesis in camera-type eye; • positive regulation of cyclin-dependent protein serine/threonine kinase activity; • negative regulation of bile acid biosynthetic process; • embryonic retina morphogenesis in camera-type eye; • регуляція експресії генів; • Детермінація; • pancreas development; • liver development; • atrial cardiac muscle tissue morphogenesis; • endothelial cell differentiation; • inner ear development; • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated; • ventricular cardiac myofibril assembly; • otic placode formation; • aorta smooth muscle tissue morphogenesis; • cerebellar granule cell differentiation; • negative regulation of cell population proliferation; • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II; • lens fiber cell morphogenesis;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	5629
	19130
	ENSG00000117707
	ENSMUSG00000010175
	Q92786
	P48437
	NM_001270616; NM_002763
	NM_008937; NM_001360827
	NP_001257545; NP_002754
	NP_032963; NP_001347756
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

PROX1 (англ. Prospero homeobox 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 737 амінокислот, а молекулярна маса — 83 203^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MPDHDSTALL	SRQTKRRRVD	IGVKRTVGTA	SAFFAKARAT	FFSAMNPQGS
EQDVEYSVVQ	HADGEKSNVL	RKLLKRANSY	EDAMMPFPGA	TIISQLLKNN
MNKNGGTEPS	FQASGLSSTG	SEVHQEDICS	NSSRDSPPEC	LSPFGRPTMS
QFDMDRLCDE	HLRAKRARVE	NIIRGMSHSP	SVALRGNENE	REMAPQSVSP
RESYRENKRK	QKLPQQQQQS	FQQLVSARKE	QKREERRQLK	QQLEDMQKQL
RQLQEKFYQI	YDSTDSENDE	DGNLSEDSMR	SEILDARAQD	SVGRSDNEMC
ELDPGQFIDR	ARALIREQEM	AENKPKREGN	NKERDHGPNS	LQPEGKHLAE
TLKQELNTAM	SQVVDTVVKV	FSAKPSRQVP	QVFPPLQIPQ	ARFAVNGENH
NFHTANQRLQ	CFGDVIIPNP	LDTFGNVQMA	SSTDQTEALP	LVVRKNSSDQ
SASGPAAGGH	HQPLHQSPLS	ATTGFTTSTF	RHPFPLPLMA	YPFQSPLGAP
SGSFSGKDRA	SPESLDLTRD	TTSLRTKMSS	HHLSHHPCSP	AHPPSTAEGL
SLSLIKSECG	DLQDMSEISP	YSGSAMQEGL	SPNHLKKAKL	MFFYTRYPSS
NMLKTYFSDV	KFNRCITSQL	IKWFSNFREF	YYIQMEKYAR	QAINDGVTST
EELSITRDCE	LYRALNMHYN	KANDFEVPER	FLEVAQITLR	EFFNAIIAGK
DVDPSWKKAI	YKVICKLDSE	VPEIFKSPNC	LQELLHE

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, білків розвитку, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, біологічні ритми. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Elsir T., Smits A., Lindstroem M.S., Nister M. (2012). Transcription factor PROX1: its role in development and cancer. Cancer Metastasis Rev. 31: 793—805. PMID 22733308 DOI:10.1007/s10555-012-9390-8
Takeda Y., Jetten A.M. (2013). Prospero-related homeobox 1 (Prox1) functions as a novel modulator of retinoic acid-related orphan receptors alpha- and gamma-mediated transactivation. Nucleic Acids Res. 41: 6992—7008. PMID 23723244 DOI:10.1093/nar/gkt447

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9459 (англ.) . Архів оригіналу за 20 травня 2017. Процитовано 25 серпня 2017. [Архівовано 2017-05-20 у Wayback Machine.]
↑ UniProt, Q92786 (англ.) . Архів оригіналу за 8 вересня 2017. Процитовано 25 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 1

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9459 (англ.) . Архів оригіналу за 20 травня 2017. Процитовано 25 серпня 2017. [Архівовано 2017-05-20 у Wayback Machine.]

[UniProt-4] UniProt, Q92786 (англ.) . Архів оригіналу за 8 вересня 2017. Процитовано 25 серпня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]