PRPF19

PRPF19
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	4LG8
Ідентифікатори
Символи	PRPF19, NMP200, PRP19, PSO4, SNEV, UBOX4, hPSO4, pre-mRNA processing factor 19
Зовнішні ІД	OMIM: 608330 MGI: 106247 HomoloGene: 6421 GeneCards: PRPF19
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:1904264, GO:1904822, GO:0090622, GO:0090302 ubiquitin protein ligase activity; • GO:0050372 ubiquitin-protein transferase activity; • ubiquitin-ubiquitin ligase activity; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • identical protein binding; • transferase activity;
Клітинна компонента	• site of double-strand break; • nuclear speck; • catalytic step 2 spliceosome; • мембрана; • lipid droplet; • веретено поділу; • Prp19 complex; • DNA replication factor A complex; • spliceosomal complex; • цитоскелет; • клітинне ядро; • цитоплазма; • нуклеоплазма; • U2-type catalytic step 1 spliceosome; • U2-type catalytic step 2 spliceosome;
Біологічний процес	• mRNA splicing, via spliceosome; • spliceosomal tri-snRNP complex assembly; • lipid biosynthetic process; • negative regulation of neuron differentiation; • positive regulation of astrocyte differentiation; • positive regulation of mRNA splicing, via spliceosome; • protein K63-linked ubiquitination; • mRNA processing; • protein polyubiquitination; • inner cell mass cell proliferation; • cellular response to DNA damage stimulus; • spliceosomal complex assembly; • Убіквітин-залежний протеоліз; • proteasomal protein catabolic process; • transcription-coupled nucleotide-excision repair; • double-strand break repair via nonhomologous end joining; • GO:0100026 Репарація ДНК; • Сплайсинг РНК; • generation of catalytic spliceosome for first transesterification step; • positive regulation of neuron differentiation;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	27339
	28000
	ENSG00000110107
	ENSMUSG00000024735
	Q9UMS4
	Q99KP6
	NM_014502
	NM_001253843; NM_001253844; NM_134129
	NP_055317
	NP_001240772; NP_001240773; NP_598890
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

PRPF19 (англ. Pre-mRNA processing factor 19) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 504 амінокислот, а молекулярна маса — 55 181^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSLICSISNE	VPEHPCVSPV	SNHVYERRLI	EKYIAENGTD	PINNQPLSEE
QLIDIKVAHP	IRPKPPSATS	IPAILKALQD	EWDAVMLHSF	TLRQQLQTTR
QELSHALYQH	DAACRVIARL	TKEVTAAREA	LATLKPQAGL	IVPQAVPSSQ
PSVVGAGEPM	DLGELVGMTP	EIIQKLQDKA	TVLTTERKKR	GKTVPEELVK
PEELSKYRQV	ASHVGLHSAS	IPGILALDLC	PSDTNKILTG	GADKNVVVFD
KSSEQILATL	KGHTKKVTSV	VFHPSQDLVF	SASPDATIRI	WSVPNASCVQ
VVRAHESAVT	GLSLHATGDY	LLSSSDDQYW	AFSDIQTGRV	LTKVTDETSG
CSLTCAQFHP	DGLIFGTGTM	DSQIKIWDLK	ERTNVANFPG	HSGPITSIAF
SENGYYLATA	ADDSSVKLWD	LRKLKNFKTL	QLDNNFEVKS	LIFDQSGTYL
ALGGTDVQIY	ICKQWTEILH	FTEHSGLTTG	VAFGHHAKFI	ASTGMDRSLK
FYSL

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до трансфераз. Задіяний у таких біологічних процесах як процесінг мРНК, сплайсінг мРНК, пошкодження ДНК, репарація ДНК, убіквітинування білків. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, ядрі, ліпідних краплях.

Література

Mahajan K.N., Mitchell B.S. (2003). Role of human Pso4 in mammalian DNA repair and association with terminal deoxynucleotidyl transferase. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 100: 10746—10751. PMID 12960389 doi:10.1073/pnas.1631060100
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Hatakeyama S., Yada M., Matsumoto M., Ishida N., Nakayama K.I. (2001). U box proteins as a new family of ubiquitin-protein ligases. J. Biol. Chem. 276: 33111—33120. PMID 11435423 doi:10.1074/jbc.M102755200
Jurica M.S., Licklider L.J., Gygi S.P., Grigorieff N., Moore M.J. (2002). Purification and characterization of native spliceosomes suitable for three-dimensional structural analysis. RNA. 8: 426—439. PMID 11991638 doi:10.1017/S1355838202021088
Sihn C.R., Cho S.Y., Lee J.H., Lee T.R., Kim S.H. (2007). Mouse homologue of yeast Prp19 interacts with mouse SUG1, the regulatory subunit of 26S proteasome. Biochem. Biophys. Res. Commun. 356: 175—180. PMID 17349974 doi:10.1016/j.bbrc.2007.02.134
David C.J., Boyne A.R., Millhouse S.R., Manley J.L. (2011). The RNA polymerase II C-terminal domain promotes splicing activation through recruitment of a U2AF65-Prp19 complex. Genes Dev. 25: 972—983. PMID 21536736 doi:10.1101/gad.2038011

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:17896 (англ.) . Архів оригіналу за 22 березня 2016. Процитовано 28 лютого 2017. [Архівовано 2016-03-22 у Wayback Machine.]
↑ UniProt, Q9UMS4 (англ.) . Архів оригіналу за 7 листопада 2016. Процитовано 28 лютого 2017.

Див. також

Хромосома 11

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:17896 (англ.) . Архів оригіналу за 22 березня 2016. Процитовано 28 лютого 2017. [Архівовано 2016-03-22 у Wayback Machine.]

[UniProt-4] UniProt, Q9UMS4 (англ.) . Архів оригіналу за 7 листопада 2016. Процитовано 28 лютого 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]