PRPF40B

PRPF40B
Ідентифікатори
Символи	PRPF40B, HYPC, pre-mRNA processing factor 40 homolog B
Зовнішні ІД	MGI: 1925583 HomoloGene: 81828 GeneCards: PRPF40B
Онтологія гена Молекулярна функція • RNA binding Клітинна компонента • U1 snRNP • nuclear speck • U2-type prespliceosome • клітинне ядро Біологічний процес • mRNA splicing, via spliceosome • mRNA processing • Сплайсинг РНК • mRNA cis splicing, via spliceosome Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	25766	54614
Ensembl	ENSG00000110844	ENSMUSG00000023007
UniProt	Q6NWY9	Q80W14
RefSeq (мРНК)	NM_001031698 NM_012272 NM_001363607 NM_001379030 NM_001379031 NM_001379032 NM_001379033 NM_001379034 NM_001379035 NM_001379036 NM_001379037	NM_018786 NM_001348256
RefSeq (білок)	NP_001026868 NP_036404 NP_001350536 NP_001365959 NP_001365960 NP_001365961 NP_001365962 NP_001365963 NP_001365964 NP_001365965 NP_001365966	NP_061256 NP_001335185 NP_001357561 NP_001357562 NP_001357563 NP_001357564
Локус (UCSC)	Хр. 12: 49.57 – 49.64 Mb	Хр. 15: 99.3 – 99.32 Mb
PubMed search	[1]	[2]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

PRPF40B (англ. Pre-mRNA processing factor 40 homolog B) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 871 амінокислот, а молекулярна маса — 99 358^[4].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MMPPPFMPPP		GIPPPFPPMG		LPPMSQRPPA		IPPMPPGILP		PMLPPMGAPP
PLTQIPGMVP		PMMPGMLMPA		VPVTAATAPG		ADTASSAVAG		TGPPRALWSE
HVAPDGRIYY		YNADDKQSVW		EKPSVLKSKA		ELLLSQCPWK		EYKSDTGKPY
YYNNQSKESR		WTRPKDLDDL		EVLVKQEAAG		KQQQQLPQTL		QPQPPQPQPD
PPPVPPGPTP		VPTGLLEPEP		GGSEDCDVLE		ATQPLEQGFL		QQLEEGPSSS
GQHQPQQEEE		ESKPEPERSG		LSWSNREKAK		QAFKELLRDK		AVPSNASWEQ
AMKMVVTDPR		YSALPKLSEK		KQAFNAYKAQ		REKEEKEEAR		LRAKEAKQTL
QHFLEQHERM		TSTTRYRRAE		QTFGELEVWA		VVPERDRKEV		YDDVLFFLAK
KEKEQAKQLR		RRNIQALKSI		LDGMSSVNFQ		TTWSQAQQYL		MDNPSFAQDH
QLQNMDKEDA		LICFEEHIRA		LEREEEEERE		RARLRERRQQ		RKNREAFQTF
LDELHETGQL		HSMSTWMELY		PAVSTDVRFA		NMLGQPGSTP		LDLFKFYVEE
LKARFHDEKK		IIKDILKDRG		FCVEVNTAFE		DFAHVISFDK		RAAALDAGNI
KLTFNSLLEK		AEAREREREK		EEARRMRRRE		AAFRSMLRQA		VPALELGTAW
EEVRERFVCD		SAFEQITLES		ERIRLFREFL		QVLEQTECQH		LHTKGRKHGR
KGKKHHHKRS		HSPSGSESEE		EELPPPSLRP		PKRRRRNPSE		SGSEPSSSLD
SVESGGAALG		GRGSPSSHLL		GADHGLRKAK		KPKKKTKKRR		HKSNSPESET
DPEEKAGKES		DEKEQEQDKD		RELQQAELPN		RSPGFGIKKE		KTGWDTSESE
LSEGELERRR		RTLLQQLDDH		Q

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як процесинг мРНК, сплайсинг мРНК, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504

Примітки

1. Human PubMed Reference:.
2. Mouse PubMed Reference:.
3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:25031 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.
4. UniProt, Q6NWY9 (англ.) . Архів оригіналу за 12 грудня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

• Хромосома 12

Портал «Біологія»   Портал «Хімія»