PSMB7

PSMB7
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	4R3O, 4R67, 5A0Q
Ідентифікатори
Символи	PSMB7, proteasome subunit beta 7, Z, proteasome 20S subunit beta 7
Зовнішні ІД	OMIM: 604030 MGI: 107637 HomoloGene: 2093 GeneCards: PSMB7
Онтологія гена
Молекулярна функція	• endopeptidase activity; • GO:0070122 peptidase activity; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • threonine-type endopeptidase activity; • hydrolase activity;
Клітинна компонента	• нуклеоплазма; • Протеасома; • екзосома; • клітинне ядро; • proteasome core complex; • extracellular region; • цитоплазма; • гіалоплазма; • secretory granule lumen; • ficolin-1-rich granule lumen; • proteasome core complex, beta-subunit complex;
Біологічний процес	• regulation of cellular amino acid metabolic process; • antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class I, TAP-dependent; • regulation of mRNA stability; • positive regulation of protein targeting to mitochondrion; • positive regulation of canonical Wnt signaling pathway; • protein polyubiquitination; • stimulatory C-type lectin receptor signaling pathway; • tumor necrosis factor-mediated signaling pathway; • MAPK cascade; • протеоліз; • Fc-epsilon receptor signaling pathway; • NIK/NF-kappaB signaling; • anaphase-promoting complex-dependent catabolic process; • proteolysis involved in cellular protein catabolic process; • T cell receptor signaling pathway; • negative regulation of canonical Wnt signaling pathway; • Wnt signaling pathway, planar cell polarity pathway; • proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process; • GO:0022415 viral process; • negative regulation of G2/M transition of mitotic cell cycle; • protein deubiquitination; • SCF-dependent proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process; • neutrophil degranulation; • трансмембранний транспорт; • regulation of transcription from RNA polymerase II promoter in response to hypoxia; • посттрансляційна модифікація; • regulation of hematopoietic stem cell differentiation; • proteasomal protein catabolic process; • proteasomal ubiquitin-independent protein catabolic process; • interleukin-1-mediated signaling pathway; • regulation of mitotic cell cycle phase transition;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	5695
	19177
	ENSG00000136930
	ENSMUSG00000026750
	Q99436; Q5TBG5
	P70195
	NM_002799
	NM_011187
	NP_002790
	NP_035317
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

PSMB7 (англ. Proteasome subunit beta 7) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 277 амінокислот, а молекулярна маса — 29 965^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAAVSVYAPP	VGGFSFDNCR	RNAVLEADFA	KRGYKLPKVR	KTGTTIAGVV
YKDGIVLGAD	TRATEGMVVA	DKNCSKIHFI	SPNIYCCGAG	TAADTDMTTQ
LISSNLELHS	LSTGRLPRVV	TANRMLKQML	FRYQGYIGAA	LVLGGVDVTG
PHLYSIYPHG	STDKLPYVTM	GSGSLAAMAV	FEDKFRPDME	EEEAKNLVSE
AIAAGIFNDL	GSGSNIDLCV	ISKNKLDFLR	PYTVPNKKGT	RLGRYRCEKG
TTAVLTEKIT	PLEIEVLEET	VQTMDTS

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, треонінових протеаз. Задіяний у таких біологічних процесах, як взаємодія хазяїн-вірус, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Yano M., Koumoto Y., Kanesaki Y., Wu X., Kido H. (2004). 20S proteasome prevents aggregation of heat-denatured proteins without PA700 regulatory subcomplex like a molecular chaperone. Biomacromolecules. 5: 1465—1469. PMID 15244466 DOI:10.1021/bm049957a
Rho J.H., Qin S., Wang J.Y., Roehrl M.H. (2008). Proteomic expression analysis of surgical human colorectal cancer tissues: up-regulation of PSB7, PRDX1, and SRP9 and hypoxic adaptation in cancer. J. Proteome Res. 7: 2959—2972. PMID 18549262 DOI:10.1021/pr8000892
Rut W., Drag M. (2016). Human 20S proteasome activity towards fluorogenic peptides of various chain lengths. Biol. Chem. 397: 921—926. PMID 27176742 DOI:10.1515/hsz-2016-0176
da Fonseca P.C., Morris E.P. (2015). Cryo-EM reveals the conformation of a substrate analogue in the human 20S proteasome core. Nat. Commun. 6: 7573—7573. PMID 26133119 DOI:10.1038/ncomms8573
Harshbarger W., Miller C., Diedrich C., Sacchettini J. (2015). Crystal structure of the human 20S proteasome in complex with carfilzomib. Structure. 23: 418—424. PMID 25599644 DOI:10.1016/j.str.2014.11.017

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9544 (англ.) . Архів оригіналу за 22 березня 2016. Процитовано 7 вересня 2017.
↑ UniProt, Q99436 (англ.) . Архів оригіналу за 22 вересня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 9

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9544 (англ.) . Архів оригіналу за 22 березня 2016. Процитовано 7 вересня 2017.

[UniProt-4] UniProt, Q99436 (англ.) . Архів оригіналу за 22 вересня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]