RAB18

RAB18
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1X3S
Ідентифікатори
Символи	RAB18, RAB18LI1, WARBM3, member RAS oncogene family
Зовнішні ІД	OMIM: 602207 MGI: 102790 HomoloGene: 40765 GeneCards: RAB18
Пов'язані генетичні захворювання
Warburg micro syndrome 3, Warburg micro syndrome[1]
Реагує на сполуку
Viroporin 3a[2]
Онтологія гена Молекулярна функція • nucleotide binding • GTP binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GDP binding • GO:0006184 GTPase activity Клітинна компонента • внутрішньоклітинний • мембрана • endoplasmic reticulum tubular network • гіалоплазма • endoplasmic reticulum membrane • клітинна мембрана • secretory granule membrane • комплекс Ґольджі • синапс Біологічний процес • розвиток ока • protein transport • multicellular organism development • endoplasmic reticulum tubular network organization • brain development • lipid droplet organization • neutrophil degranulation • small GTPase mediated signal transduction • import into nucleus • intracellular protein transport • Rab protein signal transduction Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	22931	19330
Ensembl	ENSG00000099246	ENSMUSG00000073639
UniProt	Q9NP72	P35293
RefSeq (мРНК)	NM_001256410 NM_001256411 NM_001256412 NM_001256415 NM_021252	NM_001278447 NM_181070
RefSeq (білок)	NP_001243339 NP_001243340 NP_001243341 NP_001243344 NP_067075	NP_001265376 NP_851415
Локус (UCSC)	Хр. 10: 27.5 – 27.54 Mb	Хр. 18: 6.73 – 6.79 Mb
PubMed search	[3]	[4]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

RAB18 (англ. RAB18, member RAS oncogene family) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 10-ї хромосоми.^[5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 206 амінокислот, а молекулярна маса — 22 977^[6].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MDEDVLTTLK		ILIIGESGVG		KSSLLLRFTD		DTFDPELAAT		IGVDFKVKTI
SVDGNKAKLA		IWDTAGQERF		RTLTPSYYRG		AQGVILVYDV		TRRDTFVKLD
NWLNELETYC		TRNDIVNMLV		GNKIDKENRE		VDRNEGLKFA		RKHSMLFIEA
SAKTCDGVQC		AFEELVEKII		QTPGLWESEN		QNKGVKLSHR		EEGQGGGACG
GYCSVL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до білків розвитку, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт білків, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з нуклеотидами, ГТФ. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

• Schaefer U., Seibold S., Schneider A., Neugebauer E. (2000). Isolation and characterisation of the human rab18 gene after stimulation of endothelial cells with histamine. FEBS Lett. 466: 148—154. PMID 10648831 doi:10.1016/S0014-5793(99)01778-0
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504

Примітки

1. Захворювання, генетично пов'язані з RAB18 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
2. Сполуки, які фізично взаємодіють з RAB18, member RAS oncogene family переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
3. Human PubMed Reference:.
4. Mouse PubMed Reference:.
5. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:14244 (англ.) . Архів оригіналу за 23 вересня 2017. Процитовано 8 вересня 2017. [Архівовано 2017-09-23 у Wayback Machine.]
6. UniProt, Q9NP72 (англ.) . Архів оригіналу за 21 вересня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.

Див. також

• Хромосома 10

Портал «Біологія»   Портал «Хімія»