RAB1B

RAB1B
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	3JZA, 3NKV, 4HLQ, 4I1O
Ідентифікатори
Символи	RAB1B, member RAS oncogene family
Зовнішні ІД	OMIM: 612565 MGI: 1923558 HomoloGene: 128838 GeneCards: RAB1B
Онтологія гена
Молекулярна функція	• nucleotide binding; • GTP binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • GO:0006184 GTPase activity;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • phagophore assembly site membrane; • комплекс Ґольджі; • мембрана; • Golgi membrane; • transport vesicle; • мітохондрія; • екзосома; • endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment membrane; • endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment; • endoplasmic reticulum membrane; • гіалоплазма; • perinuclear region of cytoplasm;
Біологічний процес	• establishment of endothelial intestinal barrier; • positive regulation of glycoprotein metabolic process; • автофагія; • regulation of autophagosome assembly; • endoplasmic reticulum to Golgi vesicle-mediated transport; • COPII vesicle coating; • protein transport; • retrograde vesicle-mediated transport, Golgi to endoplasmic reticulum; • посттрансляційна модифікація; • GO:0015915 транспорт; • intracellular protein transport; • Rab protein signal transduction;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	81876
	76308
	ENSG00000174903
	ENSMUSG00000024870
	Q9H0U4
	Q9D1G1
	NM_030981
	NM_029576
	NP_112243
	NP_083852
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

RAB1B (англ. RAB1B, member RAS oncogene family) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 201 амінокислот, а молекулярна маса — 22 171^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MNPEYDYLFK	LLLIGDSGVG	KSCLLLRFAD	DTYTESYIST	IGVDFKIRTI
ELDGKTIKLQ	IWDTAGQERF	RTITSSYYRG	AHGIIVVYDV	TDQESYANVK
QWLQEIDRYA	SENVNKLLVG	NKSDLTTKKV	VDNTTAKEFA	DSLGIPFLET
SAKNATNVEQ	AFMTMAAEIK	KRMGPGAASG	GERPNLKIDS	TPVKPAGGGC
C

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт, транспорт білків, автофагія. Білок має сайт для зв'язування з нуклеотидами, ГТФ. Локалізований у цитоплазмі, мембрані.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Wilson A.L., Sheridan K.M., Erdman R.A., Maltese W.A. (1996). Prenylation of a Rab1B mutant with altered GTPase activity is impaired in cell-free systems but not in intact mammalian cells. Biochem. J. 318: 1007—1014. PMID 8836150 doi:10.1042/bj3181007
Overmeyer J.H., Wilson A.L., Erdman R.A., Maltese W.A. (1998). The putative 'switch 2' domain of the Ras-related GTPase, Rab1B, plays an essential role in the interaction with Rab escort protein. Mol. Biol. Cell. 9: 223—235. PMID 9437002 doi:10.1091/mbc.9.1.223
Overmeyer J.H., Wilson A.L., Maltese W.A. (2001). Membrane targeting of a Rab GTPase that fails to associate with Rab escort protein (REP) or guanine nucleotide dissociation inhibitor (GDI). J. Biol. Chem. 276: 20379—20386. PMID 11389151 doi:10.1074/jbc.M101511200
Fischer J., Weide T., Barnekow A. (2005). The MICAL proteins and rab1: a possible link to the cytoskeleton?. Biochem. Biophys. Res. Commun. 328: 415—423. PMID 15694364 doi:10.1016/j.bbrc.2004.12.182
Zoppino F.C., Militello R.D., Slavin I., Alvarez C., Colombo M.I. (2010). Autophagosome formation depends on the small GTPase Rab1 and functional ER exit sites. Traffic. 11: 1246—1261. PMID 20545908 doi:10.1111/j.1600-0854.2010.01086.x

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:18370 (англ.) . Архів оригіналу за 17 червня 2017. Процитовано 6 лютого 2017. [Архівовано 2017-06-17 у Wayback Machine.]
↑ UniProt, Q9H0U4 (англ.) . Архів оригіналу за 22 жовтня 2016. Процитовано 6 лютого 2017.

Див. також

Хромосома 11

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:18370 (англ.) . Архів оригіналу за 17 червня 2017. Процитовано 6 лютого 2017. [Архівовано 2017-06-17 у Wayback Machine.]

[UniProt-4] UniProt, Q9H0U4 (англ.) . Архів оригіналу за 22 жовтня 2016. Процитовано 6 лютого 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]