RAB38

RAB38
Ідентифікатори
Символи	RAB38, NY-MEL-1, rrGTPbp, member RAS oncogene family
Зовнішні ІД	OMIM: 606281 MGI: 1919683 HomoloGene: 21353 GeneCards: RAB38
Онтологія гена Молекулярна функція • AP-2 adaptor complex binding • nucleotide binding • BLOC-2 complex binding • GTP binding • GTP-dependent protein binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • AP-3 adaptor complex binding • AP-1 adaptor complex binding • GO:0006184 GTPase activity Клітинна компонента • цитоплазма • везикула • phagocytic vesicle membrane • комплекс Ґольджі • мембрана • Меланосома • клітинна мембрана • early endosome • phagocytic vesicle • ендоплазматичний ретикулум • early endosome lumen • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • лізосома • мітохондрія • mitochondria associated membranes • гіалоплазма • melanosome membrane • trans-Golgi network Біологічний процес • protein localization to membrane • platelet dense granule organization • organelle organization • phagosome acidification • endosome to melanosome transport • protein transport • melanosome assembly • mitochondrion organization • vesicle-mediated transport • small GTPase mediated signal transduction • посттрансляційна модифікація • positive regulation of phosphatidylcholine biosynthetic process • intracellular protein transport • Rab protein signal transduction Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	23682	72433
Ensembl	ENSG00000123892	ENSMUSG00000030559
UniProt	P57729	Q8QZZ8
RefSeq (мРНК)	NM_022337	NM_028238
RefSeq (білок)	NP_071732 NP_071732.1	NP_082514
Локус (UCSC)	Хр. 11: 88.11 – 88.18 Mb	Хр. 7: 88.08 – 88.14 Mb
PubMed search	[1]	[2]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

RAB38 (англ. RAB38, member RAS oncogene family) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 211 амінокислот, а молекулярна маса — 23 712^[4].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MQAPHKEHLY		KLLVIGDLGV		GKTSIIKRYV		HQNFSSHYRA		TIGVDFALKV
LHWDPETVVR		LQLWDIAGQE		RFGNMTRVYY		REAMGAFIVF		DVTRPATFEA
VAKWKNDLDS		KLSLPNGKPV		SVVLLANKCD		QGKDVLMNNG		LKMDQFCKEH
GFVGWFETSA		KENINIDEAS		RCLVKHILAN		ECDLMESIEP		DVVKPHLTST
KVASCSGCAK		S

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт білків. Білок має сайт для зв'язування з нуклеотидами, ГТФ. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, цитоплазматичних везикулах.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
• Leung K.F., Baron R., Ali B.R., Magee A.I., Seabra M.C. (2007). Rab GTPases containing a CAAX motif are processed post-geranylgeranylation by proteolysis and methylation. J. Biol. Chem. 282: 1487—1497. PMID 17114793 doi:10.1074/jbc.M605557200
• Seto S., Tsujimura K., Koide Y. (2011). Rab GTPases regulating phagosome maturation are differentially recruited to mycobacterial phagosomes. Traffic. 12: 407—420. PMID 21255211 doi:10.1111/j.1600-0854.2011.01165.x
• Gerondopoulos A., Langemeyer L., Liang J.R., Linford A., Barr F.A. (2012). BLOC-3 mutated in Hermansky-Pudlak syndrome is a Rab32/38 guanine nucleotide exchange factor. Curr. Biol. 22: 2135—2139. PMID 23084991 doi:10.1016/j.cub.2012.09.020

Примітки

1. Human PubMed Reference:.
2. Mouse PubMed Reference:.
3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9776 (англ.) . Архів оригіналу за 15 вересня 2015. Процитовано 8 вересня 2017. [Архівовано 2015-09-15 у Wayback Machine.]
4. UniProt, P57729 (англ.) . Архів оригіналу за 7 серпня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.

Див. також

• Хромосома 11

Портал «Біологія»   Портал «Хімія»