RAB4A

RAB4A
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1YU9, 1Z0K, 2BMD, 2BME
Ідентифікатори
Символи	RAB4A, HRES-1, HRES-1/RAB4, HRES1, RAB4, member RAS oncogene family
Зовнішні ІД	OMIM: 179511 MGI: 105069 HomoloGene: 101538 GeneCards: RAB4A
Онтологія гена
Молекулярна функція	• nucleotide binding; • GDP binding; • ATPase binding; • GTP binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • GO:0006184 GTPase activity; • ATPase activator activity; • syntaxin binding; • ionotropic glutamate receptor binding;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • recycling endosome; • везикула; • гіалоплазма; • ендосома; • мембрана; • внутрішньоклітинна мембранна органела; • insulin-responsive compartment; • клітинна мембрана; • perinuclear region of cytoplasm; • екзосома; • cytoplasmic vesicle membrane; • postsynaptic recycling endosome; • early endosome membrane; • recycling endosome membrane; • anchored component of synaptic vesicle membrane;
Біологічний процес	• regulation of endocytosis; • antigen processing and presentation; • positive regulation of ATP-dependent activity; • Rab protein signal transduction; • protein transport; • phosphatidylinositol biosynthetic process; • intracellular protein transport; • small GTPase mediated signal transduction;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	5867
	19341
	ENSG00000168118
	ENSMUSG00000019478
	P20338
	P56371
	NM_001271998; NM_004578
	NM_009003
	NP_001258927; NP_004569; NP_004569.2
	NP_033029
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

RAB4A (англ. RAB4A, member RAS oncogene family) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 218 амінокислот, а молекулярна маса — 24 390^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSQTAMSETY	DFLFKFLVIG	NAGTGKSCLL	HQFIEKKFKD	DSNHTIGVEF
GSKIINVGGK	YVKLQIWDTA	GQERFRSVTR	SYYRGAAGAL	LVYDITSRET
YNALTNWLTD	ARMLASQNIV	IILCGNKKDL	DADREVTFLE	ASRFAQENEL
MFLETSALTG	ENVEEAFVQC	ARKILNKIES	GELDPERMGS	GIQYGDAALR
QLRSPRRAQA	PNAQECGC

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт, транспорт білків. Білок має сайт для зв'язування з нуклеотидами, ГТФ. Локалізований у цитоплазмі, мембрані.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
de Renzis S., Soennichsen B., Zerial M. (2002). Divalent Rab effectors regulate the sub-compartmental organization and sorting of early endosomes. Nat. Cell Biol. 4: 124—133. PMID 11788822 doi:10.1038/ncb744
Lindsay A.J., McCaffrey M.W. (2004). Characterisation of the Rab binding properties of Rab coupling protein (RCP) by site-directed mutagenesis. FEBS Lett. 571: 86—92. PMID 15280022 doi:10.1016/j.febslet.2004.06.068
Huber S.K., Scheidig A.J. (2005). High resolution crystal structures of human Rab4a in its active and inactive conformations. FEBS Lett. 579: 2821—2829. PMID 15907487 doi:10.1016/j.febslet.2005.04.020
Eathiraj S., Pan X., Ritacco C., Lambright D.G. (2005). Structural basis of family-wide Rab GTPase recognition by rabenosyn-5. Nature. 436: 415—419. PMID 16034420 doi:10.1038/nature03798
Zahraoui A., Touchot N., Chardin P., Tavitian A. (1989). The human Rab genes encode a family of GTP-binding proteins related to yeast YPT1 and SEC4 products involved in secretion. J. Biol. Chem. 264: 12394—12401. PMID 2501306

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9781 (англ.) . Процитовано 25 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, P20338 (англ.) . Архів оригіналу за 2 липня 2017. Процитовано 25 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 1

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9781 (англ.) . Процитовано 25 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-4] UniProt, P20338 (англ.) . Архів оригіналу за 2 липня 2017. Процитовано 25 серпня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]