RAB7A

RAB7A
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1T91, 1YHN, 3LAW
Ідентифікатори
Символи	RAB7A, PRO2706, RAB7, member RAS oncogene family, CMT2B
Зовнішні ІД	OMIM: 602298 MGI: 105068 HomoloGene: 3408 GeneCards: RAB7A
Пов'язані генетичні захворювання
Charcot-Marie-Tooth disease type 2B[1]
Реагує на сполуку
Viroporin 3a[2]
Онтологія гена Молекулярна функція • nucleotide binding • GTP binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • retromer complex binding • GO:0006184 GTPase activity • GDP binding Клітинна компонента • цитоплазма • phagophore assembly site membrane • ендосома • phagocytic vesicle membrane • комплекс Ґольджі • late endosome • мембрана • late endosome membrane • extrinsic component of lysosome membrane • lipid droplet • melanosome membrane • retromer complex • lysosomal membrane • autophagosome membrane • phagocytic vesicle • лізосома • екзосома • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • гіалоплазма • клітинна мембрана • endosome membrane • secretory granule membrane • terminal bouton • alveolar lamellar body • vacuolar membrane • внутрішньоклітинний Біологічний процес • protein to membrane docking • protein targeting to lysosome • lipophagy • viral release from host cell • GO:1903364 positive regulation of protein catabolic process • phagosome-lysosome fusion • ендоцитоз • antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class II • lipid metabolism • endosome to lysosome transport • phagosome acidification • автофагія • lipid catabolic process • phagosome maturation • early endosome to late endosome transport • retrograde transport, endosome to Golgi • protein transport • positive regulation of exosomal secretion • epidermal growth factor catabolic process • positive regulation of viral process • neutrophil degranulation • negative regulation of exosomal secretion • negative regulation of intralumenal vesicle formation • autophagosome assembly • кісткова резорбція • GO:0015915 транспорт • intracellular protein transport • Rab protein signal transduction • small GTPase mediated signal transduction Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	7879	19349
Ensembl	ENSG00000075785	ENSMUSG00000079477
UniProt	P51149	P51150
RefSeq (мРНК)	NM_004637	NM_001293652 NM_001293653 NM_001293654 NM_001293655 NM_009005
RefSeq (білок)	NP_004628	NP_001280581 NP_001280582 NP_001280583 NP_001280584 NP_033031
Локус (UCSC)	Хр. 3: 128.69 – 128.83 Mb	Хр. 6: 87.98 – 88.02 Mb
PubMed search	[3]	[4]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

RAB7A (англ. RAB7A, member RAS oncogene family) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. ^[5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 207 амінокислот, а молекулярна маса — 23 490^[6].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MTSRKKVLLK		VIILGDSGVG		KTSLMNQYVN		KKFSNQYKAT		IGADFLTKEV
MVDDRLVTMQ		IWDTAGQERF		QSLGVAFYRG		ADCCVLVFDV		TAPNTFKTLD
SWRDEFLIQA		SPRDPENFPF		VVLGNKIDLE		NRQVATKRAQ		AWCYSKNNIP
YFETSAKEAI		NVEQAFQTIA		RNALKQETEV		ELYNEFPEPI		KLDKNDRAKA
SAESCSC

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах як метаболізм ліпідів, транспорт, транспорт білків, деградація ліпідів, автофагія. Білок має сайт для зв'язування з нуклеотидами, ГТФ. Локалізований у мембрані, цитоплазматичних везикулах, лізосомі, ліпідних краплях, ендосомах.

Література

• Vitelli R., Chiariello M., Lattero D., Bruni C.B., Bucci C. (1996). Molecular cloning and expression analysis of the human Rab7 GTP-ase complementary deoxyribonucleic acid. Biochem. Biophys. Res. Commun. 229: 887—890. PMID 8954989 DOI:10.1006/bbrc.1996.1897
• Davies J.P., Cotter P.D., Ioannou Y.A. (1997). Cloning and mapping of human Rab7 and Rab9 cDNA sequences and identification of a Rab9 pseudogene. Genomics. 41: 131—134. PMID 9126495 DOI:10.1006/geno.1997.4644
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Cantalupo G., Alifano P., Roberti V., Bruni C.B., Bucci C. (2001). Rab-interacting lysosomal protein (RILP): the Rab7 effector required for transport to lysosomes. EMBO J. 20: 683—693. PMID 11179213 DOI:10.1093/emboj/20.4.683
• Harrison R.E., Bucci C., Vieira O.V., Schroer T.A., Grinstein S. (2003). Phagosomes fuse with late endosomes and/or lysosomes by extension of membrane protrusions along microtubules: role of Rab7 and RILP. Mol. Cell. Biol. 23: 6494—6506. PMID 12944476 DOI:10.1128/MCB.23.18.6494-6506.2003
• Stein M.P., Feng Y., Cooper K.L., Welford A.M., Wandinger-Ness A. (2003). Human VPS34 and p150 are Rab7 interacting partners. Traffic. 4: 754—771. PMID 14617358 DOI:10.1034/j.1600-0854.2003.00133.x

Примітки

1. Захворювання, генетично пов'язані з RAB7A переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
2. Сполуки, які фізично взаємодіють з RAB7A, member RAS oncogene family переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
3. Human PubMed Reference:.
4. Mouse PubMed Reference:.
5. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9788 (англ.) . Архів оригіналу за 14 жовтня 2017. Процитовано 6 лютого 2017.
6. UniProt, P51149 (англ.) . Архів оригіналу за 1 січня 2017. Процитовано 6 лютого 2017.

Див. також

• Хромосома 3

Портал «Біологія»   Портал «Хімія»