RAD23B

RAD23B
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1P1A, 1PVE, 1UEL
Ідентифікатори
Символи	RAD23B, HHR23B, HR23B, P58, RAD23 homolog B, nucleotide excision repair protein
Зовнішні ІД	OMIM: 600062 MGI: 105128 HomoloGene: 37704 GeneCards: RAD23B
Онтологія гена
Молекулярна функція	• single-stranded DNA binding; • damaged DNA binding; • polyubiquitin modification-dependent protein binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • ubiquitin binding; • proteasome binding;
Клітинна компонента	• XPC complex; • Протеасома; • клітинне ядро; • нуклеоплазма; • цитоплазма; • гіалоплазма;
Біологічний процес	• cellular response to DNA damage stimulus; • nucleotide-excision repair; • global genome nucleotide-excision repair; • nucleotide-excision repair, DNA damage recognition; • Сперматогенез; • embryonic organ development; • proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process; • regulation of proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process; • GO:0100026 Репарація ДНК; • nucleotide-excision repair, preincision complex assembly; • згортання білків; • protein deubiquitination; • cellular response to interleukin-7; • nucleotide-excision repair, DNA duplex unwinding;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	5887
	19359
	ENSG00000119318
	ENSMUSG00000028426
	P54727; Q5W0S4
	P54728
	NM_002874; NM_001244713; NM_001244724
	NM_009011
	NP_001231642; NP_001231653; NP_002865
	NP_033037
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

RAD23B (англ. RAD23 homolog B, nucleotide excision repair protein) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 409 амінокислот, а молекулярна маса — 43 171^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MQVTLKTLQQ	QTFKIDIDPE	ETVKALKEKI	ESEKGKDAFP	VAGQKLIYAG
KILNDDTALK	EYKIDEKNFV	VVMVTKPKAV	STPAPATTQQ	SAPASTTAVT
SSTTTTVAQA	PTPVPALAPT	STPASITPAS	ATASSEPAPA	SAAKQEKPAE
KPAETPVATS	PTATDSTSGD	SSRSNLFEDA	TSALVTGQSY	ENMVTEIMSM
GYEREQVIAA	LRASFNNPDR	AVEYLLMGIP	GDRESQAVVD	PPQAASTGAP
QSSAVAAAAA	TTTATTTTTS	SGGHPLEFLR	NQPQFQQMRQ	IIQQNPSLLP
ALLQQIGREN	PQLLQQISQH	QEHFIQMLNE	PVQEAGGQGG	GGGGGSGGIA
EAGSGHMNYI	QVTPQEKEAI	ERLKALGFPE	GLVIQAYFAC	EKNENLAANF
LLQQNFDED

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як пошкодження ДНК, репарація ДНК, убіквітинування білків, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Wang G., Sawai N., Kotliarova S., Kanazawa I., Nukina N. (2000). Ataxin-3, the MJD1 gene product, interacts with the two human homologs of yeast DNA repair protein RAD23, HHR23A and HHR23B. Hum. Mol. Genet. 9: 1795—1803. PMID 10915768 DOI:10.1093/hmg/9.12.1795
Batty D., Rapic'-Otrin V., Levine A.S., Wood R.D. (2000). Stable binding of human XPC complex to irradiated DNA confers strong discrimination for damaged sites. J. Mol. Biol. 300: 275—290. PMID 10873465 DOI:10.1006/jmbi.2000.3857
Sugasawa K., Shimizu Y., Iwai S., Hanaoka F. (2002). A molecular mechanism for DNA damage recognition by the xeroderma pigmentosum group C protein complex. DNA Repair. 1: 95—107. PMID 12509299 DOI:10.1016/S1568-7864(01)00008-8
Katiyar S., Li G., Lennarz W.J. (2004). A complex between peptide:N-glycanase and two proteasome-linked proteins suggests a mechanism for the degradation of misfolded glycoproteins. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 101: 13774—13779. PMID 15358861 DOI:10.1073/pnas.0405663101
Katiyar S., Lennarz W.J. (2005). Studies on the intracellular localization of hHR23B. Biochem. Biophys. Res. Commun. 337: 1296—1300. PMID 16253613 DOI:10.1016/j.bbrc.2005.09.192

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9813 (англ.) . Архів оригіналу за 14 жовтня 2017. Процитовано 7 вересня 2017. [Архівовано 2017-10-14 у Wayback Machine.]
↑ UniProt, P54727 (англ.) . Архів оригіналу за 7 серпня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 9

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9813 (англ.) . Архів оригіналу за 14 жовтня 2017. Процитовано 7 вересня 2017. [Архівовано 2017-10-14 у Wayback Machine.]

[UniProt-4] UniProt, P54727 (англ.) . Архів оригіналу за 7 серпня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]