RBX1

RBX1
Наявні структури PDB Пошук для людей: PDBe RCSB Список кодів PDB 1LDJ, 1LDK, 1U6G, 2HYE, 2LGV, 3DPL, 3DQV, 3RTR, 4F52, 4P5O
Ідентифікатори
Символи	RBX1, BA554C12.1, RNF75, ROC1, ring-box 1
Зовнішні ІД	OMIM: 603814 MGI: 3710517 HomoloGene: 6872 GeneCards: RBX1
Реагує на сполуку
Viroporin 3a, талідомід[1]
Онтологія гена Молекулярна функція • cullin family protein binding • GO:1904264, GO:1904822, GO:0090622, GO:0090302 ubiquitin protein ligase activity • zinc ion binding • зв'язування з іоном металу • ubiquitin-ubiquitin ligase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • ubiquitin protein ligase binding • GO:0050372 ubiquitin-protein transferase activity • NEDD8 transferase activity • transcription factor binding • transferase activity • GO:0032403 protein-containing complex binding Клітинна компонента • цитоплазма • cullin-RING ubiquitin ligase complex • гіалоплазма • SCF ubiquitin ligase complex • VCB complex • Cul2-RING ubiquitin ligase complex • Cul3-RING ubiquitin ligase complex • Cul5-RING ubiquitin ligase complex • Cul7-RING ubiquitin ligase complex • Cul4A-RING E3 ubiquitin ligase complex • Cul4B-RING E3 ubiquitin ligase complex • клітинне ядро • нуклеоплазма • nuclear SCF ubiquitin ligase complex • Cul4-RING E3 ubiquitin ligase complex Біологічний процес • nucleotide-excision repair, DNA damage recognition • protein monoubiquitination • MAPK cascade • cellular response to DNA damage stimulus • protein neddylation • global genome nucleotide-excision repair • GO:0044257 protein catabolic process • regulation of transcription from RNA polymerase II promoter in response to hypoxia • transcription-coupled nucleotide-excision repair • nucleotide-excision repair, DNA incision • negative regulation of canonical Wnt signaling pathway • nucleotide-excision repair, preincision complex stabilization • GO:0100026 Репарація ДНК • GO:0022415 viral process • protein polyubiquitination • nucleotide-excision repair, preincision complex assembly • nucleotide-excision repair, DNA incision, 5'-to lesion • Wnt signaling pathway • SCF complex assembly • negative regulation of G2/M transition of mitotic cell cycle • посттрансляційна модифікація • positive regulation of proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process • interleukin-1-mediated signaling pathway • Убіквітин-залежний протеоліз • SCF-dependent proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process • proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process • ubiquitin-dependent protein catabolic process • nucleotide-excision repair, DNA duplex unwinding • nucleotide-excision repair, DNA incision, 3'-to lesion Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	9978	100043674
Ensembl	ENSG00000100387	н/д
UniProt	P62877	н/д
RefSeq (мРНК)	NM_014248	XM_006525232 XM_006536722 XM_006537452
RefSeq (білок)	NP_055063	н/д
Локус (UCSC)	Хр. 22: 40.95 – 40.97 Mb	н/д
PubMed search	[2]	[3]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

RBX1 (англ. Ring-box 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 22-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 108 амінокислот, а молекулярна маса — 12 274^[5].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAAAMDVDTP		SGTNSGAGKK		RFEVKKWNAV		ALWAWDIVVD		NCAICRNHIM
DLCIECQANQ		ASATSEECTV		AWGVCNHAFH		FHCISRWLKT		RQVCPLDNRE
WEFQKYGH

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до лігаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як взаємодія хазяїн-вірус, пошкодження ДНК, репарація ДНК, убіквітинування білків, ацетилювання. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• Ohta T., Michel J.J., Schottelius A.J., Xiong Y. (1999). ROC1, a homolog of APC11, represents a family of cullin partners with an associated ubiquitin ligase activity. Mol. Cell. 3: 535—541. PMID 10230407 doi:10.1016/S1097-2765(00)80482-7
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
• Kamura T., Conrad M.N., Yan Q., Conaway R.C., Conaway J.W. (1999). The Rbx1 subunit of SCF and VHL E3 ubiquitin ligase activates Rub1 modification of cullins Cdc53 and Cul2. Genes Dev. 13: 2928—2933. PMID 10579999 doi:10.1101/gad.13.22.2928
• Furukawa M., Zhang Y., McCarville J., Ohta T., Xiong Y. (2000). The CUL1 C-terminal sequence and ROC1 are required for efficient nuclear accumulation, NEDD8 modification, and ubiquitin ligase activity of CUL1. Mol. Cell. Biol. 20: 8185—8197. PMID 11027288 doi:10.1128/MCB.20.21.8185-8197.2000
• Dias D.C., Dolios G., Wang R., Pan Z.Q. (2002). CUL7: a DOC domain-containing cullin selectively binds Skp1.Fbx29 to form an SCF-like complex. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 99: 16601—16606. PMID 12481031 doi:10.1073/pnas.252646399
• Bhoumik A., Singha N., O'Connell M.J., Ronai Z.A. (2008). Regulation of TIP60 by ATF2 modulates ATM activation. J. Biol. Chem. 283: 17605—17614. PMID 18397884 doi:10.1074/jbc.M802030200

Примітки

1. Сполуки, які фізично взаємодіють з Ring-box 1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
2. Human PubMed Reference:.
3. Mouse PubMed Reference:.
4. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9928 (англ.) . Архів оригіналу за 19 вересня 2015. Процитовано 12 вересня 2017. [Архівовано 2015-09-19 у Wayback Machine.]
5. UniProt, P62877 (англ.) . Архів оригіналу за 7 серпня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

• Хромосома 22

Портал «Біологія»   Портал «Хімія»