RFWD2

RFWD2
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 5IGQ, 5HQG
Ідентифікатори
Символи	COP1, RNF200, ring finger and WD repeat domain 2, E3 ubiquitin ligase, RFWD2, COP1 E3 ubiquitin ligase, FAP78, CFAP78
Зовнішні ІД	OMIM: 608067 MGI: 1347046 HomoloGene: 115565 GeneCards: COP1
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу • GO:0050372 ubiquitin-protein transferase activity • transferase activity • GO:1904264, GO:1904822, GO:0090622, GO:0090302 ubiquitin protein ligase activity • zinc ion binding Клітинна компонента • nuclear speck • гіалоплазма • Golgi membrane • клітинне ядро • цитоплазма • нуклеоплазма • Cul4A-RING E3 ubiquitin ligase complex • центросома • focal adhesion Біологічний процес • Убіквітин-залежний протеоліз • response to ionizing radiation • positive regulation of proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process • посттрансляційна модифікація • proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	64326	26374
Ensembl	ENSG00000143207	ENSMUSG00000040782
UniProt	Q8NHY2	Q9R1A8
RefSeq (мРНК)	NM_001001740 NM_001286644 NM_022457	NM_011931 NM_001360878
RefSeq (білок)	NP_001001740 NP_001273573 NP_071902	NP_036061 NP_001347807
Локус (UCSC)	Хр. 1: 175.94 – 176.21 Mb	Хр. 1: 159.06 – 159.18 Mb
PubMed search	[1]	[2]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

RFWD2 (англ. Ring finger and WD repeat domain 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 731 амінокислот, а молекулярна маса — 80 474^[4].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSGSRQAGSG		SAGTSPGSSA		ASSVTSASSS		LSSSPSPPSV		AVSAAALVSG
GVAQAAGSGG		LGGPVRPVLV		APAVSGSGGG		AVSTGLSRHS		CAARPSAGVG
GSSSSLGSGS		RKRPLLAPLC		NGLINSYEDK		SNDFVCPICF		DMIEEAYMTK
CGHSFCYKCI		HQSLEDNNRC		PKCNYVVDNI		DHLYPNFLVN		ELILKQKQRF
EEKRFKLDHS		VSSTNGHRWQ		IFQDWLGTDQ		DNLDLANVNL		MLELLVQKKK
QLEAESHAAQ		LQILMEFLKV		ARRNKREQLE		QIQKELSVLE		EDIKRVEEMS
GLYSPVSEDS		TVPQFEAPSP		SHSSIIDSTE		YSQPPGFSGS		SQTKKQPWYN
STLASRRKRL		TAHFEDLEQC		YFSTRMSRIS		DDSRTASQLD		EFQECLSKFT
RYNSVRPLAT		LSYASDLYNG		SSIVSSIEFD		RDCDYFAIAG		VTKKIKVYEY
DTVIQDAVDI		HYPENEMTCN		SKISCISWSS		YHKNLLASSD		YEGTVILWDG
FTGQRSKVYQ		EHEKRCWSVD		FNLMDPKLLA		SGSDDAKVKL		WSTNLDNSVA
SIEAKANVCC		VKFSPSSRYH		LAFGCADHCV		HYYDLRNTKQ		PIMVFKGHRK
AVSYAKFVSG		EEIVSASTDS		QLKLWNVGKP		YCLRSFKGHI		NEKNFVGLAS
NGDYIACGSE		NNSLYLYYKG		LSKTLLTFKF		DTVKSVLDKD		RKEDDTNEFV
SAVCWRALPD		GESNVLIAAN		SQGTIKVLEL		V

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до трансфераз. Задіяний у таких біологічних процесах як убіквітинування білків, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• Yi C., Wang H., Wei N., Deng X.-W. (2002). An initial biochemical and cell biological characterization of the mammalian homologue of a central plant developmental switch, COP1. BMC Cell Biol. 3: 30—30. PMID 12466024 doi:10.1186/1471-2121-3-30
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504

Примітки

1. Human PubMed Reference:.
2. Mouse PubMed Reference:.
3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:17440 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.
4. UniProt, Q8NHY2 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.

Див. також

• Хромосома 1

Портал «Біологія»   Портал «Хімія»